pywsi package

Subpackages

• pywsi.io package
  • Module contents
• pywsi.misc package
  • Submodules
  • pywsi.misc.xmltojson module
  • Module contents
• pywsi.morphology package
  • Module contents
• pywsi.normalization package
  • Submodules
  • pywsi.normalization.macenko module
  • pywsi.normalization.reinhard module
  • Module contents
• pywsi.segmentation package
  • Submodules
  • pywsi.segmentation.binary_segmentation module
  • pywsi.segmentation.diff_gaussian module
  • pywsi.segmentation.fractal_dimension module
  • pywsi.segmentation.graph_cut module
  • pywsi.segmentation.helpers module
  • pywsi.segmentation.max_clustering module
  • Module contents
• pywsi.stats package
  • Module contents

Submodules

pywsi.cli module

Console script for pywsi.

pywsi.cli.process_segmentation(data)

Parameters:

data: tuple

(png_location, tsv_outpath)

pywsi.cli.process_wsi(data)

Module contents

Top-level package for pywsi.