This notebook demonstrates how to search for all Parse Bioscience single-cell sequencing datasets in the Gene Expression Omnibus (GEO) database.
Parse Biosciences provides single-cell RNA sequencing technology using a combinatorial barcoding approach. This example shows how to find all Parse Bioscience datasets published from January 1, 2020 to the present day.
Parse BioScience Search¶
This notebook demonstrates how to parse and analyze search results from BioScience datasets.
[1]:
# Install pysradb if not already installed
try:
import pysradb
print(f"pysradb {pysradb.__version__} is already installed")
except ImportError:
print("Installing pysradb from GitHub...")
import sys
!{sys.executable} -m pip install -q git+https://github.com/saketkc/pysradb
print("pysradb installed successfully!")
pysradb 3.0.0.dev0 is already installed
/home/runner/work/pysradb/pysradb/pysradb/download.py:15: TqdmExperimentalWarning: Using `tqdm.autonotebook.tqdm` in notebook mode. Use `tqdm.tqdm` instead to force console mode (e.g. in jupyter console)
from tqdm.autonotebook import tqdm
Setup¶
First, let’s import the necessary modules and set up our search parameters:
[2]:
from datetime import datetime
import pandas as pd
from pysradb.search import GeoSearch
# Set pandas display options for better readability
pd.set_option("display.max_columns", None)
pd.set_option("display.max_colwidth", 100)
Search for Parse Bioscience Datasets¶
We’ll search GEO for all datasets that mention “Parse Bioscience”.
Note: The GEO search date filtering can be restrictive and may miss some results. We’ll search without date constraints first, then you can filter the results by date manually if needed.
[3]:
# Search for Parse Bioscience datasets
# Note: Date filtering with GeoSearch can be restrictive and may miss results
# We'll first search without date filter, then filter results manually if needed
print("Searching for Parse Bioscience datasets...")
print("This may take a few minutes...\n")
# Create search instance
# We use verbosity=3 to get all available metadata
# Starting without date filter to ensure we capture all datasets
instance = GeoSearch(
verbosity=3,
return_max=500, # Adjust if needed
geo_query="Parse Biosciences OR Evercode",
)
# Execute the search
instance.search()
# Get results as DataFrame
df = instance.get_df()
print(f"\nFound {len(df)} total entries matching the search criteria")
# Optional: Filter by date manually if needed
# Uncomment the following to filter by publication date
# if not df.empty and 'run_1_published' in df.columns:
# df['pub_date'] = pd.to_datetime(df['run_1_published'], errors='coerce')
# df = df[df['pub_date'] >= '2020-01-01']
# print(f"After date filtering (>=2020-01-01): {len(df)} entries")
Searching for Parse Bioscience datasets...
This may take a few minutes...
Found 500 total entries matching the search criteria
[4]:
df
[4]:
| study_accession | experiment_accession | experiment_title | sample_taxon_id | sample_scientific_name | experiment_library_strategy | experiment_library_source | experiment_library_selection | sample_accession | sample_alias | experiment_instrument_model | pool_member_spots | run_1_size | run_1_accession | run_1_total_spots | run_1_total_bases | experiment_alias | experiment_external_id | experiment_external_id_1 | experiment_external_id_1_namespace | experiment_library_construction_protocol | experiment_library_name | experiment_platform | experiment_sample_descriptor_accession | library_layout | pool_external_id | pool_member_accession | pool_member_bases | pool_member_member_name | pool_member_organism | pool_member_sample_name | pool_member_sample_title | pool_member_tax_id | run_10_accession | run_10_alias | run_10_base_A_count | run_10_base_C_count | run_10_base_G_count | run_10_base_N_count | run_10_base_T_count | run_10_cloudfile_1_filetype | run_10_cloudfile_1_location | run_10_cloudfile_1_provider | run_10_cloudfile_2_filetype | run_10_cloudfile_2_location | run_10_cloudfile_2_provider | run_10_cloudfile_3_filetype | run_10_cloudfile_3_location | run_10_cloudfile_3_provider | run_10_cloudfile_4_filetype | run_10_cloudfile_4_location | run_10_cloudfile_4_provider | run_10_cluster_name | run_10_database_1 | run_10_has_taxanalysis | run_10_is_public | run_10_load_done | run_10_published | run_10_size | run_10_srafile_1_alternative_1_access_type | run_10_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_10_srafile_1_alternative_1_org | run_10_srafile_1_alternative_1_url | run_10_srafile_1_cluster | run_10_srafile_1_date | run_10_srafile_1_filename | run_10_srafile_1_md5 | run_10_srafile_1_semantic_name | run_10_srafile_1_size | run_10_srafile_1_sratoolkit | run_10_srafile_1_supertype | run_10_srafile_1_version | run_10_srafile_2_alternative_1_access_type | run_10_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_10_srafile_2_alternative_1_org | run_10_srafile_2_alternative_1_url | run_10_srafile_2_cluster | run_10_srafile_2_date | run_10_srafile_2_filename | run_10_srafile_2_md5 | run_10_srafile_2_semantic_name | run_10_srafile_2_size | run_10_srafile_2_sratoolkit | run_10_srafile_2_supertype | run_10_srafile_2_url | run_10_srafile_2_version | run_10_srafile_3_alternative_1_access_type | run_10_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_10_srafile_3_alternative_1_org | run_10_srafile_3_alternative_1_url | run_10_srafile_3_alternative_2_access_type | run_10_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_10_srafile_3_alternative_2_org | run_10_srafile_3_alternative_2_url | run_10_srafile_3_alternative_3_access_type | run_10_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_10_srafile_3_alternative_3_org | run_10_srafile_3_alternative_3_url | run_10_srafile_3_cluster | run_10_srafile_3_date | run_10_srafile_3_filename | run_10_srafile_3_md5 | run_10_srafile_3_semantic_name | run_10_srafile_3_size | run_10_srafile_3_sratoolkit | run_10_srafile_3_supertype | run_10_srafile_3_url | run_10_srafile_3_version | run_10_srafile_4_alternative_1_access_type | run_10_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_10_srafile_4_alternative_1_org | run_10_srafile_4_alternative_1_url | run_10_srafile_4_alternative_2_access_type | run_10_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_10_srafile_4_alternative_2_org | run_10_srafile_4_alternative_2_url | run_10_srafile_4_alternative_3_access_type | run_10_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_10_srafile_4_alternative_3_org | run_10_srafile_4_alternative_3_url | run_10_srafile_4_cluster | run_10_srafile_4_date | run_10_srafile_4_filename | run_10_srafile_4_md5 | run_10_srafile_4_semantic_name | run_10_srafile_4_size | run_10_srafile_4_sratoolkit | run_10_srafile_4_supertype | run_10_srafile_4_url | run_10_srafile_4_version | run_10_static_data_available | run_10_total_base_count | run_10_total_base_cs_native | run_10_total_bases | run_10_total_spots | run_11_accession | run_11_alias | run_11_base_A_count | run_11_base_C_count | run_11_base_G_count | run_11_base_N_count | run_11_base_T_count | run_11_cloudfile_1_filetype | run_11_cloudfile_1_location | run_11_cloudfile_1_provider | run_11_cloudfile_2_filetype | run_11_cloudfile_2_location | run_11_cloudfile_2_provider | run_11_cloudfile_3_filetype | run_11_cloudfile_3_location | run_11_cloudfile_3_provider | run_11_cloudfile_4_filetype | run_11_cloudfile_4_location | run_11_cloudfile_4_provider | run_11_cluster_name | run_11_database_1 | run_11_has_taxanalysis | run_11_is_public | run_11_load_done | run_11_published | run_11_size | run_11_srafile_1_alternative_1_access_type | run_11_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_11_srafile_1_alternative_1_org | run_11_srafile_1_alternative_1_url | run_11_srafile_1_cluster | run_11_srafile_1_date | run_11_srafile_1_filename | run_11_srafile_1_md5 | run_11_srafile_1_semantic_name | run_11_srafile_1_size | run_11_srafile_1_sratoolkit | run_11_srafile_1_supertype | run_11_srafile_1_version | run_11_srafile_2_alternative_1_access_type | run_11_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_11_srafile_2_alternative_1_org | run_11_srafile_2_alternative_1_url | run_11_srafile_2_cluster | run_11_srafile_2_date | run_11_srafile_2_filename | run_11_srafile_2_md5 | run_11_srafile_2_semantic_name | run_11_srafile_2_size | run_11_srafile_2_sratoolkit | run_11_srafile_2_supertype | run_11_srafile_2_url | run_11_srafile_2_version | run_11_srafile_3_alternative_1_access_type | run_11_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_11_srafile_3_alternative_1_org | run_11_srafile_3_alternative_1_url | run_11_srafile_3_alternative_2_access_type | run_11_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_11_srafile_3_alternative_2_org | run_11_srafile_3_alternative_2_url | run_11_srafile_3_alternative_3_access_type | run_11_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_11_srafile_3_alternative_3_org | run_11_srafile_3_alternative_3_url | run_11_srafile_3_cluster | run_11_srafile_3_date | run_11_srafile_3_filename | run_11_srafile_3_md5 | run_11_srafile_3_semantic_name | run_11_srafile_3_size | run_11_srafile_3_sratoolkit | run_11_srafile_3_supertype | run_11_srafile_3_url | run_11_srafile_3_version | run_11_srafile_4_alternative_1_access_type | run_11_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_11_srafile_4_alternative_1_org | run_11_srafile_4_alternative_1_url | run_11_srafile_4_alternative_2_access_type | run_11_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_11_srafile_4_alternative_2_org | run_11_srafile_4_alternative_2_url | run_11_srafile_4_alternative_3_access_type | run_11_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_11_srafile_4_alternative_3_org | run_11_srafile_4_alternative_3_url | run_11_srafile_4_cluster | run_11_srafile_4_date | run_11_srafile_4_filename | run_11_srafile_4_md5 | run_11_srafile_4_semantic_name | run_11_srafile_4_size | run_11_srafile_4_sratoolkit | run_11_srafile_4_supertype | run_11_srafile_4_url | run_11_srafile_4_version | run_11_static_data_available | run_11_total_base_count | run_11_total_base_cs_native | run_11_total_bases | run_11_total_spots | run_12_accession | run_12_alias | run_12_base_A_count | run_12_base_C_count | run_12_base_G_count | run_12_base_N_count | run_12_base_T_count | run_12_cloudfile_1_filetype | run_12_cloudfile_1_location | run_12_cloudfile_1_provider | run_12_cloudfile_2_filetype | run_12_cloudfile_2_location | run_12_cloudfile_2_provider | run_12_cloudfile_3_filetype | run_12_cloudfile_3_location | run_12_cloudfile_3_provider | run_12_cloudfile_4_filetype | run_12_cloudfile_4_location | run_12_cloudfile_4_provider | run_12_cluster_name | run_12_database_1 | run_12_has_taxanalysis | run_12_is_public | run_12_load_done | run_12_published | run_12_size | run_12_srafile_1_alternative_1_access_type | run_12_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_12_srafile_1_alternative_1_org | run_12_srafile_1_alternative_1_url | run_12_srafile_1_cluster | run_12_srafile_1_date | run_12_srafile_1_filename | run_12_srafile_1_md5 | run_12_srafile_1_semantic_name | run_12_srafile_1_size | run_12_srafile_1_sratoolkit | run_12_srafile_1_supertype | run_12_srafile_1_version | run_12_srafile_2_alternative_1_access_type | run_12_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_12_srafile_2_alternative_1_org | run_12_srafile_2_alternative_1_url | run_12_srafile_2_cluster | run_12_srafile_2_date | run_12_srafile_2_filename | run_12_srafile_2_md5 | run_12_srafile_2_semantic_name | run_12_srafile_2_size | run_12_srafile_2_sratoolkit | run_12_srafile_2_supertype | run_12_srafile_2_url | run_12_srafile_2_version | run_12_srafile_3_alternative_1_access_type | run_12_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_12_srafile_3_alternative_1_org | run_12_srafile_3_alternative_1_url | run_12_srafile_3_alternative_2_access_type | run_12_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_12_srafile_3_alternative_2_org | run_12_srafile_3_alternative_2_url | run_12_srafile_3_alternative_3_access_type | run_12_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_12_srafile_3_alternative_3_org | run_12_srafile_3_alternative_3_url | run_12_srafile_3_cluster | run_12_srafile_3_date | run_12_srafile_3_filename | run_12_srafile_3_md5 | run_12_srafile_3_semantic_name | run_12_srafile_3_size | run_12_srafile_3_sratoolkit | run_12_srafile_3_supertype | run_12_srafile_3_url | run_12_srafile_3_version | run_12_srafile_4_alternative_1_access_type | run_12_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_12_srafile_4_alternative_1_org | run_12_srafile_4_alternative_1_url | run_12_srafile_4_alternative_2_access_type | run_12_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_12_srafile_4_alternative_2_org | run_12_srafile_4_alternative_2_url | run_12_srafile_4_alternative_3_access_type | run_12_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_12_srafile_4_alternative_3_org | run_12_srafile_4_alternative_3_url | run_12_srafile_4_cluster | run_12_srafile_4_date | run_12_srafile_4_filename | run_12_srafile_4_md5 | run_12_srafile_4_semantic_name | run_12_srafile_4_size | run_12_srafile_4_sratoolkit | run_12_srafile_4_supertype | run_12_srafile_4_url | run_12_srafile_4_version | run_12_static_data_available | run_12_total_base_count | run_12_total_base_cs_native | run_12_total_bases | run_12_total_spots | run_13_accession | run_13_alias | run_13_base_A_count | run_13_base_C_count | run_13_base_G_count | run_13_base_N_count | run_13_base_T_count | run_13_cloudfile_1_filetype | run_13_cloudfile_1_location | run_13_cloudfile_1_provider | run_13_cloudfile_2_filetype | run_13_cloudfile_2_location | run_13_cloudfile_2_provider | run_13_cloudfile_3_filetype | run_13_cloudfile_3_location | run_13_cloudfile_3_provider | run_13_cloudfile_4_filetype | run_13_cloudfile_4_location | run_13_cloudfile_4_provider | run_13_cluster_name | run_13_database_1 | run_13_has_taxanalysis | run_13_is_public | run_13_load_done | run_13_published | run_13_size | run_13_srafile_1_alternative_1_access_type | run_13_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_13_srafile_1_alternative_1_org | run_13_srafile_1_alternative_1_url | run_13_srafile_1_cluster | run_13_srafile_1_date | run_13_srafile_1_filename | run_13_srafile_1_md5 | run_13_srafile_1_semantic_name | run_13_srafile_1_size | run_13_srafile_1_sratoolkit | run_13_srafile_1_supertype | run_13_srafile_1_version | run_13_srafile_2_alternative_1_access_type | run_13_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_13_srafile_2_alternative_1_org | run_13_srafile_2_alternative_1_url | run_13_srafile_2_cluster | run_13_srafile_2_date | run_13_srafile_2_filename | run_13_srafile_2_md5 | run_13_srafile_2_semantic_name | run_13_srafile_2_size | run_13_srafile_2_sratoolkit | run_13_srafile_2_supertype | run_13_srafile_2_url | run_13_srafile_2_version | run_13_srafile_3_alternative_1_access_type | run_13_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_13_srafile_3_alternative_1_org | run_13_srafile_3_alternative_1_url | run_13_srafile_3_alternative_2_access_type | run_13_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_13_srafile_3_alternative_2_org | run_13_srafile_3_alternative_2_url | run_13_srafile_3_alternative_3_access_type | run_13_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_13_srafile_3_alternative_3_org | run_13_srafile_3_alternative_3_url | run_13_srafile_3_cluster | run_13_srafile_3_date | run_13_srafile_3_filename | run_13_srafile_3_md5 | run_13_srafile_3_semantic_name | run_13_srafile_3_size | run_13_srafile_3_sratoolkit | run_13_srafile_3_supertype | run_13_srafile_3_url | run_13_srafile_3_version | run_13_srafile_4_alternative_1_access_type | run_13_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_13_srafile_4_alternative_1_org | run_13_srafile_4_alternative_1_url | run_13_srafile_4_alternative_2_access_type | run_13_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_13_srafile_4_alternative_2_org | run_13_srafile_4_alternative_2_url | run_13_srafile_4_alternative_3_access_type | run_13_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_13_srafile_4_alternative_3_org | run_13_srafile_4_alternative_3_url | run_13_srafile_4_cluster | run_13_srafile_4_date | run_13_srafile_4_filename | run_13_srafile_4_md5 | run_13_srafile_4_semantic_name | run_13_srafile_4_size | run_13_srafile_4_sratoolkit | run_13_srafile_4_supertype | run_13_srafile_4_url | run_13_srafile_4_version | run_13_static_data_available | run_13_total_base_count | run_13_total_base_cs_native | run_13_total_bases | run_13_total_spots | run_14_accession | run_14_alias | run_14_base_A_count | run_14_base_C_count | run_14_base_G_count | run_14_base_N_count | run_14_base_T_count | run_14_cloudfile_1_filetype | run_14_cloudfile_1_location | run_14_cloudfile_1_provider | run_14_cloudfile_2_filetype | run_14_cloudfile_2_location | run_14_cloudfile_2_provider | run_14_cloudfile_3_filetype | run_14_cloudfile_3_location | run_14_cloudfile_3_provider | run_14_cloudfile_4_filetype | run_14_cloudfile_4_location | run_14_cloudfile_4_provider | run_14_cluster_name | run_14_database_1 | run_14_has_taxanalysis | run_14_is_public | run_14_load_done | run_14_published | run_14_size | run_14_srafile_1_alternative_1_access_type | run_14_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_14_srafile_1_alternative_1_org | run_14_srafile_1_alternative_1_url | run_14_srafile_1_cluster | run_14_srafile_1_date | run_14_srafile_1_filename | run_14_srafile_1_md5 | run_14_srafile_1_semantic_name | run_14_srafile_1_size | run_14_srafile_1_sratoolkit | run_14_srafile_1_supertype | run_14_srafile_1_version | run_14_srafile_2_alternative_1_access_type | run_14_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_14_srafile_2_alternative_1_org | run_14_srafile_2_alternative_1_url | run_14_srafile_2_cluster | run_14_srafile_2_date | run_14_srafile_2_filename | run_14_srafile_2_md5 | run_14_srafile_2_semantic_name | run_14_srafile_2_size | run_14_srafile_2_sratoolkit | run_14_srafile_2_supertype | run_14_srafile_2_url | run_14_srafile_2_version | run_14_srafile_3_alternative_1_access_type | run_14_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_14_srafile_3_alternative_1_org | run_14_srafile_3_alternative_1_url | run_14_srafile_3_alternative_2_access_type | run_14_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_14_srafile_3_alternative_2_org | run_14_srafile_3_alternative_2_url | run_14_srafile_3_alternative_3_access_type | run_14_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_14_srafile_3_alternative_3_org | run_14_srafile_3_alternative_3_url | run_14_srafile_3_cluster | run_14_srafile_3_date | run_14_srafile_3_filename | run_14_srafile_3_md5 | run_14_srafile_3_semantic_name | run_14_srafile_3_size | run_14_srafile_3_sratoolkit | run_14_srafile_3_supertype | run_14_srafile_3_url | run_14_srafile_3_version | run_14_srafile_4_alternative_1_access_type | run_14_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_14_srafile_4_alternative_1_org | run_14_srafile_4_alternative_1_url | run_14_srafile_4_alternative_2_access_type | run_14_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_14_srafile_4_alternative_2_org | run_14_srafile_4_alternative_2_url | run_14_srafile_4_alternative_3_access_type | run_14_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_14_srafile_4_alternative_3_org | run_14_srafile_4_alternative_3_url | run_14_srafile_4_cluster | run_14_srafile_4_date | run_14_srafile_4_filename | run_14_srafile_4_md5 | run_14_srafile_4_semantic_name | run_14_srafile_4_size | run_14_srafile_4_sratoolkit | run_14_srafile_4_supertype | run_14_srafile_4_url | run_14_srafile_4_version | run_14_static_data_available | run_14_total_base_count | run_14_total_base_cs_native | run_14_total_bases | run_14_total_spots | run_15_accession | run_15_alias | run_15_base_A_count | run_15_base_C_count | run_15_base_G_count | run_15_base_N_count | run_15_base_T_count | run_15_cloudfile_1_filetype | run_15_cloudfile_1_location | run_15_cloudfile_1_provider | run_15_cloudfile_2_filetype | run_15_cloudfile_2_location | run_15_cloudfile_2_provider | run_15_cloudfile_3_filetype | run_15_cloudfile_3_location | run_15_cloudfile_3_provider | run_15_cloudfile_4_filetype | run_15_cloudfile_4_location | run_15_cloudfile_4_provider | run_15_cluster_name | run_15_database_1 | run_15_has_taxanalysis | run_15_is_public | run_15_load_done | run_15_published | run_15_size | run_15_srafile_1_alternative_1_access_type | run_15_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_15_srafile_1_alternative_1_org | run_15_srafile_1_alternative_1_url | run_15_srafile_1_cluster | run_15_srafile_1_date | run_15_srafile_1_filename | run_15_srafile_1_md5 | run_15_srafile_1_semantic_name | run_15_srafile_1_size | run_15_srafile_1_sratoolkit | run_15_srafile_1_supertype | run_15_srafile_1_version | run_15_srafile_2_alternative_1_access_type | run_15_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_15_srafile_2_alternative_1_org | run_15_srafile_2_alternative_1_url | run_15_srafile_2_cluster | run_15_srafile_2_date | run_15_srafile_2_filename | run_15_srafile_2_md5 | run_15_srafile_2_semantic_name | run_15_srafile_2_size | run_15_srafile_2_sratoolkit | run_15_srafile_2_supertype | run_15_srafile_2_url | run_15_srafile_2_version | run_15_srafile_3_alternative_1_access_type | run_15_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_15_srafile_3_alternative_1_org | run_15_srafile_3_alternative_1_url | run_15_srafile_3_alternative_2_access_type | run_15_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_15_srafile_3_alternative_2_org | run_15_srafile_3_alternative_2_url | run_15_srafile_3_alternative_3_access_type | run_15_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_15_srafile_3_alternative_3_org | run_15_srafile_3_alternative_3_url | run_15_srafile_3_cluster | run_15_srafile_3_date | run_15_srafile_3_filename | run_15_srafile_3_md5 | run_15_srafile_3_semantic_name | run_15_srafile_3_size | run_15_srafile_3_sratoolkit | run_15_srafile_3_supertype | run_15_srafile_3_url | run_15_srafile_3_version | run_15_srafile_4_alternative_1_access_type | run_15_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_15_srafile_4_alternative_1_org | run_15_srafile_4_alternative_1_url | run_15_srafile_4_alternative_2_access_type | run_15_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_15_srafile_4_alternative_2_org | run_15_srafile_4_alternative_2_url | run_15_srafile_4_alternative_3_access_type | run_15_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_15_srafile_4_alternative_3_org | run_15_srafile_4_alternative_3_url | run_15_srafile_4_cluster | run_15_srafile_4_date | run_15_srafile_4_filename | run_15_srafile_4_md5 | run_15_srafile_4_semantic_name | run_15_srafile_4_size | run_15_srafile_4_sratoolkit | run_15_srafile_4_supertype | run_15_srafile_4_url | run_15_srafile_4_version | run_15_static_data_available | run_15_total_base_count | run_15_total_base_cs_native | run_15_total_bases | run_15_total_spots | run_16_accession | run_16_alias | run_16_base_A_count | run_16_base_C_count | run_16_base_G_count | run_16_base_N_count | run_16_base_T_count | run_16_cloudfile_1_filetype | run_16_cloudfile_1_location | run_16_cloudfile_1_provider | run_16_cloudfile_2_filetype | run_16_cloudfile_2_location | run_16_cloudfile_2_provider | run_16_cloudfile_3_filetype | run_16_cloudfile_3_location | run_16_cloudfile_3_provider | run_16_cloudfile_4_filetype | run_16_cloudfile_4_location | run_16_cloudfile_4_provider | run_16_cluster_name | run_16_database_1 | run_16_has_taxanalysis | run_16_is_public | run_16_load_done | run_16_published | run_16_size | run_16_srafile_1_alternative_1_access_type | run_16_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_16_srafile_1_alternative_1_org | run_16_srafile_1_alternative_1_url | run_16_srafile_1_cluster | run_16_srafile_1_date | run_16_srafile_1_filename | run_16_srafile_1_md5 | run_16_srafile_1_semantic_name | run_16_srafile_1_size | run_16_srafile_1_sratoolkit | run_16_srafile_1_supertype | run_16_srafile_1_version | run_16_srafile_2_alternative_1_access_type | run_16_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_16_srafile_2_alternative_1_org | run_16_srafile_2_alternative_1_url | run_16_srafile_2_cluster | run_16_srafile_2_date | run_16_srafile_2_filename | run_16_srafile_2_md5 | run_16_srafile_2_semantic_name | run_16_srafile_2_size | run_16_srafile_2_sratoolkit | run_16_srafile_2_supertype | run_16_srafile_2_url | run_16_srafile_2_version | run_16_srafile_3_alternative_1_access_type | run_16_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_16_srafile_3_alternative_1_org | run_16_srafile_3_alternative_1_url | run_16_srafile_3_alternative_2_access_type | run_16_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_16_srafile_3_alternative_2_org | run_16_srafile_3_alternative_2_url | run_16_srafile_3_alternative_3_access_type | run_16_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_16_srafile_3_alternative_3_org | run_16_srafile_3_alternative_3_url | run_16_srafile_3_cluster | run_16_srafile_3_date | run_16_srafile_3_filename | run_16_srafile_3_md5 | run_16_srafile_3_semantic_name | run_16_srafile_3_size | run_16_srafile_3_sratoolkit | run_16_srafile_3_supertype | run_16_srafile_3_url | run_16_srafile_3_version | run_16_srafile_4_alternative_1_access_type | run_16_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_16_srafile_4_alternative_1_org | run_16_srafile_4_alternative_1_url | run_16_srafile_4_alternative_2_access_type | run_16_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_16_srafile_4_alternative_2_org | run_16_srafile_4_alternative_2_url | run_16_srafile_4_alternative_3_access_type | run_16_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_16_srafile_4_alternative_3_org | run_16_srafile_4_alternative_3_url | run_16_srafile_4_cluster | run_16_srafile_4_date | run_16_srafile_4_filename | run_16_srafile_4_md5 | run_16_srafile_4_semantic_name | run_16_srafile_4_size | run_16_srafile_4_sratoolkit | run_16_srafile_4_supertype | run_16_srafile_4_url | run_16_srafile_4_version | run_16_static_data_available | run_16_total_base_count | run_16_total_base_cs_native | run_16_total_bases | run_16_total_spots | run_17_accession | run_17_alias | run_17_base_A_count | run_17_base_C_count | run_17_base_G_count | run_17_base_N_count | run_17_base_T_count | run_17_cloudfile_1_filetype | run_17_cloudfile_1_location | run_17_cloudfile_1_provider | run_17_cloudfile_2_filetype | run_17_cloudfile_2_location | run_17_cloudfile_2_provider | run_17_cloudfile_3_filetype | run_17_cloudfile_3_location | run_17_cloudfile_3_provider | run_17_cloudfile_4_filetype | run_17_cloudfile_4_location | run_17_cloudfile_4_provider | run_17_cluster_name | run_17_database_1 | run_17_has_taxanalysis | run_17_is_public | run_17_load_done | run_17_published | run_17_size | run_17_srafile_1_alternative_1_access_type | run_17_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_17_srafile_1_alternative_1_org | run_17_srafile_1_alternative_1_url | run_17_srafile_1_cluster | run_17_srafile_1_date | run_17_srafile_1_filename | run_17_srafile_1_md5 | run_17_srafile_1_semantic_name | run_17_srafile_1_size | run_17_srafile_1_sratoolkit | run_17_srafile_1_supertype | run_17_srafile_1_version | run_17_srafile_2_alternative_1_access_type | run_17_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_17_srafile_2_alternative_1_org | run_17_srafile_2_alternative_1_url | run_17_srafile_2_cluster | run_17_srafile_2_date | run_17_srafile_2_filename | run_17_srafile_2_md5 | run_17_srafile_2_semantic_name | run_17_srafile_2_size | run_17_srafile_2_sratoolkit | run_17_srafile_2_supertype | run_17_srafile_2_version | run_17_srafile_3_alternative_1_access_type | run_17_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_17_srafile_3_alternative_1_org | run_17_srafile_3_alternative_1_url | run_17_srafile_3_cluster | run_17_srafile_3_date | run_17_srafile_3_filename | run_17_srafile_3_md5 | run_17_srafile_3_semantic_name | run_17_srafile_3_size | run_17_srafile_3_sratoolkit | run_17_srafile_3_supertype | run_17_srafile_3_url | run_17_srafile_3_version | run_17_srafile_4_alternative_1_access_type | run_17_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_17_srafile_4_alternative_1_org | run_17_srafile_4_alternative_1_url | run_17_srafile_4_alternative_2_access_type | run_17_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_17_srafile_4_alternative_2_org | run_17_srafile_4_alternative_2_url | run_17_srafile_4_alternative_3_access_type | run_17_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_17_srafile_4_alternative_3_org | run_17_srafile_4_alternative_3_url | run_17_srafile_4_cluster | run_17_srafile_4_date | run_17_srafile_4_filename | run_17_srafile_4_md5 | run_17_srafile_4_semantic_name | run_17_srafile_4_size | run_17_srafile_4_sratoolkit | run_17_srafile_4_supertype | run_17_srafile_4_url | run_17_srafile_4_version | run_17_static_data_available | run_17_total_base_count | run_17_total_base_cs_native | run_17_total_bases | run_17_total_spots | run_18_accession | run_18_alias | run_18_base_A_count | run_18_base_C_count | run_18_base_G_count | run_18_base_N_count | run_18_base_T_count | run_18_cloudfile_1_filetype | run_18_cloudfile_1_location | run_18_cloudfile_1_provider | run_18_cloudfile_2_filetype | run_18_cloudfile_2_location | run_18_cloudfile_2_provider | run_18_cloudfile_3_filetype | run_18_cloudfile_3_location | run_18_cloudfile_3_provider | run_18_cloudfile_4_filetype | run_18_cloudfile_4_location | run_18_cloudfile_4_provider | run_18_cluster_name | run_18_database_1 | run_18_has_taxanalysis | run_18_is_public | run_18_load_done | run_18_published | run_18_size | run_18_srafile_1_alternative_1_access_type | run_18_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_18_srafile_1_alternative_1_org | run_18_srafile_1_alternative_1_url | run_18_srafile_1_cluster | run_18_srafile_1_date | run_18_srafile_1_filename | run_18_srafile_1_md5 | run_18_srafile_1_semantic_name | run_18_srafile_1_size | run_18_srafile_1_sratoolkit | run_18_srafile_1_supertype | run_18_srafile_1_version | run_18_srafile_2_alternative_1_access_type | run_18_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_18_srafile_2_alternative_1_org | run_18_srafile_2_alternative_1_url | run_18_srafile_2_cluster | run_18_srafile_2_date | run_18_srafile_2_filename | run_18_srafile_2_md5 | run_18_srafile_2_semantic_name | run_18_srafile_2_size | run_18_srafile_2_sratoolkit | run_18_srafile_2_supertype | run_18_srafile_2_version | run_18_srafile_3_alternative_1_access_type | run_18_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_18_srafile_3_alternative_1_org | run_18_srafile_3_alternative_1_url | run_18_srafile_3_cluster | run_18_srafile_3_date | run_18_srafile_3_filename | run_18_srafile_3_md5 | run_18_srafile_3_semantic_name | run_18_srafile_3_size | run_18_srafile_3_sratoolkit | run_18_srafile_3_supertype | run_18_srafile_3_url | run_18_srafile_3_version | run_18_srafile_4_alternative_1_access_type | run_18_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_18_srafile_4_alternative_1_org | run_18_srafile_4_alternative_1_url | run_18_srafile_4_alternative_2_access_type | run_18_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_18_srafile_4_alternative_2_org | run_18_srafile_4_alternative_2_url | run_18_srafile_4_alternative_3_access_type | run_18_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_18_srafile_4_alternative_3_org | run_18_srafile_4_alternative_3_url | run_18_srafile_4_cluster | run_18_srafile_4_date | run_18_srafile_4_filename | run_18_srafile_4_md5 | run_18_srafile_4_semantic_name | run_18_srafile_4_size | run_18_srafile_4_sratoolkit | run_18_srafile_4_supertype | run_18_srafile_4_url | run_18_srafile_4_version | run_18_static_data_available | run_18_total_base_count | run_18_total_base_cs_native | run_18_total_bases | run_18_total_spots | run_19_accession | run_19_alias | run_19_base_A_count | run_19_base_C_count | run_19_base_G_count | run_19_base_N_count | run_19_base_T_count | run_19_cloudfile_1_filetype | run_19_cloudfile_1_location | run_19_cloudfile_1_provider | run_19_cloudfile_2_filetype | run_19_cloudfile_2_location | run_19_cloudfile_2_provider | run_19_cloudfile_3_filetype | run_19_cloudfile_3_location | run_19_cloudfile_3_provider | run_19_cloudfile_4_filetype | run_19_cloudfile_4_location | run_19_cloudfile_4_provider | run_19_cluster_name | run_19_database_1 | run_19_has_taxanalysis | run_19_is_public | run_19_load_done | run_19_published | run_19_size | run_19_srafile_1_alternative_1_access_type | run_19_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_19_srafile_1_alternative_1_org | run_19_srafile_1_alternative_1_url | run_19_srafile_1_cluster | run_19_srafile_1_date | run_19_srafile_1_filename | run_19_srafile_1_md5 | run_19_srafile_1_semantic_name | run_19_srafile_1_size | run_19_srafile_1_sratoolkit | run_19_srafile_1_supertype | run_19_srafile_1_version | run_19_srafile_2_alternative_1_access_type | run_19_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_19_srafile_2_alternative_1_org | run_19_srafile_2_alternative_1_url | run_19_srafile_2_cluster | run_19_srafile_2_date | run_19_srafile_2_filename | run_19_srafile_2_md5 | run_19_srafile_2_semantic_name | run_19_srafile_2_size | run_19_srafile_2_sratoolkit | run_19_srafile_2_supertype | run_19_srafile_2_version | run_19_srafile_3_alternative_1_access_type | run_19_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_19_srafile_3_alternative_1_org | run_19_srafile_3_alternative_1_url | run_19_srafile_3_cluster | run_19_srafile_3_date | run_19_srafile_3_filename | run_19_srafile_3_md5 | run_19_srafile_3_semantic_name | run_19_srafile_3_size | run_19_srafile_3_sratoolkit | run_19_srafile_3_supertype | run_19_srafile_3_url | run_19_srafile_3_version | run_19_srafile_4_alternative_1_access_type | run_19_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_19_srafile_4_alternative_1_org | run_19_srafile_4_alternative_1_url | run_19_srafile_4_alternative_2_access_type | run_19_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_19_srafile_4_alternative_2_org | run_19_srafile_4_alternative_2_url | run_19_srafile_4_alternative_3_access_type | run_19_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_19_srafile_4_alternative_3_org | run_19_srafile_4_alternative_3_url | run_19_srafile_4_cluster | run_19_srafile_4_date | run_19_srafile_4_filename | run_19_srafile_4_md5 | run_19_srafile_4_semantic_name | run_19_srafile_4_size | run_19_srafile_4_sratoolkit | run_19_srafile_4_supertype | run_19_srafile_4_url | run_19_srafile_4_version | run_19_static_data_available | run_19_total_base_count | run_19_total_base_cs_native | run_19_total_bases | run_19_total_spots | run_1_alias | run_1_base_A_count | run_1_base_C_count | run_1_base_G_count | run_1_base_N_count | run_1_base_T_count | run_1_cloudfile_1_filetype | run_1_cloudfile_1_location | run_1_cloudfile_1_provider | run_1_cloudfile_2_filetype | run_1_cloudfile_2_location | run_1_cloudfile_2_provider | run_1_cloudfile_3_filetype | run_1_cloudfile_3_location | run_1_cloudfile_3_provider | run_1_cloudfile_4_filetype | run_1_cloudfile_4_location | run_1_cloudfile_4_provider | run_1_cluster_name | run_1_database_1 | run_1_has_taxanalysis | run_1_is_public | run_1_load_done | run_1_published | run_1_srafile_1_alternative_1_access_type | run_1_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_1_srafile_1_alternative_1_org | run_1_srafile_1_alternative_1_url | run_1_srafile_1_alternative_2_access_type | run_1_srafile_1_alternative_2_free_egress | run_1_srafile_1_alternative_2_org | run_1_srafile_1_alternative_2_url | run_1_srafile_1_cluster | run_1_srafile_1_date | run_1_srafile_1_filename | run_1_srafile_1_md5 | run_1_srafile_1_semantic_name | run_1_srafile_1_size | run_1_srafile_1_sratoolkit | run_1_srafile_1_supertype | run_1_srafile_1_url | run_1_srafile_1_version | run_1_srafile_2_alternative_1_access_type | run_1_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_1_srafile_2_alternative_1_org | run_1_srafile_2_alternative_1_url | run_1_srafile_2_alternative_2_access_type | run_1_srafile_2_alternative_2_free_egress | run_1_srafile_2_alternative_2_org | run_1_srafile_2_alternative_2_url | run_1_srafile_2_alternative_3_access_type | run_1_srafile_2_alternative_3_free_egress | run_1_srafile_2_alternative_3_org | run_1_srafile_2_alternative_3_url | run_1_srafile_2_cluster | run_1_srafile_2_date | run_1_srafile_2_filename | run_1_srafile_2_md5 | run_1_srafile_2_semantic_name | run_1_srafile_2_size | run_1_srafile_2_sratoolkit | run_1_srafile_2_supertype | run_1_srafile_2_url | run_1_srafile_2_version | run_1_srafile_3_alternative_1_access_type | run_1_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_1_srafile_3_alternative_1_org | run_1_srafile_3_alternative_1_url | run_1_srafile_3_alternative_2_access_type | run_1_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_1_srafile_3_alternative_2_org | run_1_srafile_3_alternative_2_url | run_1_srafile_3_alternative_3_access_type | run_1_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_1_srafile_3_alternative_3_org | run_1_srafile_3_alternative_3_url | run_1_srafile_3_cluster | run_1_srafile_3_date | run_1_srafile_3_filename | run_1_srafile_3_md5 | run_1_srafile_3_semantic_name | run_1_srafile_3_size | run_1_srafile_3_sratoolkit | run_1_srafile_3_supertype | run_1_srafile_3_url | run_1_srafile_3_version | run_1_srafile_4_alternative_1_access_type | run_1_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_1_srafile_4_alternative_1_org | run_1_srafile_4_alternative_1_url | run_1_srafile_4_alternative_2_access_type | run_1_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_1_srafile_4_alternative_2_org | run_1_srafile_4_alternative_2_url | run_1_srafile_4_alternative_3_access_type | run_1_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_1_srafile_4_alternative_3_org | run_1_srafile_4_alternative_3_url | run_1_srafile_4_cluster | run_1_srafile_4_date | run_1_srafile_4_filename | run_1_srafile_4_md5 | run_1_srafile_4_semantic_name | run_1_srafile_4_size | run_1_srafile_4_sratoolkit | run_1_srafile_4_supertype | run_1_srafile_4_url | run_1_srafile_4_version | run_1_srafile_5_alternative_1_access_type | run_1_srafile_5_alternative_1_free_egress | run_1_srafile_5_alternative_1_org | run_1_srafile_5_alternative_1_url | run_1_srafile_5_cluster | run_1_srafile_5_date | run_1_srafile_5_filename | run_1_srafile_5_md5 | run_1_srafile_5_semantic_name | run_1_srafile_5_size | run_1_srafile_5_sratoolkit | run_1_srafile_5_supertype | run_1_srafile_5_url | run_1_srafile_5_version | run_1_srafile_6_alternative_1_access_type | run_1_srafile_6_alternative_1_free_egress | run_1_srafile_6_alternative_1_org | run_1_srafile_6_alternative_1_url | run_1_srafile_6_alternative_2_access_type | run_1_srafile_6_alternative_2_free_egress | run_1_srafile_6_alternative_2_org | run_1_srafile_6_alternative_2_url | run_1_srafile_6_alternative_3_access_type | run_1_srafile_6_alternative_3_free_egress | run_1_srafile_6_alternative_3_org | run_1_srafile_6_alternative_3_url | run_1_srafile_6_cluster | run_1_srafile_6_date | run_1_srafile_6_filename | run_1_srafile_6_md5 | run_1_srafile_6_semantic_name | run_1_srafile_6_size | run_1_srafile_6_sratoolkit | run_1_srafile_6_supertype | run_1_srafile_6_url | run_1_srafile_6_version | run_1_static_data_available | run_1_total_base_count | run_1_total_base_cs_native | run_20_accession | run_20_alias | run_20_base_A_count | run_20_base_C_count | run_20_base_G_count | run_20_base_N_count | run_20_base_T_count | run_20_cloudfile_1_filetype | run_20_cloudfile_1_location | run_20_cloudfile_1_provider | run_20_cloudfile_2_filetype | run_20_cloudfile_2_location | run_20_cloudfile_2_provider | run_20_cloudfile_3_filetype | run_20_cloudfile_3_location | run_20_cloudfile_3_provider | run_20_cloudfile_4_filetype | run_20_cloudfile_4_location | run_20_cloudfile_4_provider | run_20_cluster_name | run_20_database_1 | run_20_has_taxanalysis | run_20_is_public | run_20_load_done | run_20_published | run_20_size | run_20_srafile_1_alternative_1_access_type | run_20_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_20_srafile_1_alternative_1_org | run_20_srafile_1_alternative_1_url | run_20_srafile_1_cluster | run_20_srafile_1_date | run_20_srafile_1_filename | run_20_srafile_1_md5 | run_20_srafile_1_semantic_name | run_20_srafile_1_size | run_20_srafile_1_sratoolkit | run_20_srafile_1_supertype | run_20_srafile_1_version | run_20_srafile_2_alternative_1_access_type | run_20_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_20_srafile_2_alternative_1_org | run_20_srafile_2_alternative_1_url | run_20_srafile_2_cluster | run_20_srafile_2_date | run_20_srafile_2_filename | run_20_srafile_2_md5 | run_20_srafile_2_semantic_name | run_20_srafile_2_size | run_20_srafile_2_sratoolkit | run_20_srafile_2_supertype | run_20_srafile_2_version | run_20_srafile_3_alternative_1_access_type | run_20_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_20_srafile_3_alternative_1_org | run_20_srafile_3_alternative_1_url | run_20_srafile_3_cluster | run_20_srafile_3_date | run_20_srafile_3_filename | run_20_srafile_3_md5 | run_20_srafile_3_semantic_name | run_20_srafile_3_size | run_20_srafile_3_sratoolkit | run_20_srafile_3_supertype | run_20_srafile_3_url | run_20_srafile_3_version | run_20_srafile_4_alternative_1_access_type | run_20_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_20_srafile_4_alternative_1_org | run_20_srafile_4_alternative_1_url | run_20_srafile_4_alternative_2_access_type | run_20_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_20_srafile_4_alternative_2_org | run_20_srafile_4_alternative_2_url | run_20_srafile_4_alternative_3_access_type | run_20_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_20_srafile_4_alternative_3_org | run_20_srafile_4_alternative_3_url | run_20_srafile_4_cluster | run_20_srafile_4_date | run_20_srafile_4_filename | run_20_srafile_4_md5 | run_20_srafile_4_semantic_name | run_20_srafile_4_size | run_20_srafile_4_sratoolkit | run_20_srafile_4_supertype | run_20_srafile_4_url | run_20_srafile_4_version | run_20_static_data_available | run_20_total_base_count | run_20_total_base_cs_native | run_20_total_bases | run_20_total_spots | run_21_accession | run_21_alias | run_21_base_A_count | run_21_base_C_count | run_21_base_G_count | run_21_base_N_count | run_21_base_T_count | run_21_cloudfile_1_filetype | run_21_cloudfile_1_location | run_21_cloudfile_1_provider | run_21_cloudfile_2_filetype | run_21_cloudfile_2_location | run_21_cloudfile_2_provider | run_21_cloudfile_3_filetype | run_21_cloudfile_3_location | run_21_cloudfile_3_provider | run_21_cloudfile_4_filetype | run_21_cloudfile_4_location | run_21_cloudfile_4_provider | run_21_cluster_name | run_21_database_1 | run_21_has_taxanalysis | run_21_is_public | run_21_load_done | run_21_published | run_21_size | run_21_srafile_1_alternative_1_access_type | run_21_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_21_srafile_1_alternative_1_org | run_21_srafile_1_alternative_1_url | run_21_srafile_1_cluster | run_21_srafile_1_date | run_21_srafile_1_filename | run_21_srafile_1_md5 | run_21_srafile_1_semantic_name | run_21_srafile_1_size | run_21_srafile_1_sratoolkit | run_21_srafile_1_supertype | run_21_srafile_1_version | run_21_srafile_2_alternative_1_access_type | run_21_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_21_srafile_2_alternative_1_org | run_21_srafile_2_alternative_1_url | run_21_srafile_2_cluster | run_21_srafile_2_date | run_21_srafile_2_filename | run_21_srafile_2_md5 | run_21_srafile_2_semantic_name | run_21_srafile_2_size | run_21_srafile_2_sratoolkit | run_21_srafile_2_supertype | run_21_srafile_2_version | run_21_srafile_3_alternative_1_access_type | run_21_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_21_srafile_3_alternative_1_org | run_21_srafile_3_alternative_1_url | run_21_srafile_3_cluster | run_21_srafile_3_date | run_21_srafile_3_filename | run_21_srafile_3_md5 | run_21_srafile_3_semantic_name | run_21_srafile_3_size | run_21_srafile_3_sratoolkit | run_21_srafile_3_supertype | run_21_srafile_3_url | run_21_srafile_3_version | run_21_srafile_4_alternative_1_access_type | run_21_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_21_srafile_4_alternative_1_org | run_21_srafile_4_alternative_1_url | run_21_srafile_4_alternative_2_access_type | run_21_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_21_srafile_4_alternative_2_org | run_21_srafile_4_alternative_2_url | run_21_srafile_4_alternative_3_access_type | run_21_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_21_srafile_4_alternative_3_org | run_21_srafile_4_alternative_3_url | run_21_srafile_4_cluster | run_21_srafile_4_date | run_21_srafile_4_filename | run_21_srafile_4_md5 | run_21_srafile_4_semantic_name | run_21_srafile_4_size | run_21_srafile_4_sratoolkit | run_21_srafile_4_supertype | run_21_srafile_4_url | run_21_srafile_4_version | run_21_static_data_available | run_21_total_base_count | run_21_total_base_cs_native | run_21_total_bases | run_21_total_spots | run_22_accession | run_22_alias | run_22_base_A_count | run_22_base_C_count | run_22_base_G_count | run_22_base_N_count | run_22_base_T_count | run_22_cloudfile_1_filetype | run_22_cloudfile_1_location | run_22_cloudfile_1_provider | run_22_cloudfile_2_filetype | run_22_cloudfile_2_location | run_22_cloudfile_2_provider | run_22_cloudfile_3_filetype | run_22_cloudfile_3_location | run_22_cloudfile_3_provider | run_22_cloudfile_4_filetype | run_22_cloudfile_4_location | run_22_cloudfile_4_provider | run_22_cluster_name | run_22_database_1 | run_22_has_taxanalysis | run_22_is_public | run_22_load_done | run_22_published | run_22_size | run_22_srafile_1_alternative_1_access_type | run_22_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_22_srafile_1_alternative_1_org | run_22_srafile_1_alternative_1_url | run_22_srafile_1_cluster | run_22_srafile_1_date | run_22_srafile_1_filename | run_22_srafile_1_md5 | run_22_srafile_1_semantic_name | run_22_srafile_1_size | run_22_srafile_1_sratoolkit | run_22_srafile_1_supertype | run_22_srafile_1_version | run_22_srafile_2_alternative_1_access_type | run_22_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_22_srafile_2_alternative_1_org | run_22_srafile_2_alternative_1_url | run_22_srafile_2_cluster | run_22_srafile_2_date | run_22_srafile_2_filename | run_22_srafile_2_md5 | run_22_srafile_2_semantic_name | run_22_srafile_2_size | run_22_srafile_2_sratoolkit | run_22_srafile_2_supertype | run_22_srafile_2_version | run_22_srafile_3_alternative_1_access_type | run_22_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_22_srafile_3_alternative_1_org | run_22_srafile_3_alternative_1_url | run_22_srafile_3_cluster | run_22_srafile_3_date | run_22_srafile_3_filename | run_22_srafile_3_md5 | run_22_srafile_3_semantic_name | run_22_srafile_3_size | run_22_srafile_3_sratoolkit | run_22_srafile_3_supertype | run_22_srafile_3_url | run_22_srafile_3_version | run_22_srafile_4_alternative_1_access_type | run_22_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_22_srafile_4_alternative_1_org | run_22_srafile_4_alternative_1_url | run_22_srafile_4_alternative_2_access_type | run_22_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_22_srafile_4_alternative_2_org | run_22_srafile_4_alternative_2_url | run_22_srafile_4_alternative_3_access_type | run_22_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_22_srafile_4_alternative_3_org | run_22_srafile_4_alternative_3_url | run_22_srafile_4_cluster | run_22_srafile_4_date | run_22_srafile_4_filename | run_22_srafile_4_md5 | run_22_srafile_4_semantic_name | run_22_srafile_4_size | run_22_srafile_4_sratoolkit | run_22_srafile_4_supertype | run_22_srafile_4_url | run_22_srafile_4_version | run_22_static_data_available | run_22_total_base_count | run_22_total_base_cs_native | run_22_total_bases | run_22_total_spots | run_23_accession | run_23_alias | run_23_base_A_count | run_23_base_C_count | run_23_base_G_count | run_23_base_N_count | run_23_base_T_count | run_23_cloudfile_1_filetype | run_23_cloudfile_1_location | run_23_cloudfile_1_provider | run_23_cloudfile_2_filetype | run_23_cloudfile_2_location | run_23_cloudfile_2_provider | run_23_cloudfile_3_filetype | run_23_cloudfile_3_location | run_23_cloudfile_3_provider | run_23_cloudfile_4_filetype | run_23_cloudfile_4_location | run_23_cloudfile_4_provider | run_23_cluster_name | run_23_database_1 | run_23_has_taxanalysis | run_23_is_public | run_23_load_done | run_23_published | run_23_size | run_23_srafile_1_alternative_1_access_type | run_23_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_23_srafile_1_alternative_1_org | run_23_srafile_1_alternative_1_url | run_23_srafile_1_cluster | run_23_srafile_1_date | run_23_srafile_1_filename | run_23_srafile_1_md5 | run_23_srafile_1_semantic_name | run_23_srafile_1_size | run_23_srafile_1_sratoolkit | run_23_srafile_1_supertype | run_23_srafile_1_version | run_23_srafile_2_alternative_1_access_type | run_23_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_23_srafile_2_alternative_1_org | run_23_srafile_2_alternative_1_url | run_23_srafile_2_cluster | run_23_srafile_2_date | run_23_srafile_2_filename | run_23_srafile_2_md5 | run_23_srafile_2_semantic_name | run_23_srafile_2_size | run_23_srafile_2_sratoolkit | run_23_srafile_2_supertype | run_23_srafile_2_version | run_23_srafile_3_alternative_1_access_type | run_23_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_23_srafile_3_alternative_1_org | run_23_srafile_3_alternative_1_url | run_23_srafile_3_cluster | run_23_srafile_3_date | run_23_srafile_3_filename | run_23_srafile_3_md5 | run_23_srafile_3_semantic_name | run_23_srafile_3_size | run_23_srafile_3_sratoolkit | run_23_srafile_3_supertype | run_23_srafile_3_url | run_23_srafile_3_version | run_23_srafile_4_alternative_1_access_type | run_23_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_23_srafile_4_alternative_1_org | run_23_srafile_4_alternative_1_url | run_23_srafile_4_alternative_2_access_type | run_23_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_23_srafile_4_alternative_2_org | run_23_srafile_4_alternative_2_url | run_23_srafile_4_alternative_3_access_type | run_23_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_23_srafile_4_alternative_3_org | run_23_srafile_4_alternative_3_url | run_23_srafile_4_cluster | run_23_srafile_4_date | run_23_srafile_4_filename | run_23_srafile_4_md5 | run_23_srafile_4_semantic_name | run_23_srafile_4_size | run_23_srafile_4_sratoolkit | run_23_srafile_4_supertype | run_23_srafile_4_url | run_23_srafile_4_version | run_23_static_data_available | run_23_total_base_count | run_23_total_base_cs_native | run_23_total_bases | run_23_total_spots | run_24_accession | run_24_alias | run_24_base_A_count | run_24_base_C_count | run_24_base_G_count | run_24_base_N_count | run_24_base_T_count | run_24_cloudfile_1_filetype | run_24_cloudfile_1_location | run_24_cloudfile_1_provider | run_24_cloudfile_2_filetype | run_24_cloudfile_2_location | run_24_cloudfile_2_provider | run_24_cloudfile_3_filetype | run_24_cloudfile_3_location | run_24_cloudfile_3_provider | run_24_cloudfile_4_filetype | run_24_cloudfile_4_location | run_24_cloudfile_4_provider | run_24_cluster_name | run_24_database_1 | run_24_has_taxanalysis | run_24_is_public | run_24_load_done | run_24_published | run_24_size | run_24_srafile_1_alternative_1_access_type | run_24_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_24_srafile_1_alternative_1_org | run_24_srafile_1_alternative_1_url | run_24_srafile_1_cluster | run_24_srafile_1_date | run_24_srafile_1_filename | run_24_srafile_1_md5 | run_24_srafile_1_semantic_name | run_24_srafile_1_size | run_24_srafile_1_sratoolkit | run_24_srafile_1_supertype | run_24_srafile_1_version | run_24_srafile_2_alternative_1_access_type | run_24_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_24_srafile_2_alternative_1_org | run_24_srafile_2_alternative_1_url | run_24_srafile_2_cluster | run_24_srafile_2_date | run_24_srafile_2_filename | run_24_srafile_2_md5 | run_24_srafile_2_semantic_name | run_24_srafile_2_size | run_24_srafile_2_sratoolkit | run_24_srafile_2_supertype | run_24_srafile_2_version | run_24_srafile_3_alternative_1_access_type | run_24_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_24_srafile_3_alternative_1_org | run_24_srafile_3_alternative_1_url | run_24_srafile_3_cluster | run_24_srafile_3_date | run_24_srafile_3_filename | run_24_srafile_3_md5 | run_24_srafile_3_semantic_name | run_24_srafile_3_size | run_24_srafile_3_sratoolkit | run_24_srafile_3_supertype | run_24_srafile_3_url | run_24_srafile_3_version | run_24_srafile_4_alternative_1_access_type | run_24_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_24_srafile_4_alternative_1_org | run_24_srafile_4_alternative_1_url | run_24_srafile_4_alternative_2_access_type | run_24_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_24_srafile_4_alternative_2_org | run_24_srafile_4_alternative_2_url | run_24_srafile_4_alternative_3_access_type | run_24_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_24_srafile_4_alternative_3_org | run_24_srafile_4_alternative_3_url | run_24_srafile_4_cluster | run_24_srafile_4_date | run_24_srafile_4_filename | run_24_srafile_4_md5 | run_24_srafile_4_semantic_name | run_24_srafile_4_size | run_24_srafile_4_sratoolkit | run_24_srafile_4_supertype | run_24_srafile_4_url | run_24_srafile_4_version | run_24_static_data_available | run_24_total_base_count | run_24_total_base_cs_native | run_24_total_bases | run_24_total_spots | run_25_accession | run_25_alias | run_25_base_A_count | run_25_base_C_count | run_25_base_G_count | run_25_base_N_count | run_25_base_T_count | run_25_cloudfile_1_filetype | run_25_cloudfile_1_location | run_25_cloudfile_1_provider | run_25_cloudfile_2_filetype | run_25_cloudfile_2_location | run_25_cloudfile_2_provider | run_25_cloudfile_3_filetype | run_25_cloudfile_3_location | run_25_cloudfile_3_provider | run_25_cloudfile_4_filetype | run_25_cloudfile_4_location | run_25_cloudfile_4_provider | run_25_cluster_name | run_25_database_1 | run_25_has_taxanalysis | run_25_is_public | run_25_load_done | run_25_published | run_25_size | run_25_srafile_1_alternative_1_access_type | run_25_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_25_srafile_1_alternative_1_org | run_25_srafile_1_alternative_1_url | run_25_srafile_1_cluster | run_25_srafile_1_date | run_25_srafile_1_filename | run_25_srafile_1_md5 | run_25_srafile_1_semantic_name | run_25_srafile_1_size | run_25_srafile_1_sratoolkit | run_25_srafile_1_supertype | run_25_srafile_1_version | run_25_srafile_2_alternative_1_access_type | run_25_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_25_srafile_2_alternative_1_org | run_25_srafile_2_alternative_1_url | run_25_srafile_2_cluster | run_25_srafile_2_date | run_25_srafile_2_filename | run_25_srafile_2_md5 | run_25_srafile_2_semantic_name | run_25_srafile_2_size | run_25_srafile_2_sratoolkit | run_25_srafile_2_supertype | run_25_srafile_2_version | run_25_srafile_3_alternative_1_access_type | run_25_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_25_srafile_3_alternative_1_org | run_25_srafile_3_alternative_1_url | run_25_srafile_3_cluster | run_25_srafile_3_date | run_25_srafile_3_filename | run_25_srafile_3_md5 | run_25_srafile_3_semantic_name | run_25_srafile_3_size | run_25_srafile_3_sratoolkit | run_25_srafile_3_supertype | run_25_srafile_3_url | run_25_srafile_3_version | run_25_srafile_4_alternative_1_access_type | run_25_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_25_srafile_4_alternative_1_org | run_25_srafile_4_alternative_1_url | run_25_srafile_4_alternative_2_access_type | run_25_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_25_srafile_4_alternative_2_org | run_25_srafile_4_alternative_2_url | run_25_srafile_4_alternative_3_access_type | run_25_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_25_srafile_4_alternative_3_org | run_25_srafile_4_alternative_3_url | run_25_srafile_4_cluster | run_25_srafile_4_date | run_25_srafile_4_filename | run_25_srafile_4_md5 | run_25_srafile_4_semantic_name | run_25_srafile_4_size | run_25_srafile_4_sratoolkit | run_25_srafile_4_supertype | run_25_srafile_4_url | run_25_srafile_4_version | run_25_static_data_available | run_25_total_base_count | run_25_total_base_cs_native | run_25_total_bases | run_25_total_spots | run_26_accession | run_26_alias | run_26_base_A_count | run_26_base_C_count | run_26_base_G_count | run_26_base_N_count | run_26_base_T_count | run_26_cloudfile_1_filetype | run_26_cloudfile_1_location | run_26_cloudfile_1_provider | run_26_cloudfile_2_filetype | run_26_cloudfile_2_location | run_26_cloudfile_2_provider | run_26_cloudfile_3_filetype | run_26_cloudfile_3_location | run_26_cloudfile_3_provider | run_26_cloudfile_4_filetype | run_26_cloudfile_4_location | run_26_cloudfile_4_provider | run_26_cluster_name | run_26_database_1 | run_26_has_taxanalysis | run_26_is_public | run_26_load_done | run_26_published | run_26_size | run_26_srafile_1_alternative_1_access_type | run_26_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_26_srafile_1_alternative_1_org | run_26_srafile_1_alternative_1_url | run_26_srafile_1_cluster | run_26_srafile_1_date | run_26_srafile_1_filename | run_26_srafile_1_md5 | run_26_srafile_1_semantic_name | run_26_srafile_1_size | run_26_srafile_1_sratoolkit | run_26_srafile_1_supertype | run_26_srafile_1_version | run_26_srafile_2_alternative_1_access_type | run_26_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_26_srafile_2_alternative_1_org | run_26_srafile_2_alternative_1_url | run_26_srafile_2_cluster | run_26_srafile_2_date | run_26_srafile_2_filename | run_26_srafile_2_md5 | run_26_srafile_2_semantic_name | run_26_srafile_2_size | run_26_srafile_2_sratoolkit | run_26_srafile_2_supertype | run_26_srafile_2_version | run_26_srafile_3_alternative_1_access_type | run_26_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_26_srafile_3_alternative_1_org | run_26_srafile_3_alternative_1_url | run_26_srafile_3_cluster | run_26_srafile_3_date | run_26_srafile_3_filename | run_26_srafile_3_md5 | run_26_srafile_3_semantic_name | run_26_srafile_3_size | run_26_srafile_3_sratoolkit | run_26_srafile_3_supertype | run_26_srafile_3_url | run_26_srafile_3_version | run_26_srafile_4_alternative_1_access_type | run_26_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_26_srafile_4_alternative_1_org | run_26_srafile_4_alternative_1_url | run_26_srafile_4_alternative_2_access_type | run_26_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_26_srafile_4_alternative_2_org | run_26_srafile_4_alternative_2_url | run_26_srafile_4_alternative_3_access_type | run_26_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_26_srafile_4_alternative_3_org | run_26_srafile_4_alternative_3_url | run_26_srafile_4_cluster | run_26_srafile_4_date | run_26_srafile_4_filename | run_26_srafile_4_md5 | run_26_srafile_4_semantic_name | run_26_srafile_4_size | run_26_srafile_4_sratoolkit | run_26_srafile_4_supertype | run_26_srafile_4_url | run_26_srafile_4_version | run_26_static_data_available | run_26_total_base_count | run_26_total_base_cs_native | run_26_total_bases | run_26_total_spots | run_27_accession | run_27_alias | run_27_base_A_count | run_27_base_C_count | run_27_base_G_count | run_27_base_N_count | run_27_base_T_count | run_27_cloudfile_1_filetype | run_27_cloudfile_1_location | run_27_cloudfile_1_provider | run_27_cloudfile_2_filetype | run_27_cloudfile_2_location | run_27_cloudfile_2_provider | run_27_cloudfile_3_filetype | run_27_cloudfile_3_location | run_27_cloudfile_3_provider | run_27_cloudfile_4_filetype | run_27_cloudfile_4_location | run_27_cloudfile_4_provider | run_27_cluster_name | run_27_database_1 | run_27_has_taxanalysis | run_27_is_public | run_27_load_done | run_27_published | run_27_size | run_27_srafile_1_alternative_1_access_type | run_27_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_27_srafile_1_alternative_1_org | run_27_srafile_1_alternative_1_url | run_27_srafile_1_cluster | run_27_srafile_1_date | run_27_srafile_1_filename | run_27_srafile_1_md5 | run_27_srafile_1_semantic_name | run_27_srafile_1_size | run_27_srafile_1_sratoolkit | run_27_srafile_1_supertype | run_27_srafile_1_version | run_27_srafile_2_alternative_1_access_type | run_27_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_27_srafile_2_alternative_1_org | run_27_srafile_2_alternative_1_url | run_27_srafile_2_cluster | run_27_srafile_2_date | run_27_srafile_2_filename | run_27_srafile_2_md5 | run_27_srafile_2_semantic_name | run_27_srafile_2_size | run_27_srafile_2_sratoolkit | run_27_srafile_2_supertype | run_27_srafile_2_version | run_27_srafile_3_alternative_1_access_type | run_27_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_27_srafile_3_alternative_1_org | run_27_srafile_3_alternative_1_url | run_27_srafile_3_cluster | run_27_srafile_3_date | run_27_srafile_3_filename | run_27_srafile_3_md5 | run_27_srafile_3_semantic_name | run_27_srafile_3_size | run_27_srafile_3_sratoolkit | run_27_srafile_3_supertype | run_27_srafile_3_url | run_27_srafile_3_version | run_27_srafile_4_alternative_1_access_type | run_27_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_27_srafile_4_alternative_1_org | run_27_srafile_4_alternative_1_url | run_27_srafile_4_alternative_2_access_type | run_27_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_27_srafile_4_alternative_2_org | run_27_srafile_4_alternative_2_url | run_27_srafile_4_alternative_3_access_type | run_27_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_27_srafile_4_alternative_3_org | run_27_srafile_4_alternative_3_url | run_27_srafile_4_cluster | run_27_srafile_4_date | run_27_srafile_4_filename | run_27_srafile_4_md5 | run_27_srafile_4_semantic_name | run_27_srafile_4_size | run_27_srafile_4_sratoolkit | run_27_srafile_4_supertype | run_27_srafile_4_url | run_27_srafile_4_version | run_27_static_data_available | run_27_total_base_count | run_27_total_base_cs_native | run_27_total_bases | run_27_total_spots | run_28_accession | run_28_alias | run_28_base_A_count | run_28_base_C_count | run_28_base_G_count | run_28_base_N_count | run_28_base_T_count | run_28_cloudfile_1_filetype | run_28_cloudfile_1_location | run_28_cloudfile_1_provider | run_28_cloudfile_2_filetype | run_28_cloudfile_2_location | run_28_cloudfile_2_provider | run_28_cloudfile_3_filetype | run_28_cloudfile_3_location | run_28_cloudfile_3_provider | run_28_cloudfile_4_filetype | run_28_cloudfile_4_location | run_28_cloudfile_4_provider | run_28_cluster_name | run_28_database_1 | run_28_has_taxanalysis | run_28_is_public | run_28_load_done | run_28_published | run_28_size | run_28_srafile_1_alternative_1_access_type | run_28_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_28_srafile_1_alternative_1_org | run_28_srafile_1_alternative_1_url | run_28_srafile_1_cluster | run_28_srafile_1_date | run_28_srafile_1_filename | run_28_srafile_1_md5 | run_28_srafile_1_semantic_name | run_28_srafile_1_size | run_28_srafile_1_sratoolkit | run_28_srafile_1_supertype | run_28_srafile_1_version | run_28_srafile_2_alternative_1_access_type | run_28_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_28_srafile_2_alternative_1_org | run_28_srafile_2_alternative_1_url | run_28_srafile_2_cluster | run_28_srafile_2_date | run_28_srafile_2_filename | run_28_srafile_2_md5 | run_28_srafile_2_semantic_name | run_28_srafile_2_size | run_28_srafile_2_sratoolkit | run_28_srafile_2_supertype | run_28_srafile_2_version | run_28_srafile_3_alternative_1_access_type | run_28_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_28_srafile_3_alternative_1_org | run_28_srafile_3_alternative_1_url | run_28_srafile_3_cluster | run_28_srafile_3_date | run_28_srafile_3_filename | run_28_srafile_3_md5 | run_28_srafile_3_semantic_name | run_28_srafile_3_size | run_28_srafile_3_sratoolkit | run_28_srafile_3_supertype | run_28_srafile_3_url | run_28_srafile_3_version | run_28_srafile_4_alternative_1_access_type | run_28_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_28_srafile_4_alternative_1_org | run_28_srafile_4_alternative_1_url | run_28_srafile_4_alternative_2_access_type | run_28_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_28_srafile_4_alternative_2_org | run_28_srafile_4_alternative_2_url | run_28_srafile_4_alternative_3_access_type | run_28_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_28_srafile_4_alternative_3_org | run_28_srafile_4_alternative_3_url | run_28_srafile_4_cluster | run_28_srafile_4_date | run_28_srafile_4_filename | run_28_srafile_4_md5 | run_28_srafile_4_semantic_name | run_28_srafile_4_size | run_28_srafile_4_sratoolkit | run_28_srafile_4_supertype | run_28_srafile_4_url | run_28_srafile_4_version | run_28_static_data_available | run_28_total_base_count | run_28_total_base_cs_native | run_28_total_bases | run_28_total_spots | run_29_accession | run_29_alias | run_29_base_A_count | run_29_base_C_count | run_29_base_G_count | run_29_base_N_count | run_29_base_T_count | run_29_cloudfile_1_filetype | run_29_cloudfile_1_location | run_29_cloudfile_1_provider | run_29_cloudfile_2_filetype | run_29_cloudfile_2_location | run_29_cloudfile_2_provider | run_29_cloudfile_3_filetype | run_29_cloudfile_3_location | run_29_cloudfile_3_provider | run_29_cloudfile_4_filetype | run_29_cloudfile_4_location | run_29_cloudfile_4_provider | run_29_cluster_name | run_29_database_1 | run_29_has_taxanalysis | run_29_is_public | run_29_load_done | run_29_published | run_29_size | run_29_srafile_1_alternative_1_access_type | run_29_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_29_srafile_1_alternative_1_org | run_29_srafile_1_alternative_1_url | run_29_srafile_1_cluster | run_29_srafile_1_date | run_29_srafile_1_filename | run_29_srafile_1_md5 | run_29_srafile_1_semantic_name | run_29_srafile_1_size | run_29_srafile_1_sratoolkit | run_29_srafile_1_supertype | run_29_srafile_1_version | run_29_srafile_2_alternative_1_access_type | run_29_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_29_srafile_2_alternative_1_org | run_29_srafile_2_alternative_1_url | run_29_srafile_2_cluster | run_29_srafile_2_date | run_29_srafile_2_filename | run_29_srafile_2_md5 | run_29_srafile_2_semantic_name | run_29_srafile_2_size | run_29_srafile_2_sratoolkit | run_29_srafile_2_supertype | run_29_srafile_2_version | run_29_srafile_3_alternative_1_access_type | run_29_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_29_srafile_3_alternative_1_org | run_29_srafile_3_alternative_1_url | run_29_srafile_3_cluster | run_29_srafile_3_date | run_29_srafile_3_filename | run_29_srafile_3_md5 | run_29_srafile_3_semantic_name | run_29_srafile_3_size | run_29_srafile_3_sratoolkit | run_29_srafile_3_supertype | run_29_srafile_3_url | run_29_srafile_3_version | run_29_srafile_4_alternative_1_access_type | run_29_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_29_srafile_4_alternative_1_org | run_29_srafile_4_alternative_1_url | run_29_srafile_4_alternative_2_access_type | run_29_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_29_srafile_4_alternative_2_org | run_29_srafile_4_alternative_2_url | run_29_srafile_4_alternative_3_access_type | run_29_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_29_srafile_4_alternative_3_org | run_29_srafile_4_alternative_3_url | run_29_srafile_4_cluster | run_29_srafile_4_date | run_29_srafile_4_filename | run_29_srafile_4_md5 | run_29_srafile_4_semantic_name | run_29_srafile_4_size | run_29_srafile_4_sratoolkit | run_29_srafile_4_supertype | run_29_srafile_4_url | run_29_srafile_4_version | run_29_static_data_available | run_29_total_base_count | run_29_total_base_cs_native | run_29_total_bases | run_29_total_spots | run_2_accession | run_2_alias | run_2_base_A_count | run_2_base_C_count | run_2_base_G_count | run_2_base_N_count | run_2_base_T_count | run_2_cloudfile_1_filetype | run_2_cloudfile_1_location | run_2_cloudfile_1_provider | run_2_cloudfile_2_filetype | run_2_cloudfile_2_location | run_2_cloudfile_2_provider | run_2_cloudfile_3_filetype | run_2_cloudfile_3_location | run_2_cloudfile_3_provider | run_2_cloudfile_4_filetype | run_2_cloudfile_4_location | run_2_cloudfile_4_provider | run_2_cluster_name | run_2_database_1 | run_2_has_taxanalysis | run_2_is_public | run_2_load_done | run_2_published | run_2_size | run_2_srafile_1_alternative_1_access_type | run_2_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_2_srafile_1_alternative_1_org | run_2_srafile_1_alternative_1_url | run_2_srafile_1_alternative_2_access_type | run_2_srafile_1_alternative_2_free_egress | run_2_srafile_1_alternative_2_org | run_2_srafile_1_alternative_2_url | run_2_srafile_1_cluster | run_2_srafile_1_date | run_2_srafile_1_filename | run_2_srafile_1_md5 | run_2_srafile_1_semantic_name | run_2_srafile_1_size | run_2_srafile_1_sratoolkit | run_2_srafile_1_supertype | run_2_srafile_1_url | run_2_srafile_1_version | run_2_srafile_2_alternative_1_access_type | run_2_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_2_srafile_2_alternative_1_org | run_2_srafile_2_alternative_1_url | run_2_srafile_2_alternative_2_access_type | run_2_srafile_2_alternative_2_free_egress | run_2_srafile_2_alternative_2_org | run_2_srafile_2_alternative_2_url | run_2_srafile_2_alternative_3_access_type | run_2_srafile_2_alternative_3_free_egress | run_2_srafile_2_alternative_3_org | run_2_srafile_2_alternative_3_url | run_2_srafile_2_cluster | run_2_srafile_2_date | run_2_srafile_2_filename | run_2_srafile_2_md5 | run_2_srafile_2_semantic_name | run_2_srafile_2_size | run_2_srafile_2_sratoolkit | run_2_srafile_2_supertype | run_2_srafile_2_url | run_2_srafile_2_version | run_2_srafile_3_alternative_1_access_type | run_2_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_2_srafile_3_alternative_1_org | run_2_srafile_3_alternative_1_url | run_2_srafile_3_alternative_2_access_type | run_2_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_2_srafile_3_alternative_2_org | run_2_srafile_3_alternative_2_url | run_2_srafile_3_alternative_3_access_type | run_2_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_2_srafile_3_alternative_3_org | run_2_srafile_3_alternative_3_url | run_2_srafile_3_cluster | run_2_srafile_3_date | run_2_srafile_3_filename | run_2_srafile_3_md5 | run_2_srafile_3_semantic_name | run_2_srafile_3_size | run_2_srafile_3_sratoolkit | run_2_srafile_3_supertype | run_2_srafile_3_url | run_2_srafile_3_version | run_2_srafile_4_alternative_1_access_type | run_2_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_2_srafile_4_alternative_1_org | run_2_srafile_4_alternative_1_url | run_2_srafile_4_alternative_2_access_type | run_2_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_2_srafile_4_alternative_2_org | run_2_srafile_4_alternative_2_url | run_2_srafile_4_alternative_3_access_type | run_2_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_2_srafile_4_alternative_3_org | run_2_srafile_4_alternative_3_url | run_2_srafile_4_cluster | run_2_srafile_4_date | run_2_srafile_4_filename | run_2_srafile_4_md5 | run_2_srafile_4_semantic_name | run_2_srafile_4_size | run_2_srafile_4_sratoolkit | run_2_srafile_4_supertype | run_2_srafile_4_url | run_2_srafile_4_version | run_2_srafile_5_alternative_1_access_type | run_2_srafile_5_alternative_1_free_egress | run_2_srafile_5_alternative_1_org | run_2_srafile_5_alternative_1_url | run_2_srafile_5_cluster | run_2_srafile_5_date | run_2_srafile_5_filename | run_2_srafile_5_md5 | run_2_srafile_5_semantic_name | run_2_srafile_5_size | run_2_srafile_5_sratoolkit | run_2_srafile_5_supertype | run_2_srafile_5_url | run_2_srafile_5_version | run_2_srafile_6_alternative_1_access_type | run_2_srafile_6_alternative_1_free_egress | run_2_srafile_6_alternative_1_org | run_2_srafile_6_alternative_1_url | run_2_srafile_6_alternative_2_access_type | run_2_srafile_6_alternative_2_free_egress | run_2_srafile_6_alternative_2_org | run_2_srafile_6_alternative_2_url | run_2_srafile_6_alternative_3_access_type | run_2_srafile_6_alternative_3_free_egress | run_2_srafile_6_alternative_3_org | run_2_srafile_6_alternative_3_url | run_2_srafile_6_cluster | run_2_srafile_6_date | run_2_srafile_6_filename | run_2_srafile_6_md5 | run_2_srafile_6_semantic_name | run_2_srafile_6_size | run_2_srafile_6_sratoolkit | run_2_srafile_6_supertype | run_2_srafile_6_url | run_2_srafile_6_version | run_2_static_data_available | run_2_total_base_count | run_2_total_base_cs_native | run_2_total_bases | run_2_total_spots | run_30_accession | run_30_alias | run_30_base_A_count | run_30_base_C_count | run_30_base_G_count | run_30_base_N_count | run_30_base_T_count | run_30_cloudfile_1_filetype | run_30_cloudfile_1_location | run_30_cloudfile_1_provider | run_30_cloudfile_2_filetype | run_30_cloudfile_2_location | run_30_cloudfile_2_provider | run_30_cloudfile_3_filetype | run_30_cloudfile_3_location | run_30_cloudfile_3_provider | run_30_cloudfile_4_filetype | run_30_cloudfile_4_location | run_30_cloudfile_4_provider | run_30_cluster_name | run_30_database_1 | run_30_has_taxanalysis | run_30_is_public | run_30_load_done | run_30_published | run_30_size | run_30_srafile_1_alternative_1_access_type | run_30_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_30_srafile_1_alternative_1_org | run_30_srafile_1_alternative_1_url | run_30_srafile_1_cluster | run_30_srafile_1_date | run_30_srafile_1_filename | run_30_srafile_1_md5 | run_30_srafile_1_semantic_name | run_30_srafile_1_size | run_30_srafile_1_sratoolkit | run_30_srafile_1_supertype | run_30_srafile_1_version | run_30_srafile_2_alternative_1_access_type | run_30_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_30_srafile_2_alternative_1_org | run_30_srafile_2_alternative_1_url | run_30_srafile_2_cluster | run_30_srafile_2_date | run_30_srafile_2_filename | run_30_srafile_2_md5 | run_30_srafile_2_semantic_name | run_30_srafile_2_size | run_30_srafile_2_sratoolkit | run_30_srafile_2_supertype | run_30_srafile_2_version | run_30_srafile_3_alternative_1_access_type | run_30_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_30_srafile_3_alternative_1_org | run_30_srafile_3_alternative_1_url | run_30_srafile_3_cluster | run_30_srafile_3_date | run_30_srafile_3_filename | run_30_srafile_3_md5 | run_30_srafile_3_semantic_name | run_30_srafile_3_size | run_30_srafile_3_sratoolkit | run_30_srafile_3_supertype | run_30_srafile_3_url | run_30_srafile_3_version | run_30_srafile_4_alternative_1_access_type | run_30_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_30_srafile_4_alternative_1_org | run_30_srafile_4_alternative_1_url | run_30_srafile_4_alternative_2_access_type | run_30_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_30_srafile_4_alternative_2_org | run_30_srafile_4_alternative_2_url | run_30_srafile_4_alternative_3_access_type | run_30_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_30_srafile_4_alternative_3_org | run_30_srafile_4_alternative_3_url | run_30_srafile_4_cluster | run_30_srafile_4_date | run_30_srafile_4_filename | run_30_srafile_4_md5 | run_30_srafile_4_semantic_name | run_30_srafile_4_size | run_30_srafile_4_sratoolkit | run_30_srafile_4_supertype | run_30_srafile_4_url | run_30_srafile_4_version | run_30_static_data_available | run_30_total_base_count | run_30_total_base_cs_native | run_30_total_bases | run_30_total_spots | run_31_accession | run_31_alias | run_31_base_A_count | run_31_base_C_count | run_31_base_G_count | run_31_base_N_count | run_31_base_T_count | run_31_cloudfile_1_filetype | run_31_cloudfile_1_location | run_31_cloudfile_1_provider | run_31_cloudfile_2_filetype | run_31_cloudfile_2_location | run_31_cloudfile_2_provider | run_31_cloudfile_3_filetype | run_31_cloudfile_3_location | run_31_cloudfile_3_provider | run_31_cloudfile_4_filetype | run_31_cloudfile_4_location | run_31_cloudfile_4_provider | run_31_cluster_name | run_31_database_1 | run_31_has_taxanalysis | run_31_is_public | run_31_load_done | run_31_published | run_31_size | run_31_srafile_1_alternative_1_access_type | run_31_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_31_srafile_1_alternative_1_org | run_31_srafile_1_alternative_1_url | run_31_srafile_1_cluster | run_31_srafile_1_date | run_31_srafile_1_filename | run_31_srafile_1_md5 | run_31_srafile_1_semantic_name | run_31_srafile_1_size | run_31_srafile_1_sratoolkit | run_31_srafile_1_supertype | run_31_srafile_1_version | run_31_srafile_2_alternative_1_access_type | run_31_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_31_srafile_2_alternative_1_org | run_31_srafile_2_alternative_1_url | run_31_srafile_2_cluster | run_31_srafile_2_date | run_31_srafile_2_filename | run_31_srafile_2_md5 | run_31_srafile_2_semantic_name | run_31_srafile_2_size | run_31_srafile_2_sratoolkit | run_31_srafile_2_supertype | run_31_srafile_2_version | run_31_srafile_3_alternative_1_access_type | run_31_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_31_srafile_3_alternative_1_org | run_31_srafile_3_alternative_1_url | run_31_srafile_3_cluster | run_31_srafile_3_date | run_31_srafile_3_filename | run_31_srafile_3_md5 | run_31_srafile_3_semantic_name | run_31_srafile_3_size | run_31_srafile_3_sratoolkit | run_31_srafile_3_supertype | run_31_srafile_3_url | run_31_srafile_3_version | run_31_srafile_4_alternative_1_access_type | run_31_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_31_srafile_4_alternative_1_org | run_31_srafile_4_alternative_1_url | run_31_srafile_4_alternative_2_access_type | run_31_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_31_srafile_4_alternative_2_org | run_31_srafile_4_alternative_2_url | run_31_srafile_4_alternative_3_access_type | run_31_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_31_srafile_4_alternative_3_org | run_31_srafile_4_alternative_3_url | run_31_srafile_4_cluster | run_31_srafile_4_date | run_31_srafile_4_filename | run_31_srafile_4_md5 | run_31_srafile_4_semantic_name | run_31_srafile_4_size | run_31_srafile_4_sratoolkit | run_31_srafile_4_supertype | run_31_srafile_4_url | run_31_srafile_4_version | run_31_static_data_available | run_31_total_base_count | run_31_total_base_cs_native | run_31_total_bases | run_31_total_spots | run_32_accession | run_32_alias | run_32_base_A_count | run_32_base_C_count | run_32_base_G_count | run_32_base_N_count | run_32_base_T_count | run_32_cloudfile_1_filetype | run_32_cloudfile_1_location | run_32_cloudfile_1_provider | run_32_cloudfile_2_filetype | run_32_cloudfile_2_location | run_32_cloudfile_2_provider | run_32_cloudfile_3_filetype | run_32_cloudfile_3_location | run_32_cloudfile_3_provider | run_32_cloudfile_4_filetype | run_32_cloudfile_4_location | run_32_cloudfile_4_provider | run_32_cluster_name | run_32_database_1 | run_32_has_taxanalysis | run_32_is_public | run_32_load_done | run_32_published | run_32_size | run_32_srafile_1_alternative_1_access_type | run_32_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_32_srafile_1_alternative_1_org | run_32_srafile_1_alternative_1_url | run_32_srafile_1_cluster | run_32_srafile_1_date | run_32_srafile_1_filename | run_32_srafile_1_md5 | run_32_srafile_1_semantic_name | run_32_srafile_1_size | run_32_srafile_1_sratoolkit | run_32_srafile_1_supertype | run_32_srafile_1_version | run_32_srafile_2_alternative_1_access_type | run_32_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_32_srafile_2_alternative_1_org | run_32_srafile_2_alternative_1_url | run_32_srafile_2_cluster | run_32_srafile_2_date | run_32_srafile_2_filename | run_32_srafile_2_md5 | run_32_srafile_2_semantic_name | run_32_srafile_2_size | run_32_srafile_2_sratoolkit | run_32_srafile_2_supertype | run_32_srafile_2_version | run_32_srafile_3_alternative_1_access_type | run_32_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_32_srafile_3_alternative_1_org | run_32_srafile_3_alternative_1_url | run_32_srafile_3_cluster | run_32_srafile_3_date | run_32_srafile_3_filename | run_32_srafile_3_md5 | run_32_srafile_3_semantic_name | run_32_srafile_3_size | run_32_srafile_3_sratoolkit | run_32_srafile_3_supertype | run_32_srafile_3_url | run_32_srafile_3_version | run_32_srafile_4_alternative_1_access_type | run_32_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_32_srafile_4_alternative_1_org | run_32_srafile_4_alternative_1_url | run_32_srafile_4_alternative_2_access_type | run_32_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_32_srafile_4_alternative_2_org | run_32_srafile_4_alternative_2_url | run_32_srafile_4_alternative_3_access_type | run_32_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_32_srafile_4_alternative_3_org | run_32_srafile_4_alternative_3_url | run_32_srafile_4_cluster | run_32_srafile_4_date | run_32_srafile_4_filename | run_32_srafile_4_md5 | run_32_srafile_4_semantic_name | run_32_srafile_4_size | run_32_srafile_4_sratoolkit | run_32_srafile_4_supertype | run_32_srafile_4_url | run_32_srafile_4_version | run_32_static_data_available | run_32_total_base_count | run_32_total_base_cs_native | run_32_total_bases | run_32_total_spots | run_3_accession | run_3_alias | run_3_base_A_count | run_3_base_C_count | run_3_base_G_count | run_3_base_N_count | run_3_base_T_count | run_3_cloudfile_1_filetype | run_3_cloudfile_1_location | run_3_cloudfile_1_provider | run_3_cloudfile_2_filetype | run_3_cloudfile_2_location | run_3_cloudfile_2_provider | run_3_cloudfile_3_filetype | run_3_cloudfile_3_location | run_3_cloudfile_3_provider | run_3_cloudfile_4_filetype | run_3_cloudfile_4_location | run_3_cloudfile_4_provider | run_3_cluster_name | run_3_database_1 | run_3_has_taxanalysis | run_3_is_public | run_3_load_done | run_3_published | run_3_size | run_3_srafile_1_alternative_1_access_type | run_3_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_3_srafile_1_alternative_1_org | run_3_srafile_1_alternative_1_url | run_3_srafile_1_alternative_2_access_type | run_3_srafile_1_alternative_2_free_egress | run_3_srafile_1_alternative_2_org | run_3_srafile_1_alternative_2_url | run_3_srafile_1_cluster | run_3_srafile_1_date | run_3_srafile_1_filename | run_3_srafile_1_md5 | run_3_srafile_1_semantic_name | run_3_srafile_1_size | run_3_srafile_1_sratoolkit | run_3_srafile_1_supertype | run_3_srafile_1_url | run_3_srafile_1_version | run_3_srafile_2_alternative_1_access_type | run_3_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_3_srafile_2_alternative_1_org | run_3_srafile_2_alternative_1_url | run_3_srafile_2_alternative_2_access_type | run_3_srafile_2_alternative_2_free_egress | run_3_srafile_2_alternative_2_org | run_3_srafile_2_alternative_2_url | run_3_srafile_2_cluster | run_3_srafile_2_date | run_3_srafile_2_filename | run_3_srafile_2_md5 | run_3_srafile_2_semantic_name | run_3_srafile_2_size | run_3_srafile_2_sratoolkit | run_3_srafile_2_supertype | run_3_srafile_2_url | run_3_srafile_2_version | run_3_srafile_3_alternative_1_access_type | run_3_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_3_srafile_3_alternative_1_org | run_3_srafile_3_alternative_1_url | run_3_srafile_3_alternative_2_access_type | run_3_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_3_srafile_3_alternative_2_org | run_3_srafile_3_alternative_2_url | run_3_srafile_3_alternative_3_access_type | run_3_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_3_srafile_3_alternative_3_org | run_3_srafile_3_alternative_3_url | run_3_srafile_3_cluster | run_3_srafile_3_date | run_3_srafile_3_filename | run_3_srafile_3_md5 | run_3_srafile_3_semantic_name | run_3_srafile_3_size | run_3_srafile_3_sratoolkit | run_3_srafile_3_supertype | run_3_srafile_3_url | run_3_srafile_3_version | run_3_srafile_4_alternative_1_access_type | run_3_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_3_srafile_4_alternative_1_org | run_3_srafile_4_alternative_1_url | run_3_srafile_4_alternative_2_access_type | run_3_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_3_srafile_4_alternative_2_org | run_3_srafile_4_alternative_2_url | run_3_srafile_4_alternative_3_access_type | run_3_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_3_srafile_4_alternative_3_org | run_3_srafile_4_alternative_3_url | run_3_srafile_4_cluster | run_3_srafile_4_date | run_3_srafile_4_filename | run_3_srafile_4_md5 | run_3_srafile_4_semantic_name | run_3_srafile_4_size | run_3_srafile_4_sratoolkit | run_3_srafile_4_supertype | run_3_srafile_4_url | run_3_srafile_4_version | run_3_srafile_5_alternative_1_access_type | run_3_srafile_5_alternative_1_free_egress | run_3_srafile_5_alternative_1_org | run_3_srafile_5_alternative_1_url | run_3_srafile_5_cluster | run_3_srafile_5_date | run_3_srafile_5_filename | run_3_srafile_5_md5 | run_3_srafile_5_semantic_name | run_3_srafile_5_size | run_3_srafile_5_sratoolkit | run_3_srafile_5_supertype | run_3_srafile_5_url | run_3_srafile_5_version | run_3_srafile_6_alternative_1_access_type | run_3_srafile_6_alternative_1_free_egress | run_3_srafile_6_alternative_1_org | run_3_srafile_6_alternative_1_url | run_3_srafile_6_alternative_2_access_type | run_3_srafile_6_alternative_2_free_egress | run_3_srafile_6_alternative_2_org | run_3_srafile_6_alternative_2_url | run_3_srafile_6_alternative_3_access_type | run_3_srafile_6_alternative_3_free_egress | run_3_srafile_6_alternative_3_org | run_3_srafile_6_alternative_3_url | run_3_srafile_6_cluster | run_3_srafile_6_date | run_3_srafile_6_filename | run_3_srafile_6_md5 | run_3_srafile_6_semantic_name | run_3_srafile_6_size | run_3_srafile_6_sratoolkit | run_3_srafile_6_supertype | run_3_srafile_6_url | run_3_srafile_6_version | run_3_static_data_available | run_3_total_base_count | run_3_total_base_cs_native | run_3_total_bases | run_3_total_spots | run_4_accession | run_4_alias | run_4_base_A_count | run_4_base_C_count | run_4_base_G_count | run_4_base_N_count | run_4_base_T_count | run_4_cloudfile_1_filetype | run_4_cloudfile_1_location | run_4_cloudfile_1_provider | run_4_cloudfile_2_filetype | run_4_cloudfile_2_location | run_4_cloudfile_2_provider | run_4_cloudfile_3_filetype | run_4_cloudfile_3_location | run_4_cloudfile_3_provider | run_4_cloudfile_4_filetype | run_4_cloudfile_4_location | run_4_cloudfile_4_provider | run_4_cluster_name | run_4_database_1 | run_4_has_taxanalysis | run_4_is_public | run_4_load_done | run_4_published | run_4_size | run_4_srafile_1_alternative_1_access_type | run_4_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_4_srafile_1_alternative_1_org | run_4_srafile_1_alternative_1_url | run_4_srafile_1_alternative_2_access_type | run_4_srafile_1_alternative_2_free_egress | run_4_srafile_1_alternative_2_org | run_4_srafile_1_alternative_2_url | run_4_srafile_1_cluster | run_4_srafile_1_date | run_4_srafile_1_filename | run_4_srafile_1_md5 | run_4_srafile_1_semantic_name | run_4_srafile_1_size | run_4_srafile_1_sratoolkit | run_4_srafile_1_supertype | run_4_srafile_1_url | run_4_srafile_1_version | run_4_srafile_2_alternative_1_access_type | run_4_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_4_srafile_2_alternative_1_org | run_4_srafile_2_alternative_1_url | run_4_srafile_2_alternative_2_access_type | run_4_srafile_2_alternative_2_free_egress | run_4_srafile_2_alternative_2_org | run_4_srafile_2_alternative_2_url | run_4_srafile_2_cluster | run_4_srafile_2_date | run_4_srafile_2_filename | run_4_srafile_2_md5 | run_4_srafile_2_semantic_name | run_4_srafile_2_size | run_4_srafile_2_sratoolkit | run_4_srafile_2_supertype | run_4_srafile_2_url | run_4_srafile_2_version | run_4_srafile_3_alternative_1_access_type | run_4_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_4_srafile_3_alternative_1_org | run_4_srafile_3_alternative_1_url | run_4_srafile_3_alternative_2_access_type | run_4_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_4_srafile_3_alternative_2_org | run_4_srafile_3_alternative_2_url | run_4_srafile_3_alternative_3_access_type | run_4_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_4_srafile_3_alternative_3_org | run_4_srafile_3_alternative_3_url | run_4_srafile_3_cluster | run_4_srafile_3_date | run_4_srafile_3_filename | run_4_srafile_3_md5 | run_4_srafile_3_semantic_name | run_4_srafile_3_size | run_4_srafile_3_sratoolkit | run_4_srafile_3_supertype | run_4_srafile_3_url | run_4_srafile_3_version | run_4_srafile_4_alternative_1_access_type | run_4_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_4_srafile_4_alternative_1_org | run_4_srafile_4_alternative_1_url | run_4_srafile_4_alternative_2_access_type | run_4_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_4_srafile_4_alternative_2_org | run_4_srafile_4_alternative_2_url | run_4_srafile_4_alternative_3_access_type | run_4_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_4_srafile_4_alternative_3_org | run_4_srafile_4_alternative_3_url | run_4_srafile_4_cluster | run_4_srafile_4_date | run_4_srafile_4_filename | run_4_srafile_4_md5 | run_4_srafile_4_semantic_name | run_4_srafile_4_size | run_4_srafile_4_sratoolkit | run_4_srafile_4_supertype | run_4_srafile_4_url | run_4_srafile_4_version | run_4_srafile_5_alternative_1_access_type | run_4_srafile_5_alternative_1_free_egress | run_4_srafile_5_alternative_1_org | run_4_srafile_5_alternative_1_url | run_4_srafile_5_cluster | run_4_srafile_5_date | run_4_srafile_5_filename | run_4_srafile_5_md5 | run_4_srafile_5_semantic_name | run_4_srafile_5_size | run_4_srafile_5_sratoolkit | run_4_srafile_5_supertype | run_4_srafile_5_url | run_4_srafile_5_version | run_4_srafile_6_alternative_1_access_type | run_4_srafile_6_alternative_1_free_egress | run_4_srafile_6_alternative_1_org | run_4_srafile_6_alternative_1_url | run_4_srafile_6_alternative_2_access_type | run_4_srafile_6_alternative_2_free_egress | run_4_srafile_6_alternative_2_org | run_4_srafile_6_alternative_2_url | run_4_srafile_6_alternative_3_access_type | run_4_srafile_6_alternative_3_free_egress | run_4_srafile_6_alternative_3_org | run_4_srafile_6_alternative_3_url | run_4_srafile_6_cluster | run_4_srafile_6_date | run_4_srafile_6_filename | run_4_srafile_6_md5 | run_4_srafile_6_semantic_name | run_4_srafile_6_size | run_4_srafile_6_sratoolkit | run_4_srafile_6_supertype | run_4_srafile_6_url | run_4_srafile_6_version | run_4_static_data_available | run_4_total_base_count | run_4_total_base_cs_native | run_4_total_bases | run_4_total_spots | run_5_accession | run_5_alias | run_5_base_A_count | run_5_base_C_count | run_5_base_G_count | run_5_base_N_count | run_5_base_T_count | run_5_cloudfile_1_filetype | run_5_cloudfile_1_location | run_5_cloudfile_1_provider | run_5_cloudfile_2_filetype | run_5_cloudfile_2_location | run_5_cloudfile_2_provider | run_5_cloudfile_3_filetype | run_5_cloudfile_3_location | run_5_cloudfile_3_provider | run_5_cloudfile_4_filetype | run_5_cloudfile_4_location | run_5_cloudfile_4_provider | run_5_cluster_name | run_5_database_1 | run_5_has_taxanalysis | run_5_is_public | run_5_load_done | run_5_published | run_5_size | run_5_srafile_1_alternative_1_access_type | run_5_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_5_srafile_1_alternative_1_org | run_5_srafile_1_alternative_1_url | run_5_srafile_1_cluster | run_5_srafile_1_date | run_5_srafile_1_filename | run_5_srafile_1_md5 | run_5_srafile_1_semantic_name | run_5_srafile_1_size | run_5_srafile_1_sratoolkit | run_5_srafile_1_supertype | run_5_srafile_1_version | run_5_srafile_2_alternative_1_access_type | run_5_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_5_srafile_2_alternative_1_org | run_5_srafile_2_alternative_1_url | run_5_srafile_2_cluster | run_5_srafile_2_date | run_5_srafile_2_filename | run_5_srafile_2_md5 | run_5_srafile_2_semantic_name | run_5_srafile_2_size | run_5_srafile_2_sratoolkit | run_5_srafile_2_supertype | run_5_srafile_2_url | run_5_srafile_2_version | run_5_srafile_3_alternative_1_access_type | run_5_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_5_srafile_3_alternative_1_org | run_5_srafile_3_alternative_1_url | run_5_srafile_3_alternative_2_access_type | run_5_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_5_srafile_3_alternative_2_org | run_5_srafile_3_alternative_2_url | run_5_srafile_3_alternative_3_access_type | run_5_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_5_srafile_3_alternative_3_org | run_5_srafile_3_alternative_3_url | run_5_srafile_3_cluster | run_5_srafile_3_date | run_5_srafile_3_filename | run_5_srafile_3_md5 | run_5_srafile_3_semantic_name | run_5_srafile_3_size | run_5_srafile_3_sratoolkit | run_5_srafile_3_supertype | run_5_srafile_3_url | run_5_srafile_3_version | run_5_srafile_4_alternative_1_access_type | run_5_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_5_srafile_4_alternative_1_org | run_5_srafile_4_alternative_1_url | run_5_srafile_4_alternative_2_access_type | run_5_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_5_srafile_4_alternative_2_org | run_5_srafile_4_alternative_2_url | run_5_srafile_4_alternative_3_access_type | run_5_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_5_srafile_4_alternative_3_org | run_5_srafile_4_alternative_3_url | run_5_srafile_4_cluster | run_5_srafile_4_date | run_5_srafile_4_filename | run_5_srafile_4_md5 | run_5_srafile_4_semantic_name | run_5_srafile_4_size | run_5_srafile_4_sratoolkit | run_5_srafile_4_supertype | run_5_srafile_4_url | run_5_srafile_4_version | run_5_static_data_available | run_5_total_base_count | run_5_total_base_cs_native | run_5_total_bases | run_5_total_spots | run_6_accession | run_6_alias | run_6_base_A_count | run_6_base_C_count | run_6_base_G_count | run_6_base_N_count | run_6_base_T_count | run_6_cloudfile_1_filetype | run_6_cloudfile_1_location | run_6_cloudfile_1_provider | run_6_cloudfile_2_filetype | run_6_cloudfile_2_location | run_6_cloudfile_2_provider | run_6_cloudfile_3_filetype | run_6_cloudfile_3_location | run_6_cloudfile_3_provider | run_6_cloudfile_4_filetype | run_6_cloudfile_4_location | run_6_cloudfile_4_provider | run_6_cluster_name | run_6_database_1 | run_6_has_taxanalysis | run_6_is_public | run_6_load_done | run_6_published | run_6_size | run_6_srafile_1_alternative_1_access_type | run_6_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_6_srafile_1_alternative_1_org | run_6_srafile_1_alternative_1_url | run_6_srafile_1_cluster | run_6_srafile_1_date | run_6_srafile_1_filename | run_6_srafile_1_md5 | run_6_srafile_1_semantic_name | run_6_srafile_1_size | run_6_srafile_1_sratoolkit | run_6_srafile_1_supertype | run_6_srafile_1_version | run_6_srafile_2_alternative_1_access_type | run_6_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_6_srafile_2_alternative_1_org | run_6_srafile_2_alternative_1_url | run_6_srafile_2_cluster | run_6_srafile_2_date | run_6_srafile_2_filename | run_6_srafile_2_md5 | run_6_srafile_2_semantic_name | run_6_srafile_2_size | run_6_srafile_2_sratoolkit | run_6_srafile_2_supertype | run_6_srafile_2_url | run_6_srafile_2_version | run_6_srafile_3_alternative_1_access_type | run_6_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_6_srafile_3_alternative_1_org | run_6_srafile_3_alternative_1_url | run_6_srafile_3_alternative_2_access_type | run_6_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_6_srafile_3_alternative_2_org | run_6_srafile_3_alternative_2_url | run_6_srafile_3_alternative_3_access_type | run_6_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_6_srafile_3_alternative_3_org | run_6_srafile_3_alternative_3_url | run_6_srafile_3_cluster | run_6_srafile_3_date | run_6_srafile_3_filename | run_6_srafile_3_md5 | run_6_srafile_3_semantic_name | run_6_srafile_3_size | run_6_srafile_3_sratoolkit | run_6_srafile_3_supertype | run_6_srafile_3_url | run_6_srafile_3_version | run_6_srafile_4_alternative_1_access_type | run_6_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_6_srafile_4_alternative_1_org | run_6_srafile_4_alternative_1_url | run_6_srafile_4_alternative_2_access_type | run_6_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_6_srafile_4_alternative_2_org | run_6_srafile_4_alternative_2_url | run_6_srafile_4_alternative_3_access_type | run_6_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_6_srafile_4_alternative_3_org | run_6_srafile_4_alternative_3_url | run_6_srafile_4_cluster | run_6_srafile_4_date | run_6_srafile_4_filename | run_6_srafile_4_md5 | run_6_srafile_4_semantic_name | run_6_srafile_4_size | run_6_srafile_4_sratoolkit | run_6_srafile_4_supertype | run_6_srafile_4_url | run_6_srafile_4_version | run_6_static_data_available | run_6_total_base_count | run_6_total_base_cs_native | run_6_total_bases | run_6_total_spots | run_7_accession | run_7_alias | run_7_base_A_count | run_7_base_C_count | run_7_base_G_count | run_7_base_N_count | run_7_base_T_count | run_7_cloudfile_1_filetype | run_7_cloudfile_1_location | run_7_cloudfile_1_provider | run_7_cloudfile_2_filetype | run_7_cloudfile_2_location | run_7_cloudfile_2_provider | run_7_cloudfile_3_filetype | run_7_cloudfile_3_location | run_7_cloudfile_3_provider | run_7_cloudfile_4_filetype | run_7_cloudfile_4_location | run_7_cloudfile_4_provider | run_7_cluster_name | run_7_database_1 | run_7_has_taxanalysis | run_7_is_public | run_7_load_done | run_7_published | run_7_size | run_7_srafile_1_alternative_1_access_type | run_7_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_7_srafile_1_alternative_1_org | run_7_srafile_1_alternative_1_url | run_7_srafile_1_cluster | run_7_srafile_1_date | run_7_srafile_1_filename | run_7_srafile_1_md5 | run_7_srafile_1_semantic_name | run_7_srafile_1_size | run_7_srafile_1_sratoolkit | run_7_srafile_1_supertype | run_7_srafile_1_version | run_7_srafile_2_alternative_1_access_type | run_7_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_7_srafile_2_alternative_1_org | run_7_srafile_2_alternative_1_url | run_7_srafile_2_cluster | run_7_srafile_2_date | run_7_srafile_2_filename | run_7_srafile_2_md5 | run_7_srafile_2_semantic_name | run_7_srafile_2_size | run_7_srafile_2_sratoolkit | run_7_srafile_2_supertype | run_7_srafile_2_url | run_7_srafile_2_version | run_7_srafile_3_alternative_1_access_type | run_7_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_7_srafile_3_alternative_1_org | run_7_srafile_3_alternative_1_url | run_7_srafile_3_alternative_2_access_type | run_7_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_7_srafile_3_alternative_2_org | run_7_srafile_3_alternative_2_url | run_7_srafile_3_alternative_3_access_type | run_7_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_7_srafile_3_alternative_3_org | run_7_srafile_3_alternative_3_url | run_7_srafile_3_cluster | run_7_srafile_3_date | run_7_srafile_3_filename | run_7_srafile_3_md5 | run_7_srafile_3_semantic_name | run_7_srafile_3_size | run_7_srafile_3_sratoolkit | run_7_srafile_3_supertype | run_7_srafile_3_url | run_7_srafile_3_version | run_7_srafile_4_alternative_1_access_type | run_7_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_7_srafile_4_alternative_1_org | run_7_srafile_4_alternative_1_url | run_7_srafile_4_alternative_2_access_type | run_7_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_7_srafile_4_alternative_2_org | run_7_srafile_4_alternative_2_url | run_7_srafile_4_alternative_3_access_type | run_7_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_7_srafile_4_alternative_3_org | run_7_srafile_4_alternative_3_url | run_7_srafile_4_cluster | run_7_srafile_4_date | run_7_srafile_4_filename | run_7_srafile_4_md5 | run_7_srafile_4_semantic_name | run_7_srafile_4_size | run_7_srafile_4_sratoolkit | run_7_srafile_4_supertype | run_7_srafile_4_url | run_7_srafile_4_version | run_7_static_data_available | run_7_total_base_count | run_7_total_base_cs_native | run_7_total_bases | run_7_total_spots | run_8_accession | run_8_alias | run_8_base_A_count | run_8_base_C_count | run_8_base_G_count | run_8_base_N_count | run_8_base_T_count | run_8_cloudfile_1_filetype | run_8_cloudfile_1_location | run_8_cloudfile_1_provider | run_8_cloudfile_2_filetype | run_8_cloudfile_2_location | run_8_cloudfile_2_provider | run_8_cloudfile_3_filetype | run_8_cloudfile_3_location | run_8_cloudfile_3_provider | run_8_cloudfile_4_filetype | run_8_cloudfile_4_location | run_8_cloudfile_4_provider | run_8_cluster_name | run_8_database_1 | run_8_has_taxanalysis | run_8_is_public | run_8_load_done | run_8_published | run_8_size | run_8_srafile_1_alternative_1_access_type | run_8_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_8_srafile_1_alternative_1_org | run_8_srafile_1_alternative_1_url | run_8_srafile_1_cluster | run_8_srafile_1_date | run_8_srafile_1_filename | run_8_srafile_1_md5 | run_8_srafile_1_semantic_name | run_8_srafile_1_size | run_8_srafile_1_sratoolkit | run_8_srafile_1_supertype | run_8_srafile_1_version | run_8_srafile_2_alternative_1_access_type | run_8_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_8_srafile_2_alternative_1_org | run_8_srafile_2_alternative_1_url | run_8_srafile_2_cluster | run_8_srafile_2_date | run_8_srafile_2_filename | run_8_srafile_2_md5 | run_8_srafile_2_semantic_name | run_8_srafile_2_size | run_8_srafile_2_sratoolkit | run_8_srafile_2_supertype | run_8_srafile_2_url | run_8_srafile_2_version | run_8_srafile_3_alternative_1_access_type | run_8_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_8_srafile_3_alternative_1_org | run_8_srafile_3_alternative_1_url | run_8_srafile_3_alternative_2_access_type | run_8_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_8_srafile_3_alternative_2_org | run_8_srafile_3_alternative_2_url | run_8_srafile_3_alternative_3_access_type | run_8_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_8_srafile_3_alternative_3_org | run_8_srafile_3_alternative_3_url | run_8_srafile_3_cluster | run_8_srafile_3_date | run_8_srafile_3_filename | run_8_srafile_3_md5 | run_8_srafile_3_semantic_name | run_8_srafile_3_size | run_8_srafile_3_sratoolkit | run_8_srafile_3_supertype | run_8_srafile_3_url | run_8_srafile_3_version | run_8_srafile_4_alternative_1_access_type | run_8_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_8_srafile_4_alternative_1_org | run_8_srafile_4_alternative_1_url | run_8_srafile_4_alternative_2_access_type | run_8_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_8_srafile_4_alternative_2_org | run_8_srafile_4_alternative_2_url | run_8_srafile_4_alternative_3_access_type | run_8_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_8_srafile_4_alternative_3_org | run_8_srafile_4_alternative_3_url | run_8_srafile_4_cluster | run_8_srafile_4_date | run_8_srafile_4_filename | run_8_srafile_4_md5 | run_8_srafile_4_semantic_name | run_8_srafile_4_size | run_8_srafile_4_sratoolkit | run_8_srafile_4_supertype | run_8_srafile_4_url | run_8_srafile_4_version | run_8_static_data_available | run_8_total_base_count | run_8_total_base_cs_native | run_8_total_bases | run_8_total_spots | run_9_accession | run_9_alias | run_9_base_A_count | run_9_base_C_count | run_9_base_G_count | run_9_base_N_count | run_9_base_T_count | run_9_cloudfile_1_filetype | run_9_cloudfile_1_location | run_9_cloudfile_1_provider | run_9_cloudfile_2_filetype | run_9_cloudfile_2_location | run_9_cloudfile_2_provider | run_9_cloudfile_3_filetype | run_9_cloudfile_3_location | run_9_cloudfile_3_provider | run_9_cloudfile_4_filetype | run_9_cloudfile_4_location | run_9_cloudfile_4_provider | run_9_cluster_name | run_9_database_1 | run_9_has_taxanalysis | run_9_is_public | run_9_load_done | run_9_published | run_9_size | run_9_srafile_1_alternative_1_access_type | run_9_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_9_srafile_1_alternative_1_org | run_9_srafile_1_alternative_1_url | run_9_srafile_1_cluster | run_9_srafile_1_date | run_9_srafile_1_filename | run_9_srafile_1_md5 | run_9_srafile_1_semantic_name | run_9_srafile_1_size | run_9_srafile_1_sratoolkit | run_9_srafile_1_supertype | run_9_srafile_1_version | run_9_srafile_2_alternative_1_access_type | run_9_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_9_srafile_2_alternative_1_org | run_9_srafile_2_alternative_1_url | run_9_srafile_2_cluster | run_9_srafile_2_date | run_9_srafile_2_filename | run_9_srafile_2_md5 | run_9_srafile_2_semantic_name | run_9_srafile_2_size | run_9_srafile_2_sratoolkit | run_9_srafile_2_supertype | run_9_srafile_2_url | run_9_srafile_2_version | run_9_srafile_3_alternative_1_access_type | run_9_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_9_srafile_3_alternative_1_org | run_9_srafile_3_alternative_1_url | run_9_srafile_3_alternative_2_access_type | run_9_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_9_srafile_3_alternative_2_org | run_9_srafile_3_alternative_2_url | run_9_srafile_3_alternative_3_access_type | run_9_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_9_srafile_3_alternative_3_org | run_9_srafile_3_alternative_3_url | run_9_srafile_3_cluster | run_9_srafile_3_date | run_9_srafile_3_filename | run_9_srafile_3_md5 | run_9_srafile_3_semantic_name | run_9_srafile_3_size | run_9_srafile_3_sratoolkit | run_9_srafile_3_supertype | run_9_srafile_3_url | run_9_srafile_3_version | run_9_srafile_4_alternative_1_access_type | run_9_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_9_srafile_4_alternative_1_org | run_9_srafile_4_alternative_1_url | run_9_srafile_4_alternative_2_access_type | run_9_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_9_srafile_4_alternative_2_org | run_9_srafile_4_alternative_2_url | run_9_srafile_4_alternative_3_access_type | run_9_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_9_srafile_4_alternative_3_org | run_9_srafile_4_alternative_3_url | run_9_srafile_4_cluster | run_9_srafile_4_date | run_9_srafile_4_filename | run_9_srafile_4_md5 | run_9_srafile_4_semantic_name | run_9_srafile_4_size | run_9_srafile_4_sratoolkit | run_9_srafile_4_supertype | run_9_srafile_4_url | run_9_srafile_4_version | run_9_static_data_available | run_9_total_base_count | run_9_total_base_cs_native | run_9_total_bases | run_9_total_spots | run_set_bases | run_set_bytes | run_set_runs | run_set_spots | sample_attributes_10_tag | sample_attributes_10_value | sample_attributes_11_tag | sample_attributes_11_value | sample_attributes_12_tag | sample_attributes_12_value | sample_attributes_13_tag | sample_attributes_13_value | sample_attributes_14_tag | sample_attributes_14_value | sample_attributes_15_tag | sample_attributes_15_value | sample_attributes_16_tag | sample_attributes_16_value | sample_attributes_17_tag | sample_attributes_17_value | sample_attributes_18_tag | sample_attributes_18_value | sample_attributes_19_tag | sample_attributes_19_value | sample_attributes_1_tag | sample_attributes_1_value | sample_attributes_20_tag | sample_attributes_20_value | sample_attributes_21_tag | sample_attributes_21_value | sample_attributes_22_tag | sample_attributes_22_value | sample_attributes_23_tag | sample_attributes_23_value | sample_attributes_24_tag | sample_attributes_24_value | sample_attributes_25_tag | sample_attributes_25_value | sample_attributes_26_tag | sample_attributes_26_value | sample_attributes_27_tag | sample_attributes_27_value | sample_attributes_28_tag | sample_attributes_28_value | sample_attributes_29_tag | sample_attributes_29_value | sample_attributes_2_tag | sample_attributes_2_value | sample_attributes_3_tag | sample_attributes_3_value | sample_attributes_4_tag | sample_attributes_4_value | sample_attributes_5_tag | sample_attributes_5_value | sample_attributes_6_tag | sample_attributes_6_value | sample_attributes_7_tag | sample_attributes_7_value | sample_attributes_8_tag | sample_attributes_8_value | sample_attributes_9_tag | sample_attributes_9_value | sample_external_id_1 | sample_external_id_1_namespace | sample_link_1_type | sample_link_1_value_1 | sample_link_1_value_2 | sample_link_1_value_3 | sample_title | study_alias | study_attributes_1_tag | study_attributes_1_value | study_center_name | study_center_project_name | study_external_id_1 | study_external_id_1_namespace | study_link_1_type | study_link_1_value_1 | study_link_1_value_2 | study_study_abstract | study_study_title | study_study_type_existing_study_type | submission_accession | submission_alias | submission_center_name | submission_lab_name |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 0 | SRP707097 | SRX33769166 | GSM9789190: Sublibrary1 pool of all samples; Drosophila melanogaster; RNA-Seq | 7227 | Drosophila melanogaster | RNA-Seq | TRANSCRIPTOMIC SINGLE CELL | cDNA | SRS29437478 | GSM9789190 | Illumina NovaSeq X Plus | 757442225 | 74790189218 | SRR39012693 | 757442225 | 227232667500 | GSM9789190_r1 | GSM9789190 | GSM9789190_r1 | GEO | Nuclei isolation was performed using protocols adapted from McLaughlin et al., 2022. Frozen fly ... | GSM9789190 | ILLUMINA | SRS29437478 | PAIRED | SAMN60635700 | SRS29437478 | 227232667500 | NaN | Drosophila melanogaster | GSM9789190 | Sublibrary1 pool of all samples | 7227 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | GSM9789190_r1 | 63792519757 | 49127840823 | 48151238176 | 49700674 | 66111368070 | fastq | s3.us-east-1 | s3 | run | s3.us-east-1 | s3 | run.zq | gs.us-east1 | gs | run.zq | s3.us-east-1 | s3 | public | <Database><Table name="SEQUENCE"><Statistics source="meta"><Rows count="757442225" /><Elements c... | 1 | true | true | 2026-06-22 00:00:18 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-6/SRR39012693/Sub1_S1_R1_001.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-06-05 09:38:27 | Sub1_S1_R1_001.fastq.gz | 15937edbab454f6a0875613da4c1e6bf | fastq | 47847286535 | 0 | Original | NaN | 1 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-6/SRR39012693/Sub1_S1_R2_001.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-06-05 09:40:28 | Sub1_S1_R2_001.fastq.gz | 9744489207c529da4569bff3ba3b95e3 | fastq | 60763811392 | 0 | Original | NaN | 1 | anonymous | worldwide | AWS | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR39012693/SRR39012693 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-06-05 10:57:03 | SRR39012693 | a5c6e6871a33efd1ecaf2d8dddac4a3d | SRA Normalized | 74790191431 | 1 | Primary ETL | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR39012693/SRR39012693 | 1 | anonymous | worldwide | NCBI | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos10/sra-pub-zq-1002/SRR039/39012/SRR39012693/SRR3... | aws identity | s3.us-east-1 | AWS | s3://sra-pub-zq-5/SRR39012693/SRR39012693.lite.1 | gcp identity | gs.us-east1 | GCP | gs://sra-pub-zq-102/SRR39012693/SRR39012693.lite.1 | public | 2026-06-05 13:19:18 | SRR39012693.lite | 8b2736b4cda1804e256866a238156a04 | SRA Lite | 57238158235 | 1 | Primary ETL | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos10/sra-pub-zq-1002/SRR039/39012/SRR39012693/SRR3... | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 1 | 227232667500 | false | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 227232667500 | 74790189218 | 1 | 757442225 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | source_name | Abdomen | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | tissue | Abdomen | cell line | 7 days | cell type | Male | genotype | to>Cas9 and to>perCRISPR | treatment | CT0 and CT12 | geo_loc_name | missing | collection_date | missing | NaN | NaN | SAMN60635700 | BioSample | XREF_LINK | DB: bioproject | ID: 1475286 | LABEL: PRJNA1475286 | Sublibrary1 pool of all samples | GSE334463 | NaN | NaN | GEO | GSE334463 | PRJNA1475286 | BioProject | NaN | NaN | NaN | If GEO accession GSE334463 has been cited in a publication, please notify us at geo@ncbi.nlm.nih... | GEO accession GSE334463 is currently private and is scheduled to be released on Jun 22, 2026. | Transcriptome Analysis | SRA2448285 | SUB16243102 | Biology, Loyola University Chicago | NaN |
| 1 | SRP707097 | SRX33769165 | GSM9789191: Sublibrary2 pool of all samples; Drosophila melanogaster; RNA-Seq | 7227 | Drosophila melanogaster | RNA-Seq | TRANSCRIPTOMIC SINGLE CELL | cDNA | SRS29437477 | GSM9789191 | Illumina NovaSeq X Plus | 706196734 | 69726355352 | SRR39012694 | 706196734 | 211859020200 | GSM9789191_r1 | GSM9789191 | GSM9789191_r1 | GEO | Nuclei isolation was performed using protocols adapted from McLaughlin et al., 2022. Frozen fly ... | GSM9789191 | ILLUMINA | SRS29437477 | PAIRED | SAMN60635699 | SRS29437477 | 211859020200 | NaN | Drosophila melanogaster | GSM9789191 | Sublibrary2 pool of all samples | 7227 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | GSM9789191_r1 | 59399552064 | 45979874416 | 45280212235 | 46407625 | 61152973860 | fastq | s3.us-east-1 | s3 | run | s3.us-east-1 | s3 | run.zq | gs.us-east1 | gs | run.zq | s3.us-east-1 | s3 | public | <Database><Table name="SEQUENCE"><Statistics source="meta"><Rows count="706196734" /><Elements c... | 1 | true | true | 2026-06-22 00:00:18 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-6/SRR39012694/Sub2_S2_R1_001.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-06-05 09:26:09 | Sub2_S2_R1_001.fastq.gz | 18626408cefc9f32314e37fce2db7c6b | fastq | 44265544193 | 0 | Original | NaN | 1 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-6/SRR39012694/Sub2_S2_R2_001.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-06-05 09:28:04 | Sub2_S2_R2_001.fastq.gz | ba5c8c64f0b00e256fe1d9c838d0c198 | fastq | 56485474973 | 0 | Original | NaN | 1 | anonymous | worldwide | AWS | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR39012694/SRR39012694 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-06-05 10:48:51 | SRR39012694 | 9add8b4e7d879a2dea1d6e2b3c6f087c | SRA Normalized | 69726357575 | 1 | Primary ETL | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR39012694/SRR39012694 | 1 | anonymous | worldwide | NCBI | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos10/sra-pub-zq-1002/SRR039/39012/SRR39012694/SRR3... | aws identity | s3.us-east-1 | AWS | s3://sra-pub-zq-5/SRR39012694/SRR39012694.lite.1 | gcp identity | gs.us-east1 | GCP | gs://sra-pub-zq-102/SRR39012694/SRR39012694.lite.1 | public | 2026-06-05 12:00:39 | SRR39012694.lite | a0d6da86e86747cceceb28b1c6fae425 | SRA Lite | 53383310715 | 1 | Primary ETL | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos10/sra-pub-zq-1002/SRR039/39012/SRR39012694/SRR3... | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 1 | 211859020200 | false | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 211859020200 | 69726355352 | 1 | 706196734 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | source_name | Abdomen | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | tissue | Abdomen | cell line | 7 days | cell type | Male | genotype | to>Cas9 and to>perCRISPR | treatment | CT0 and CT12 | geo_loc_name | missing | collection_date | missing | NaN | NaN | SAMN60635699 | BioSample | XREF_LINK | DB: bioproject | ID: 1475286 | LABEL: PRJNA1475286 | Sublibrary2 pool of all samples | GSE334463 | NaN | NaN | GEO | GSE334463 | PRJNA1475286 | BioProject | NaN | NaN | NaN | If GEO accession GSE334463 has been cited in a publication, please notify us at geo@ncbi.nlm.nih... | GEO accession GSE334463 is currently private and is scheduled to be released on Jun 22, 2026. | Transcriptome Analysis | SRA2448285 | SUB16243102 | Biology, Loyola University Chicago | NaN |
| 2 | SRP704119 | SRX33627756 | GSM9764206: Parse Evercode WT scRNA-seq — mouse CD11b+ myeloid, shLOX KD rep 3 (shLOX-I-3); Mus ... | 10090 | Mus musculus | RNA-Seq | TRANSCRIPTOMIC | cDNA | SRS29315848 | GSM9764206 | Illumina NovaSeq X Plus | NaN | 3824138760 | SRR38858729 | 39461243 | 11838372900 | GSM9764206_r1 | GSM9764206 | GSM9764206_r1 | GEO | Tumors were excised at week 7 post-implantation, minced with blades, and enzymatically dissociat... | GSM9764206 | ILLUMINA | SRS29315848 | PAIRED | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | GSM9764206_r1 | 2969186697 | 2710271640 | 3053255949 | 479915 | 3105178699 | fastq | s3.us-east-1 | s3 | run | s3.us-east-1 | s3 | run.zq | gs.us-east1 | gs | run.zq | s3.us-east-1 | s3 | public | <Database><Table name="SEQUENCE"><Statistics source="meta"><Rows count="39461243" /><Elements co... | 1 | true | true | 2026-05-29 00:46:44 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-3/SRR38858729/group_shLOX-I-3_R1.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-05-27 12:33:10 | group_shLOX-I-3_R1.fastq.gz | d642fd2693861a0fed329c33cb16fc2b | fastq | 2286238099 | 0 | Original | NaN | 1 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-3/SRR38858729/group_shLOX-I-3_R2.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-05-27 12:33:21 | group_shLOX-I-3_R2.fastq.gz | 61d5d59ba0e7d80fe9b13bf8102d9dde | fastq | 2585914418 | 0 | Original | NaN | 1 | anonymous | worldwide | AWS | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR38858729/SRR38858729 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-05-27 12:32:59 | SRR38858729 | 98e949a1a9888281956ed7a2f0ecca2c | SRA Normalized | 3824141275 | 1 | Primary ETL | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR38858729/SRR38858729 | 1 | anonymous | worldwide | NCBI | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos10/sra-pub-zq-1002/SRR038/38858/SRR38858729/SRR3... | aws identity | s3.us-east-1 | AWS | s3://sra-pub-zq-4/SRR38858729/SRR38858729.sralite.1 | gcp identity | gs.us-east1 | GCP | gs://sra-pub-zq-102/SRR38858729/SRR38858729.sralite.1 | public | 2026-05-27 12:36:11 | SRR38858729.sralite | 7309c11fb22e4fef8521e327521a4a73 | SRA Lite | 3055560599 | 1 | Primary ETL | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos10/sra-pub-zq-1002/SRR038/38858/SRR38858729/SRR3... | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 1 | 11838372900 | false | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 11838372900 | 3824138760 | 1 | 39461243 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | source_name | subcutaneous tumor xenograft (CD11b+ tumor-infiltrating myeloid fraction, Rag1-/- host) | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | tissue | subcutaneous tumor xenograft (CD11b+ tumor-infiltrating myeloid fraction, Rag1-/- host) | cell line | primary cells (no cell line) | cell type | CD11b+ tumor-associated myeloid cells (mouse host) | genotype | Rag1-/- host (B6.129S7-Rag1tm1Mom/J); paired tumor genotype = MCF10DCIS.com + pLKO-LOX shRNA | treatment | CD11b+ tumor-associated myeloid cells host-infiltrated into the matched xenograft tumor (mouse 1... | batch | S1_WT_A1+S2_WT_B1+S3_WT_C1+S4_WT_D1+S5_WT_E1+S6_WT_F1+S7_WT_G1+S8_WT_H1 | geo_loc_name | missing | collection_date | missing | SAMN60438900 | BioSample | XREF_LINK | DB: bioproject | ID: 1471051 | LABEL: PRJNA1471051 | Parse Evercode WT scRNA-seq — mouse CD11b+ myeloid, shLOX KD rep 3 (shLOX-I-3) | GSE333415 | NaN | NaN | GEO | GSE333415 | PRJNA1471051 | BioProject | NaN | NaN | NaN | If GEO accession GSE333415 has been cited in a publication, please notify us at geo@ncbi.nlm.nih... | GEO accession GSE333415 is currently private and is scheduled to be released on May 26, 2027. | Other | SRA2407412 | SUB16214634 | Department of Pathology, UT Southwestern Medical Center | NaN |
| 3 | SRP704119 | SRX33627755 | GSM9764203: Parse Evercode WT scRNA-seq — mouse CD11b+ myeloid, pLKO ctrl rep 2 (pLKO-I-2); Mus ... | 10090 | Mus musculus | RNA-Seq | TRANSCRIPTOMIC | cDNA | SRS29315846 | GSM9764203 | Illumina NovaSeq X Plus | NaN | 6107086070 | SRR38858730 | 62881351 | 18864405300 | GSM9764203_r1 | GSM9764203 | GSM9764203_r1 | GEO | Tumors were excised at week 7 post-implantation, minced with blades, and enzymatically dissociat... | GSM9764203 | ILLUMINA | SRS29315846 | PAIRED | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | GSM9764203_r1 | 4665123017 | 4364347155 | 4918244583 | 761069 | 4915929476 | fastq | s3.us-east-1 | s3 | run | s3.us-east-1 | s3 | run.zq | gs.us-east1 | gs | run.zq | s3.us-east-1 | s3 | public | <Database><Table name="SEQUENCE"><Statistics source="meta"><Rows count="62881351" /><Elements co... | 1 | true | true | 2026-05-29 00:46:44 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-3/SRR38858730/group_pLKO-I-2_R1.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-05-27 12:41:57 | group_pLKO-I-2_R1.fastq.gz | 840bb86ad831d90735ae15a3eb2f516f | fastq | 3732666774 | 0 | Original | NaN | 1 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-3/SRR38858730/group_pLKO-I-2_R2.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-05-27 12:42:14 | group_pLKO-I-2_R2.fastq.gz | 8a9fdc034cef6eded459576c019bec8a | fastq | 4179975869 | 0 | Original | NaN | 1 | anonymous | worldwide | AWS | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR38858730/SRR38858730 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-05-27 12:41:38 | SRR38858730 | 10256a0755831c6a3db12cf0e779b4c0 | SRA Normalized | 6107088584 | 1 | Primary ETL | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR38858730/SRR38858730 | 1 | anonymous | worldwide | NCBI | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos10/sra-pub-zq-1002/SRR038/38858/SRR38858730/SRR3... | aws identity | s3.us-east-1 | AWS | s3://sra-pub-zq-4/SRR38858730/SRR38858730.sralite.1 | gcp identity | gs.us-east1 | GCP | gs://sra-pub-zq-102/SRR38858730/SRR38858730.sralite.1 | public | 2026-05-27 12:45:56 | SRR38858730.sralite | 80593d465c07e31c26170aa7e813e95a | SRA Lite | 4866276528 | 1 | Primary ETL | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos10/sra-pub-zq-1002/SRR038/38858/SRR38858730/SRR3... | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 1 | 18864405300 | false | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 18864405300 | 6107086070 | 1 | 62881351 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | source_name | subcutaneous tumor xenograft (CD11b+ tumor-infiltrating myeloid fraction, Rag1-/- host) | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | tissue | subcutaneous tumor xenograft (CD11b+ tumor-infiltrating myeloid fraction, Rag1-/- host) | cell line | primary cells (no cell line) | cell type | CD11b+ tumor-associated myeloid cells (mouse host) | genotype | Rag1-/- host (B6.129S7-Rag1tm1Mom/J); paired tumor genotype = MCF10DCIS.com + pLKO empty-vector | treatment | CD11b+ tumor-associated myeloid cells host-infiltrated into the matched xenograft tumor (mouse 1... | batch | S1_WT_A1+S2_WT_B1+S3_WT_C1+S4_WT_D1+S5_WT_E1+S6_WT_F1+S7_WT_G1+S8_WT_H1 | geo_loc_name | missing | collection_date | missing | SAMN60438903 | BioSample | XREF_LINK | DB: bioproject | ID: 1471051 | LABEL: PRJNA1471051 | Parse Evercode WT scRNA-seq — mouse CD11b+ myeloid, pLKO ctrl rep 2 (pLKO-I-2) | GSE333415 | NaN | NaN | GEO | GSE333415 | PRJNA1471051 | BioProject | NaN | NaN | NaN | If GEO accession GSE333415 has been cited in a publication, please notify us at geo@ncbi.nlm.nih... | GEO accession GSE333415 is currently private and is scheduled to be released on May 26, 2027. | Other | SRA2407412 | SUB16214634 | Department of Pathology, UT Southwestern Medical Center | NaN |
| 4 | SRP704119 | SRX33627754 | GSM9764204: Parse Evercode WT scRNA-seq — mouse CD11b+ myeloid, shLOX KD rep 2 (shLOX-I-2); Mus ... | 10090 | Mus musculus | RNA-Seq | TRANSCRIPTOMIC | cDNA | SRS29315847 | GSM9764204 | Illumina NovaSeq X Plus | 132338886 | 12861194868 | SRR38858731 | 132338886 | 39701665800 | GSM9764204_r1 | GSM9764204 | GSM9764204_r1 | GEO | Tumors were excised at week 7 post-implantation, minced with blades, and enzymatically dissociat... | GSM9764204 | ILLUMINA | SRS29315847 | PAIRED | SAMN60438902 | SRS29315847 | 39701665800 | NaN | Mus musculus | GSM9764204 | Parse Evercode WT scRNA-seq — mouse CD11b+ myeloid, shLOX KD rep 2 (shLOX-I-2) | 10090 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | GSM9764204_r1 | 9848477455 | 9134648047 | 10218722366 | 1602151 | 10498215781 | fastq | s3.us-east-1 | s3 | run | s3.us-east-1 | s3 | run.zq | gs.us-east1 | gs | run.zq | s3.us-east-1 | s3 | public | <Database><Table name="SEQUENCE"><Statistics source="meta"><Rows count="132338886" /><Elements c... | 1 | true | true | 2026-05-29 00:46:44 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-9/SRR38858731/group_shLOX-I-2_R1.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-05-27 10:21:25 | group_shLOX-I-2_R1.fastq.gz | bbc602fea680376df6f22c545abc3fbe | fastq | 7674767876 | 0 | Original | NaN | 1 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-9/SRR38858731/group_shLOX-I-2_R2.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-05-27 10:21:37 | group_shLOX-I-2_R2.fastq.gz | eee9476ca32f0344a9797f7a78782682 | fastq | 8696556121 | 0 | Original | NaN | 1 | anonymous | worldwide | AWS | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR38858731/SRR38858731 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-05-27 10:36:28 | SRR38858731 | de8261aeb4e3ce252fe0feeaef695d2b | SRA Normalized | 12861197388 | 1 | Primary ETL | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR38858731/SRR38858731 | 1 | anonymous | worldwide | NCBI | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos10/sra-pub-zq-1002/SRR038/38858/SRR38858731/SRR3... | aws identity | s3.us-east-1 | AWS | s3://sra-pub-zq-4/SRR38858731/SRR38858731.lite.1 | gcp identity | gs.us-east1 | GCP | gs://sra-pub-zq-102/SRR38858731/SRR38858731.lite.1 | public | 2026-05-27 11:06:07 | SRR38858731.lite | 60f6d8fdbd776caa1f6d051d4217afc1 | SRA Lite | 10230843044 | 1 | Primary ETL | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos10/sra-pub-zq-1002/SRR038/38858/SRR38858731/SRR3... | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 1 | 39701665800 | false | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 39701665800 | 12861194868 | 1 | 132338886 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | source_name | subcutaneous tumor xenograft (CD11b+ tumor-infiltrating myeloid fraction, Rag1-/- host) | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | tissue | subcutaneous tumor xenograft (CD11b+ tumor-infiltrating myeloid fraction, Rag1-/- host) | cell line | primary cells (no cell line) | cell type | CD11b+ tumor-associated myeloid cells (mouse host) | genotype | Rag1-/- host (B6.129S7-Rag1tm1Mom/J); paired tumor genotype = MCF10DCIS.com + pLKO-LOX shRNA | treatment | CD11b+ tumor-associated myeloid cells host-infiltrated into the matched xenograft tumor (mouse 1... | batch | S1_WT_A1+S2_WT_B1+S3_WT_C1+S4_WT_D1+S5_WT_E1+S6_WT_F1+S7_WT_G1+S8_WT_H1 | geo_loc_name | missing | collection_date | missing | SAMN60438902 | BioSample | XREF_LINK | DB: bioproject | ID: 1471051 | LABEL: PRJNA1471051 | Parse Evercode WT scRNA-seq — mouse CD11b+ myeloid, shLOX KD rep 2 (shLOX-I-2) | GSE333415 | NaN | NaN | GEO | GSE333415 | PRJNA1471051 | BioProject | NaN | NaN | NaN | If GEO accession GSE333415 has been cited in a publication, please notify us at geo@ncbi.nlm.nih... | GEO accession GSE333415 is currently private and is scheduled to be released on May 26, 2027. | Other | SRA2407412 | SUB16214634 | Department of Pathology, UT Southwestern Medical Center | NaN |
| ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... |
| 495 | SRP544328 | SRX26680204 | GSM8623047: Day 40, sublibrary 7; Homo sapiens; RNA-Seq | 9606 | Homo sapiens | RNA-Seq | TRANSCRIPTOMIC SINGLE CELL | cDNA | SRS23173067 | GSM8623047 | Illumina NovaSeq 6000 | 7210405 | 776989606 | SRR31302048 | 7210405 | 2163121500 | GSM8623047_r1 | GSM8623047 | GSM8623047_r1 | GEO | Midbrain organoids were dissociated into single cells using Papain-based dissociation. Samples w... | GSM8623047 | ILLUMINA | SRS23173067 | PAIRED | SAMN44668243 | SRS23173067 | 2163121500 | NaN | Homo sapiens | GSM8623047 | Day 40, sublibrary 7 | 9606 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | GSM8623047_r1 | 590835440 | 445809410 | 475907050 | 25377 | 650544223 | fastq | s3.us-east-1 | s3 | run | s3.us-east-1 | s3 | run.zq | gs.us-east1 | gs | run.zq | s3.us-east-1 | s3 | public | <Database><Table name="SEQUENCE"><Statistics source="meta"><Rows count="7210405" /><Elements cou... | 1 | true | true | 2025-09-25 01:57:16 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-6/SRR31302048/P7_DKDL230002806-1A_H3LCWDSX7_L2_group_D40_R1.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2024-11-10 13:01:03 | P7_DKDL230002806-1A_H3LCWDSX7_L2_group_D40_R1.fastq.gz | 8cff67156f0afb8a6fd12c703db4b9ef | fastq | 546183512 | 0 | Original | NaN | 1 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-6/SRR31302048/P7_DKDL230002806-1A_H3LCWDSX7_L2_group_D40_R2.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2024-11-10 13:01:01 | P7_DKDL230002806-1A_H3LCWDSX7_L2_group_D40_R2.fastq.gz | 4bfae4ad0ed1c853ad280cf3989f33ae | fastq | 541053364 | 0 | Original | NaN | 1 | anonymous | worldwide | AWS | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR31302048/SRR31302048 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2024-11-10 13:01:16 | SRR31302048 | db02ac64463f1cfff71fb766b73956ac | SRA Normalized | 776991524 | 1 | Primary ETL | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR31302048/SRR31302048 | 1 | anonymous | worldwide | NCBI | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos8/sra-pub-zq-820/SRR031/31302/SRR31302048/SRR313... | aws identity | s3.us-east-1 | AWS | s3://sra-pub-zq-3/SRR31302048/SRR31302048.lite.1 | gcp identity | gs.us-east1 | GCP | gs://sra-pub-zq-109/SRR31302048/SRR31302048.lite.1 | public | 2024-11-10 15:24:08 | SRR31302048.lite | 4b36a148132bcbc616135eaee451ec54 | SRA Lite | 555963292 | 1 | Primary ETL | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos8/sra-pub-zq-820/SRR031/31302/SRR31302048/SRR313... | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 1 | 2163121500 | false | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 2163121500 | 776989606 | 1 | 7210405 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | source_name | H9 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | cell line | H9 | cell type | Midbrain organoids | geo_loc_name | missing | collection_date | missing | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | SAMN44668243 | BioSample | XREF_LINK | DB: bioproject | ID: 1184341 | LABEL: PRJNA1184341 | Day 40, sublibrary 7 | GSE281535 | NaN | NaN | GEO | GSE281535 | PRJNA1184341 | BioProject | XREF_LINK | DB: pubmed | ID: 41171913 | Midbrain dopaminergic neuron (mDA) differentiation protocols for Parkinson's disease (PD) modeli... | BrainSTEM: A multi-resolution fetal brain atlas to assess the fidelity of human midbrain cultures | Transcriptome Analysis | SRA2011968 | SUB14857800 | Duke-NUS Medical School | NaN |
| 496 | SRP544328 | SRX26680203 | GSM8623046: Day 40, sublibrary 6; Homo sapiens; RNA-Seq | 9606 | Homo sapiens | RNA-Seq | TRANSCRIPTOMIC SINGLE CELL | cDNA | SRS23173066 | GSM8623046 | Illumina NovaSeq 6000 | 6522047 | 706126428 | SRR31302049 | 6522047 | 1956614100 | GSM8623046_r1 | GSM8623046 | GSM8623046_r1 | GEO | Midbrain organoids were dissociated into single cells using Papain-based dissociation. Samples w... | GSM8623046 | ILLUMINA | SRS23173066 | PAIRED | SAMN44668244 | SRS23173066 | 1956614100 | NaN | Homo sapiens | GSM8623046 | Day 40, sublibrary 6 | 9606 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | GSM8623046_r1 | 534352533 | 403375480 | 431317440 | 22914 | 587545733 | fastq | s3.us-east-1 | s3 | run | s3.us-east-1 | s3 | run.zq | gs.us-east1 | gs | run.zq | s3.us-east-1 | s3 | public | <Database><Table name="SEQUENCE"><Statistics source="meta"><Rows count="6522047" /><Elements cou... | 1 | true | true | 2025-09-25 01:57:16 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-6/SRR31302049/P6_DKDL230002806-1A_H3LCWDSX7_L2_group_D40_R1.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2024-11-10 13:01:23 | P6_DKDL230002806-1A_H3LCWDSX7_L2_group_D40_R1.fastq.gz | 2bf41684f5083ec20973b5d50160bf28 | fastq | 492511563 | 0 | Original | NaN | 1 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-6/SRR31302049/P6_DKDL230002806-1A_H3LCWDSX7_L2_group_D40_R2.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2024-11-10 13:01:46 | P6_DKDL230002806-1A_H3LCWDSX7_L2_group_D40_R2.fastq.gz | 4e296fe7f42c80e160952832d1626a91 | fastq | 495062597 | 0 | Original | NaN | 1 | anonymous | worldwide | AWS | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR31302049/SRR31302049 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2024-11-10 13:02:04 | SRR31302049 | 4a364cdecb7b2b2a355e632fcde1136c | SRA Normalized | 706128344 | 1 | Primary ETL | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR31302049/SRR31302049 | 1 | anonymous | worldwide | NCBI | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos8/sra-pub-zq-820/SRR031/31302/SRR31302049/SRR313... | aws identity | s3.us-east-1 | AWS | s3://sra-pub-zq-3/SRR31302049/SRR31302049.lite.1 | gcp identity | gs.us-east1 | GCP | gs://sra-pub-zq-109/SRR31302049/SRR31302049.lite.1 | public | 2024-11-10 15:24:08 | SRR31302049.lite | c8c5b613cb7029d1e923fbed9c7d5a27 | SRA Lite | 503013972 | 1 | Primary ETL | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos8/sra-pub-zq-820/SRR031/31302/SRR31302049/SRR313... | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 1 | 1956614100 | false | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 1956614100 | 706126428 | 1 | 6522047 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | source_name | H9 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | cell line | H9 | cell type | Midbrain organoids | geo_loc_name | missing | collection_date | missing | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | SAMN44668244 | BioSample | XREF_LINK | DB: bioproject | ID: 1184341 | LABEL: PRJNA1184341 | Day 40, sublibrary 6 | GSE281535 | NaN | NaN | GEO | GSE281535 | PRJNA1184341 | BioProject | XREF_LINK | DB: pubmed | ID: 41171913 | Midbrain dopaminergic neuron (mDA) differentiation protocols for Parkinson's disease (PD) modeli... | BrainSTEM: A multi-resolution fetal brain atlas to assess the fidelity of human midbrain cultures | Transcriptome Analysis | SRA2011968 | SUB14857800 | Duke-NUS Medical School | NaN |
| 497 | SRP544328 | SRX26680202 | GSM8623045: Day 40, sublibrary 5; Homo sapiens; RNA-Seq | 9606 | Homo sapiens | RNA-Seq | TRANSCRIPTOMIC SINGLE CELL | cDNA | SRS23173065 | GSM8623045 | Illumina NovaSeq 6000 | 6652058 | 716880083 | SRR31302050 | 6652058 | 1995617400 | GSM8623045_r1 | GSM8623045 | GSM8623045_r1 | GEO | Midbrain organoids were dissociated into single cells using Papain-based dissociation. Samples w... | GSM8623045 | ILLUMINA | SRS23173065 | PAIRED | SAMN44668245 | SRS23173065 | 1995617400 | NaN | Homo sapiens | GSM8623045 | Day 40, sublibrary 5 | 9606 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | GSM8623045_r1 | 545172143 | 412276787 | 439456942 | 23493 | 598688035 | fastq | s3.us-east-1 | s3 | run | s3.us-east-1 | s3 | run.zq | gs.us-east1 | gs | run.zq | s3.us-east-1 | s3 | public | <Database><Table name="SEQUENCE"><Statistics source="meta"><Rows count="6652058" /><Elements cou... | 1 | true | true | 2025-09-25 01:57:16 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-6/SRR31302050/P5_DKDL230002806-1A_H3LCWDSX7_L2_group_D40_R1.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2024-11-10 13:01:14 | P5_DKDL230002806-1A_H3LCWDSX7_L2_group_D40_R1.fastq.gz | bee5c6aa57e323cd342bee69a2662da1 | fastq | 504769087 | 0 | Original | NaN | 1 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-6/SRR31302050/P5_DKDL230002806-1A_H3LCWDSX7_L2_group_D40_R2.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2024-11-10 13:01:37 | P5_DKDL230002806-1A_H3LCWDSX7_L2_group_D40_R2.fastq.gz | ef41507ac020c4a95d696049e49399c7 | fastq | 498753208 | 0 | Original | NaN | 1 | anonymous | worldwide | AWS | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR31302050/SRR31302050 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2024-11-10 13:02:11 | SRR31302050 | aa0490ca655619a94f33ad57fbde8dc7 | SRA Normalized | 716882004 | 1 | Primary ETL | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR31302050/SRR31302050 | 1 | anonymous | worldwide | NCBI | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos8/sra-pub-zq-820/SRR031/31302/SRR31302050/SRR313... | aws identity | s3.us-east-1 | AWS | s3://sra-pub-zq-3/SRR31302050/SRR31302050.lite.1 | gcp identity | gs.us-east1 | GCP | gs://sra-pub-zq-109/SRR31302050/SRR31302050.lite.1 | public | 2024-11-10 15:24:07 | SRR31302050.lite | 5f08c1981ec05bd40a1136c5f075c5e0 | SRA Lite | 513008808 | 1 | Primary ETL | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos8/sra-pub-zq-820/SRR031/31302/SRR31302050/SRR313... | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 1 | 1995617400 | false | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 1995617400 | 716880083 | 1 | 6652058 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | source_name | H9 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | cell line | H9 | cell type | Midbrain organoids | geo_loc_name | missing | collection_date | missing | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | SAMN44668245 | BioSample | XREF_LINK | DB: bioproject | ID: 1184341 | LABEL: PRJNA1184341 | Day 40, sublibrary 5 | GSE281535 | NaN | NaN | GEO | GSE281535 | PRJNA1184341 | BioProject | XREF_LINK | DB: pubmed | ID: 41171913 | Midbrain dopaminergic neuron (mDA) differentiation protocols for Parkinson's disease (PD) modeli... | BrainSTEM: A multi-resolution fetal brain atlas to assess the fidelity of human midbrain cultures | Transcriptome Analysis | SRA2011968 | SUB14857800 | Duke-NUS Medical School | NaN |
| 498 | SRP544328 | SRX26680201 | GSM8623044: Day 40, sublibrary 4; Homo sapiens; RNA-Seq | 9606 | Homo sapiens | RNA-Seq | TRANSCRIPTOMIC SINGLE CELL | cDNA | SRS23173064 | GSM8623044 | Illumina NovaSeq 6000 | 8583454 | 926173768 | SRR31302051 | 8583454 | 2575036200 | GSM8623044_r1 | GSM8623044 | GSM8623044_r1 | GEO | Midbrain organoids were dissociated into single cells using Papain-based dissociation. Samples w... | GSM8623044 | ILLUMINA | SRS23173064 | PAIRED | SAMN44668246 | SRS23173064 | 2575036200 | NaN | Homo sapiens | GSM8623044 | Day 40, sublibrary 4 | 9606 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | GSM8623044_r1 | 702599283 | 530525027 | 567651588 | 30587 | 774229715 | fastq | s3.us-east-1 | s3 | run | s3.us-east-1 | s3 | run.zq | gs.us-east1 | gs | run.zq | s3.us-east-1 | s3 | public | <Database><Table name="SEQUENCE"><Statistics source="meta"><Rows count="8583454" /><Elements cou... | 1 | true | true | 2025-09-25 01:57:16 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-6/SRR31302051/P4_DKDL230002806-1A_H3LCWDSX7_L2_group_D40_R1.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2024-11-10 13:01:51 | P4_DKDL230002806-1A_H3LCWDSX7_L2_group_D40_R1.fastq.gz | 91ece518e89d39620e095f4bdef20a32 | fastq | 647913197 | 0 | Original | NaN | 1 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-6/SRR31302051/P4_DKDL230002806-1A_H3LCWDSX7_L2_group_D40_R2.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2024-11-10 13:02:15 | P4_DKDL230002806-1A_H3LCWDSX7_L2_group_D40_R2.fastq.gz | 3e6390e4c164df9953ac02e38f4ed007 | fastq | 646969850 | 0 | Original | NaN | 1 | anonymous | worldwide | AWS | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR31302051/SRR31302051 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2024-11-10 13:02:35 | SRR31302051 | 39ff23c9266c24af8d4400de17fef363 | SRA Normalized | 926175686 | 1 | Primary ETL | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR31302051/SRR31302051 | 1 | anonymous | worldwide | NCBI | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos8/sra-pub-zq-820/SRR031/31302/SRR31302051/SRR313... | aws identity | s3.us-east-1 | AWS | s3://sra-pub-zq-3/SRR31302051/SRR31302051.lite.1 | gcp identity | gs.us-east1 | GCP | gs://sra-pub-zq-109/SRR31302051/SRR31302051.lite.1 | public | 2024-11-10 15:24:11 | SRR31302051.lite | 361412765c864562c2166a00f8b34b24 | SRA Lite | 661565662 | 1 | Primary ETL | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos8/sra-pub-zq-820/SRR031/31302/SRR31302051/SRR313... | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 1 | 2575036200 | false | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 2575036200 | 926173768 | 1 | 8583454 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | source_name | H9 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | cell line | H9 | cell type | Midbrain organoids | geo_loc_name | missing | collection_date | missing | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | SAMN44668246 | BioSample | XREF_LINK | DB: bioproject | ID: 1184341 | LABEL: PRJNA1184341 | Day 40, sublibrary 4 | GSE281535 | NaN | NaN | GEO | GSE281535 | PRJNA1184341 | BioProject | XREF_LINK | DB: pubmed | ID: 41171913 | Midbrain dopaminergic neuron (mDA) differentiation protocols for Parkinson's disease (PD) modeli... | BrainSTEM: A multi-resolution fetal brain atlas to assess the fidelity of human midbrain cultures | Transcriptome Analysis | SRA2011968 | SUB14857800 | Duke-NUS Medical School | NaN |
| 499 | SRP544328 | SRX26680200 | GSM8623043: Day 40, sublibrary 3; Homo sapiens; RNA-Seq | 9606 | Homo sapiens | RNA-Seq | TRANSCRIPTOMIC SINGLE CELL | cDNA | SRS23173063 | GSM8623043 | Illumina NovaSeq 6000 | 6682408 | 711706735 | SRR31302052 | 6682408 | 2004722400 | GSM8623043_r1 | GSM8623043 | GSM8623043_r1 | GEO | Midbrain organoids were dissociated into single cells using Papain-based dissociation. Samples w... | GSM8623043 | ILLUMINA | SRS23173063 | PAIRED | SAMN44668247 | SRS23173063 | 2004722400 | NaN | Homo sapiens | GSM8623043 | Day 40, sublibrary 3 | 9606 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | GSM8623043_r1 | 545272833 | 412721114 | 444405744 | 23831 | 602298878 | fastq | s3.us-east-1 | s3 | run | s3.us-east-1 | s3 | run.zq | gs.us-east1 | gs | run.zq | s3.us-east-1 | s3 | public | <Database><Table name="SEQUENCE"><Statistics source="meta"><Rows count="6682408" /><Elements cou... | 1 | true | true | 2025-09-25 01:57:16 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-6/SRR31302052/P3_DKDL230002806-1A_H3LCWDSX7_L2_group_D40_R1.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2024-11-10 13:01:33 | P3_DKDL230002806-1A_H3LCWDSX7_L2_group_D40_R1.fastq.gz | 83dfc5d3945dc3f72d1f2ae4ba908842 | fastq | 503898936 | 0 | Original | NaN | 1 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-6/SRR31302052/P3_DKDL230002806-1A_H3LCWDSX7_L2_group_D40_R2.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2024-11-10 13:01:27 | P3_DKDL230002806-1A_H3LCWDSX7_L2_group_D40_R2.fastq.gz | fb4817fdfbbb8774e5f479bf4cd8ea54 | fastq | 490647089 | 0 | Original | NaN | 1 | anonymous | worldwide | AWS | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR31302052/SRR31302052 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2024-11-10 13:01:53 | SRR31302052 | 7889513c01d11e670690e54f4fbe30fb | SRA Normalized | 711708655 | 1 | Primary ETL | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR31302052/SRR31302052 | 1 | anonymous | worldwide | NCBI | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos8/sra-pub-zq-820/SRR031/31302/SRR31302052/SRR313... | aws identity | s3.us-east-1 | AWS | s3://sra-pub-zq-3/SRR31302052/SRR31302052.lite.1 | gcp identity | gs.us-east1 | GCP | gs://sra-pub-zq-109/SRR31302052/SRR31302052.lite.1 | public | 2024-11-10 15:24:12 | SRR31302052.lite | 49bf293d885351fd21c84cc837df3ea7 | SRA Lite | 515298535 | 1 | Primary ETL | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos8/sra-pub-zq-820/SRR031/31302/SRR31302052/SRR313... | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 1 | 2004722400 | false | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 2004722400 | 711706735 | 1 | 6682408 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | source_name | H9 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | cell line | H9 | cell type | Midbrain organoids | geo_loc_name | missing | collection_date | missing | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | SAMN44668247 | BioSample | XREF_LINK | DB: bioproject | ID: 1184341 | LABEL: PRJNA1184341 | Day 40, sublibrary 3 | GSE281535 | NaN | NaN | GEO | GSE281535 | PRJNA1184341 | BioProject | XREF_LINK | DB: pubmed | ID: 41171913 | Midbrain dopaminergic neuron (mDA) differentiation protocols for Parkinson's disease (PD) modeli... | BrainSTEM: A multi-resolution fetal brain atlas to assess the fidelity of human midbrain cultures | Transcriptome Analysis | SRA2011968 | SUB14857800 | Duke-NUS Medical School | NaN |
500 rows × 3423 columns
Filter and Explore Results¶
Let’s examine the unique studies and get an overview of the datasets:
[5]:
if not df.empty:
# Get unique GSE IDs (study accessions)
if "study_alias" in df.columns:
unique_studies = df["study_alias"].unique()
print(f"Number of unique studies (GSE IDs): {len(unique_studies)}")
print(f"\nUnique GSE IDs:\n{sorted(unique_studies)}")
# Display summary information
print(f"\n{'='*80}")
print("DATASET SUMMARY")
print(f"{'='*80}")
print(f"Total runs: {len(df)}")
if "sample_scientific_name" in df.columns:
print(f"\nOrganisms represented:")
print(df["sample_scientific_name"].value_counts())
if "experiment_library_strategy" in df.columns:
print(f"\nLibrary strategies:")
print(df["experiment_library_strategy"].value_counts())
else:
print("No results found. This could mean:")
print("1. No Parse Bioscience datasets match the date range")
print("2. The search query needs adjustment")
print("3. Try searching with a broader query or different date range")
Number of unique studies (GSE IDs): 54
Unique GSE IDs:
['GSE281535', 'GSE281932', 'GSE282418', 'GSE282851', 'GSE283038', 'GSE283186', 'GSE283982', 'GSE284207', 'GSE285843', 'GSE286901', 'GSE287852', 'GSE289845', 'GSE291674', 'GSE292745', 'GSE295359', 'GSE295527', 'GSE296244', 'GSE296547', 'GSE297023', 'GSE297299', 'GSE297427', 'GSE299005', 'GSE299409', 'GSE304456', 'GSE306046', 'GSE306096', 'GSE306228', 'GSE306684', 'GSE308009', 'GSE309220', 'GSE310800', 'GSE310825', 'GSE311574', 'GSE311802', 'GSE313958', 'GSE316120', 'GSE317479', 'GSE318002', 'GSE319345', 'GSE319472', 'GSE320334', 'GSE320427', 'GSE320507', 'GSE322713', 'GSE323336', 'GSE328442', 'GSE328823', 'GSE329418', 'GSE330122', 'GSE330123', 'GSE330222', 'GSE330837', 'GSE333415', 'GSE334463']
================================================================================
DATASET SUMMARY
================================================================================
Total runs: 500
Organisms represented:
sample_scientific_name
Homo sapiens 308
Mus musculus 152
Polypterus senegalus 8
Homo sapiens/Mus musculus xenograft 8
Rattus norvegicus 6
Peromyscus maniculatus bairdii 5
Peromyscus maniculatus nubiterrae 5
Anableps anableps 3
Drosophila melanogaster 2
Ovis aries 1
Bos taurus 1
Gallus gallus 1
Name: count, dtype: int64
Library strategies:
experiment_library_strategy
RNA-Seq 438
OTHER 48
ATAC-seq 14
Name: count, dtype: int64
Display Key Metadata¶
Let’s create a clean summary table with the most important information:
[6]:
if not df.empty:
# Select key columns for display
key_columns = [
"study_accession",
"study_alias",
"experiment_accession",
"sample_accession",
"sample_scientific_name",
"experiment_library_strategy",
"experiment_title",
"run_1_accession",
]
# Filter to only include columns that exist
available_columns = [col for col in key_columns if col in df.columns]
summary_df = df[available_columns].copy()
print("\nParse Bioscience Dataset Summary:")
print(f"{'='*80}\n")
display(summary_df.head(20)) # Show first 20 entries
if len(summary_df) > 20:
print(f"\n... and {len(summary_df) - 20} more entries")
Parse Bioscience Dataset Summary:
================================================================================
| study_accession | study_alias | experiment_accession | sample_accession | sample_scientific_name | experiment_library_strategy | experiment_title | run_1_accession | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 0 | SRP707097 | GSE334463 | SRX33769166 | SRS29437478 | Drosophila melanogaster | RNA-Seq | GSM9789190: Sublibrary1 pool of all samples; Drosophila melanogaster; RNA-Seq | SRR39012693 |
| 1 | SRP707097 | GSE334463 | SRX33769165 | SRS29437477 | Drosophila melanogaster | RNA-Seq | GSM9789191: Sublibrary2 pool of all samples; Drosophila melanogaster; RNA-Seq | SRR39012694 |
| 2 | SRP704119 | GSE333415 | SRX33627756 | SRS29315848 | Mus musculus | RNA-Seq | GSM9764206: Parse Evercode WT scRNA-seq — mouse CD11b+ myeloid, shLOX KD rep 3 (shLOX-I-3); Mus ... | SRR38858729 |
| 3 | SRP704119 | GSE333415 | SRX33627755 | SRS29315846 | Mus musculus | RNA-Seq | GSM9764203: Parse Evercode WT scRNA-seq — mouse CD11b+ myeloid, pLKO ctrl rep 2 (pLKO-I-2); Mus ... | SRR38858730 |
| 4 | SRP704119 | GSE333415 | SRX33627754 | SRS29315847 | Mus musculus | RNA-Seq | GSM9764204: Parse Evercode WT scRNA-seq — mouse CD11b+ myeloid, shLOX KD rep 2 (shLOX-I-2); Mus ... | SRR38858731 |
| 5 | SRP704119 | GSE333415 | SRX33627753 | SRS29315845 | Mus musculus | RNA-Seq | GSM9764205: Parse Evercode WT scRNA-seq — mouse CD11b+ myeloid, pLKO ctrl rep 3 (pLKO-I-3); Mus ... | SRR38858732 |
| 6 | SRP704119 | GSE333415 | SRX33627752 | SRS29315844 | Mus musculus | RNA-Seq | GSM9764202: Parse Evercode WT scRNA-seq — mouse CD11b+ myeloid, shLOX KD rep 1 (shLOX-I-1); Mus ... | SRR38858733 |
| 7 | SRP704119 | GSE333415 | SRX33627751 | SRS29315843 | Mus musculus | RNA-Seq | GSM9764201: Parse Evercode WT scRNA-seq — mouse CD11b+ myeloid, pLKO ctrl rep 1 (pLKO-I-1); Mus ... | SRR38858734 |
| 8 | SRP704119 | GSE333415 | SRX33627750 | SRS29315842 | Homo sapiens | RNA-Seq | GSM9764200: Parse Evercode WT scRNA-seq — human tumor cell, shLOX KD rep 3 (shLOX-T-3); Homo sap... | SRR38858735 |
| 9 | SRP704119 | GSE333415 | SRX33627749 | SRS29315841 | Homo sapiens | RNA-Seq | GSM9764199: Parse Evercode WT scRNA-seq — human tumor cell, pLKO ctrl rep 3 (pLKO-T-3); Homo sap... | SRR38858736 |
| 10 | SRP704119 | GSE333415 | SRX33627748 | SRS29315840 | Homo sapiens | RNA-Seq | GSM9764198: Parse Evercode WT scRNA-seq — human tumor cell, shLOX KD rep 2 (shLOX-T-2); Homo sap... | SRR38858737 |
| 11 | SRP704119 | GSE333415 | SRX33627747 | SRS29315839 | Homo sapiens | RNA-Seq | GSM9764197: Parse Evercode WT scRNA-seq — human tumor cell, pLKO ctrl rep 2 (pLKO-T-2); Homo sap... | SRR38858738 |
| 12 | SRP704119 | GSE333415 | SRX33627746 | SRS29315837 | Homo sapiens | RNA-Seq | GSM9764196: Parse Evercode WT scRNA-seq — human tumor cell, shLOX KD rep 1 (shLOX-T-1); Homo sap... | SRR38858739 |
| 13 | SRP704119 | GSE333415 | SRX33627745 | SRS29315838 | Homo sapiens | RNA-Seq | GSM9764195: Parse Evercode WT scRNA-seq — human tumor cell, pLKO ctrl rep 1 (pLKO-T-1); Homo sap... | SRR38858740 |
| 14 | SRP700086 | GSE330837 | SRX33369165 | SRS29142673 | Mus musculus | OTHER | GSM9733409: P2 cerebellar cells, Wildtype3, KDM1A CUTRUN; Mus musculus; OTHER | SRR38562620 |
| 15 | SRP700086 | GSE330837 | SRX33369164 | SRS29142671 | Mus musculus | OTHER | GSM9733408: P2 cerebellar cells, Wildtype2, KDM1A CUTRUN; Mus musculus; OTHER | SRR38562622 |
| 16 | SRP700086 | GSE330837 | SRX33369163 | SRS29142670 | Mus musculus | OTHER | GSM9733407: P2 cerebellar cells, Wildtype1, KDM1A CUTRUN; Mus musculus; OTHER | SRR38562623 |
| 17 | SRP700086 | GSE330837 | SRX33369162 | SRS29142672 | Mus musculus | OTHER | GSM9733406: P2 cerebellar cells, Wildtype2, INSM1-HA CUTRUN; Mus musculus; OTHER | SRR38562625 |
| 18 | SRP700086 | GSE330837 | SRX33369161 | SRS29142669 | Mus musculus | OTHER | GSM9733405: P2 cerebellar cells, Wildtype1, INSM1-HA CUTRUN; Mus musculus; OTHER | SRR38562626 |
| 19 | SRP700086 | GSE330837 | SRX33369160 | SRS29142668 | Mus musculus | OTHER | GSM9733404: P2 cerebellar cells, Wildtype2, H3K4me3 CUTRUN; Mus musculus; OTHER | SRR38562627 |
... and 480 more entries
Organize by Study (GSE)¶
Group the data by study to see how many samples/runs belong to each GSE:
[7]:
if not df.empty and "study_alias" in df.columns:
# Group by study and count entries
studies_summary = (
df.groupby("study_alias")
.agg(
{
"experiment_accession": "count",
"sample_scientific_name": lambda x: (
", ".join(x.unique()) if hasattr(x, "unique") else str(x.iloc[0])
),
"study_accession": "first",
}
)
.rename(
columns={
"experiment_accession": "num_experiments",
"sample_scientific_name": "organisms",
"study_accession": "SRP_accession",
}
)
.reset_index()
)
# Sort by number of experiments (descending)
studies_summary = studies_summary.sort_values("num_experiments", ascending=False)
print("\nStudy-level Summary:")
print(f"{'='*80}\n")
display(studies_summary)
Study-level Summary:
================================================================================
| study_alias | num_experiments | organisms | SRP_accession | |
|---|---|---|---|---|
| 51 | GSE330837 | 53 | Mus musculus | SRP700086 |
| 15 | GSE295527 | 52 | Homo sapiens | SRP581094 |
| 0 | GSE281535 | 38 | Homo sapiens | SRP544328 |
| 25 | GSE306096 | 27 | Homo sapiens | SRP610619 |
| 47 | GSE329418 | 25 | Homo sapiens | SRP695753 |
| 18 | GSE297023 | 16 | Mus musculus | SRP584959 |
| 33 | GSE311802 | 16 | Mus musculus | SRP649734 |
| 19 | GSE297299 | 16 | Homo sapiens | SRP585605 |
| 46 | GSE328823 | 16 | Homo sapiens | SRP694020 |
| 14 | GSE295359 | 15 | Homo sapiens | SRP580608 |
| 8 | GSE285843 | 14 | Homo sapiens | SRP556153 |
| 39 | GSE319472 | 12 | Homo sapiens | SRP676989 |
| 52 | GSE333415 | 12 | Mus musculus, Homo sapiens | SRP704119 |
| 3 | GSE282851 | 10 | Mus musculus | SRP547691 |
| 43 | GSE322713 | 10 | Peromyscus maniculatus bairdii, Peromyscus maniculatus nubiterrae | SRP680596 |
| 6 | GSE283982 | 9 | Homo sapiens | SRP550602 |
| 42 | GSE320507 | 9 | Homo sapiens | SRP679492 |
| 20 | GSE297427 | 8 | Homo sapiens/Mus musculus xenograft | SRP586001 |
| 22 | GSE299409 | 8 | Mus musculus | SRP591195 |
| 23 | GSE304456 | 8 | Homo sapiens | SRP606431 |
| 44 | GSE323336 | 8 | Homo sapiens | SRP681042 |
| 29 | GSE309220 | 8 | Mus musculus | SRP627292 |
| 50 | GSE330222 | 8 | Homo sapiens | SRP698335 |
| 45 | GSE328442 | 8 | Mus musculus | SRP693098 |
| 31 | GSE310825 | 8 | Mus musculus | SRP647341 |
| 24 | GSE306046 | 8 | Homo sapiens | SRP610621 |
| 35 | GSE316120 | 8 | Polypterus senegalus | SRP661148 |
| 5 | GSE283186 | 7 | Homo sapiens | SRP548416 |
| 16 | GSE296244 | 7 | Homo sapiens | SRP582847 |
| 40 | GSE320334 | 6 | Bos taurus, Rattus norvegicus | SRP678991 |
| 34 | GSE313958 | 6 | Homo sapiens | SRP656069 |
| 49 | GSE330123 | 4 | Homo sapiens | SRP698070 |
| 7 | GSE284207 | 4 | Homo sapiens | SRP551283 |
| 38 | GSE319345 | 4 | Mus musculus | SRP676726 |
| 26 | GSE306228 | 3 | Anableps anableps | SRP610788 |
| 28 | GSE308009 | 3 | Mus musculus | SRP620345 |
| 2 | GSE282418 | 2 | Homo sapiens | SRP546485 |
| 1 | GSE281932 | 2 | Mus musculus | SRP545300 |
| 27 | GSE306684 | 2 | Mus musculus | SRP613829 |
| 48 | GSE330122 | 2 | Homo sapiens | SRP698073 |
| 53 | GSE334463 | 2 | Drosophila melanogaster | SRP707097 |
| 4 | GSE283038 | 2 | Mus musculus | SRP548062 |
| 17 | GSE296547 | 2 | Homo sapiens | SRP583610 |
| 21 | GSE299005 | 2 | Mus musculus | SRP589942 |
| 13 | GSE292745 | 1 | Rattus norvegicus | SRP572670 |
| 9 | GSE286901 | 1 | Homo sapiens | SRP557889 |
| 10 | GSE287852 | 1 | Homo sapiens | SRP559435 |
| 11 | GSE289845 | 1 | Mus musculus | SRP564833 |
| 12 | GSE291674 | 1 | Mus musculus | SRP569656 |
| 32 | GSE311574 | 1 | Homo sapiens | SRP649201 |
| 37 | GSE318002 | 1 | Gallus gallus | SRP670329 |
| 36 | GSE317479 | 1 | Mus musculus | SRP665997 |
| 30 | GSE310800 | 1 | Mus musculus | SRP647351 |
| 41 | GSE320427 | 1 | Ovis aries | SRP679235 |
Get Study Titles and Descriptions¶
Extract study titles to understand what each dataset is about:
[8]:
if not df.empty:
title_cols = [
col
for col in df.columns
if "study_title" in col.lower() or "study_abstract" in col.lower()
]
if title_cols and "study_alias" in df.columns:
# Get unique study information
study_info_cols = ["study_alias", "study_accession"] + title_cols
study_info_cols = [col for col in study_info_cols if col in df.columns]
study_info = df[study_info_cols].drop_duplicates(subset=["study_alias"])
print("\nStudy Titles and Descriptions:")
print(f"{'='*80}\n")
for idx, row in study_info.iterrows():
print(f"GSE: {row['study_alias']}")
print(f"SRP: {row['study_accession']}")
for col in title_cols:
if col in row and pd.notna(row[col]):
print(f"{col}: {row[col][:300]}...") # Truncate long descriptions
print(f"{'-'*80}\n")
Study Titles and Descriptions:
================================================================================
GSE: GSE334463
SRP: SRP707097
study_study_abstract: If GEO accession GSE334463 has been cited in a publication, please notify us at geo@ncbi.nlm.nih.gov to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE334463 is currently private and is scheduled to be released on Jun 22, 2026....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE333415
SRP: SRP704119
study_study_abstract: If GEO accession GSE333415 has been cited in a publication, please notify us at geo@ncbi.nlm.nih.gov to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE333415 is currently private and is scheduled to be released on May 26, 2027....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE330837
SRP: SRP700086
study_study_abstract: If GEO accession GSE330837 has been cited in a publication, please notify us at geo@ncbi.nlm.nih.gov to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE330837 is currently private and is scheduled to be released on May 12, 2028....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE330222
SRP: SRP698335
study_study_abstract: If GEO accession GSE330222 has been cited in a publication, please notify us at geo@ncbi.nlm.nih.gov to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE330222 is currently private and is scheduled to be released on May 10, 2027....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE330122
SRP: SRP698073
study_study_abstract: If GEO accession GSE330122 has been cited in a publication, please notify us at geo@ncbi.nlm.nih.gov to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE330122 is currently private and is scheduled to be released on Jun 01, 2026....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE330123
SRP: SRP698070
study_study_abstract: If GEO accession GSE330123 has been cited in a publication, please notify us at geo@ncbi.nlm.nih.gov to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE330123 is currently private and is scheduled to be released on Jun 01, 2026....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE329418
SRP: SRP695753
study_study_abstract: If GEO accession GSE329418 has been cited in a publication, please notify us at geo@ncbi.nlm.nih.gov to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE329418 is currently private and is scheduled to be released on Apr 27, 2027....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE328823
SRP: SRP694020
study_study_abstract: If GEO accession GSE328823 has been cited in a publication, please notify us at geo@ncbi.nlm.nih.gov to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE328823 is currently private and is scheduled to be released on May 01, 2027....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE328442
SRP: SRP693098
study_study_abstract: If GEO accession GSE328442 has been cited in a publication, please notify us at geo@ncbi.nlm.nih.gov to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE328442 is currently private and is scheduled to be released on Jul 18, 2026....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE323336
SRP: SRP681042
study_study_abstract: If GEO accession GSE323336 has been cited in a publication, please notify us at geo@ncbi.nlm.nih.gov to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE323336 is currently private and is scheduled to be released on Mar 04, 2030....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE322713
SRP: SRP680596
study_study_abstract: If GEO accession GSE322713 has been cited in a publication, please notify us at geo@ncbi.nlm.nih.gov to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE322713 is currently private and is scheduled to be released on Mar 07, 2026....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE320507
SRP: SRP679492
study_study_abstract: If GEO accession GSE320507 has been cited in a publication, please notify us at geo@ncbi.nlm.nih.gov to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE320507 is currently private and is scheduled to be released on Mar 31, 2026....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE320427
SRP: SRP679235
study_study_abstract: The mammalian body plan is established during symmetry breaking and gastrulation. In ungulates and primates, these events occur within a flat embryonic disc and coincide with the developmental window most susceptible to pregnancy loss. Using the EvercodeTM Cell Fixation kit v2 (ECF2101, Parse Biosci...
study_study_title: A Single-Cell Transcriptomic Atlas of Symmetry Breaking in Sheep...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE320334
SRP: SRP678991
study_study_abstract: If GEO accession GSE320334 has been cited in a publication, please notify us at geo@ncbi.nlm.nih.gov to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE320334 is currently private and is scheduled to be released on Apr 01, 2026....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE319472
SRP: SRP676989
study_study_abstract: The goal of this analysis was to examine the impact of PA-X activity during infection in a model of the human airway epithelium, using primary airway cells from two different donors. We profiled the effects of infection and PA-X activity in various airway epithelial cell types. Donor H1: Male, 21, C...
study_study_title: scRNAseq analysis of human brochial epithelial cell air liquid interface cultures infected with the A/Perth/16/2009 H3N2 with and without PA-X...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE319345
SRP: SRP676726
study_study_abstract: To identify biomarkers of subpopulations of intrahepatic biliary epithelial cells, we performed single cell RNA-seq on adult biliary epithelial cells (BECs) and hybrid hepatocytes (HybHeps) from uninjured or cholestatic injured Sox9EGFP+ mice. After 7 days, the livers were dissociated to single cell...
study_study_title: Single cell RNA-seq of intrahepatic biliary epithelial cells following bile duct ligation....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE318002
SRP: SRP670329
study_study_abstract: Background: The trigeminal ganglion (TG) is a structure of the peripheral nervous system, composed of neuronal and non-neuronal cell types, that integrates sensory input from the face and jaw. The developing TG is derived from two embryonic cell populations: neural crest and cranial placode. Both po...
study_study_title: Cellular diversity of the developing chick trigeminal ganglion at single-cell resolution...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE317479
SRP: SRP665997
study_study_abstract: To investigate transcriptional changes in the heart induced by diet, we performed single-cell RNA sequencing on pooled mouse hearts from normal fat diet (NFD, 10% kcal fat) and high fat diet (HFD, 60% kcal fat) groups using the Parse Biosciences Evercode WT Mini v3 kit. Overall design: Whole hearts ...
study_study_title: Single-cell RNA sequencing of mouse hearts under normal fat diet and high fat diet conditions...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE316120
SRP: SRP661148
study_study_abstract: Comparative studies of vertebrate appendages offer a powerful framework for uncovering shared components of an ancestral regeneration toolkit. Here, we employed a multi-omics comparative approach leveraging the regenerative capacity of the axolotl, zebrafish, and Polypterus senegalus, a fish capable...
study_study_title: Comparative multi-omic analysis reveals conserved and derived mechanisms of fin and limb regeneration...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE284207
SRP: SRP551283
study_study_abstract: A longstanding barrier in genome engineering with CRISPR-Cas9 has been the inability to measure Cas9 edit outcomes at single-cell resolution. Here we present Superb-seq, a new technology for joint measurement of on-target and off-target Cas9 edits and transcriptomes by single-cell RNA sequencing. In...
study_study_title: Joint single-cell profiling of Cas9 edits and transcriptomes reveals on- and off-target effects on gene expression (Superb-seq)...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE311802
SRP: SRP649734
study_study_abstract: Loss-of-function mutations in genes encoding lysine methyltransferases (KMTs) and demethylases (KDMs) specific for trimethylated of lysine 4 of histone 3 (H3K4me3) are associated with neurodevelopmental conditions, including autism spectrum disorder and intellectual disability. To study the role of ...
study_study_title: Autism-like phenotypes and increased NMDAR2D expression in mice with KDM5B histone lysine demethylase deficiency...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE311574
SRP: SRP649201
study_study_abstract: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) cells exist on a spectrum of epithelial (E) and quasimesenchymal (QM) transcriptional states with differences in sensitivity to FOLFIRINOX (FFX). GSK-3b is a key regulator PDAC cell epithelial-to-mesenchymal transition (EMT). Here, we performed in vitro analys...
study_study_title: Therapeutic Targeting of Epithelial Mesenchymal Cellular Plasticity in Pancreatic Cancer...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE310800
SRP: SRP647351
study_study_abstract: The vertebrate forelimb initiates as a localized swelling in the somatic lateral plate mesoderm (somatic LPM) in response to Tbx5-dependent transcription. The molecular pathways driving limb morphogenesis have been extensively studied but the steps directly preceding limb bud formation remain poorly...
study_study_title: Developmental and transcriptional programs that define the initiation of the forelimb...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE310825
SRP: SRP647341
study_study_abstract: The vertebrate forelimb initiates as a localized swelling in the somatic lateral plate mesoderm (somatic LPM) in response to Tbx5-dependent transcription. The molecular pathways driving limb morphogenesis have been extensively studied but the steps directly preceding limb bud formation remain poorly...
study_study_title: Developmental and transcriptional programs that define the initiation of the forelimb II...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE309220
SRP: SRP627292
study_study_abstract: If GEO accession GSE309220 has been cited in a publication, please notify us at geo@ncbi.nlm.nih.gov to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE309220 is currently private and is scheduled to be released on Dec 31, 2026....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE308009
SRP: SRP620345
study_study_abstract: Aging or injury to the joints can lead to cartilage degeneration osteoarthritis (OA), for which there are limited effective treatments. We found that expression of the gerozyme 15-Prostaglandin Dehydrogenase (15-PGDH) was increased in the articular cartilage of aged or injured mice. Both systemic an...
study_study_title: Inhibition of the Gerozyme 15-Prostaglandin Dehydrogenase Promotes Articular Cartilage Regeneration in Osteoarthritis due to Injury or Aging [scRNA-Seq]...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE306684
SRP: SRP613829
study_study_abstract: If GEO accession GSE306684 has been cited in a publication, please notify us at geo@ncbi.nlm.nih.gov to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE306684 is currently private and is scheduled to be released on Aug 31, 2026....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE306228
SRP: SRP610788
study_study_abstract: The emergence of evolutionary novelties remains a central challenge in biology, particularly for complex organs such as the vertebrate eye. While visual systems have repeatedly undergone degeneration or loss, examples of innovation are rare and poorly understood. Mechanistic insight into such gains ...
study_study_title: Evolutionary remodeling of the ventral retina enables aerial vision in the four-eyed fish Anableps anableps...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE306046
SRP: SRP610621
study_study_abstract: Single-cell transcriptomics (SCTr) offers a powerful platform for decoding the complexities of cellular stress responses to chemical exposures, capturing rare and transient subpopulations that can be obscured in bulk measurements. This study employs SCTr to profile the responses of HepaRG liver cell...
study_study_title: Decoding cellular stress states for toxicology using single-cell transcriptomics [scRNA-Seq]...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE306096
SRP: SRP610619
study_study_abstract: Liver fibrosis is a severe disease with few treatment options due to the poor quality of the available animal and in vitro models. To address this, human hepatic organoids were grown in microwells (i.e., microHOs) to provide a robust, live cell imaging platform for serially evaluating the anti-fibro...
study_study_title: AI-assisted Drug Re-purposing for Human Liver Fibrosis...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE304456
SRP: SRP606431
study_study_abstract: If GEO accession GSE304456 has been cited in a publication, please notify us at geo@ncbi.nlm.nih.gov to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE304456 is currently private and is scheduled to be released on Mar 31, 2026....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE299409
SRP: SRP591195
study_study_abstract: We used single-cell RNA sequencing with the Evercode™ WT kit (Parse Biosciences) to profile kidney immune cells in a mouse model of ischemia-reperfusion injury (IRI), with or without treatment with the SYK inhibitor Entospletinib. The dataset captures immune dynamics at early and late stages of inju...
study_study_title: Effect of the SYK Inhibitor Entospletinib on Renal Inflammation and the Transition from Acute Kidney Injury to Chronic Kidney Disease Induced by Ischemia-Reperfusion Injury...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE299005
SRP: SRP589942
study_study_abstract: Neuropsychiatric complications including depression and cognitive decline develop in the years after traumatic brain injury (TBI), negatively affecting quality of life. Microglial and type 1 interferon (IFN-I) responses are associated with the transition from acute to chronic neuroinflammation after...
study_study_title: Impaired cortical neuronal homeostasis and cognition after diffuse traumatic brain injury are dependent on microglia and type I interferon responses...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE297427
SRP: SRP586001
study_study_abstract: Osteosarcoma (OSA) has a dismal prognosis despite surgical resection and multiagent chemotherapy. While adoptive natural killer (NK) cell therapies have been successful in hematological malignancies, the application in solid tumors is challenging due to a tumor microenvironment (TME) that impairs NK...
study_study_title: CXCL10-induced chemotaxis of ex vivo-expanded natural killer cells combined with NKTR-255 enhances anti-tumor efficacy in osteosarcoma...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE297299
SRP: SRP585605
study_study_abstract: Chemotherapy resistance remains a critical barrier in cancer treatment, partly driven by polyploid cells that survive therapy and contribute to tumor recurrence. Here, we investigated epigenomic and transcriptional changes associated with cisplatin-surviving polyploid cells compared to parental canc...
study_study_title: Polyploid cisplatin-resistant cancer cells have altered nuclear organization and epigenomic status...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE297023
SRP: SRP584959
study_study_abstract: Most cancers are diagnosed in people over the age of sixty, but little is known about how age impacts tumorigenesis. While aging is accompanied by mutation accumulation — widely understood to contribute to cancer risk — it is also associated with numerous other cellular and molecular changes likely ...
study_study_title: Aging represses oncogenic KRAS-driven lung tumorigenesis and alters tumor suppression...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE296547
SRP: SRP583610
study_study_abstract: Human early embryos develop under physiological hypoxia, but how hypoxia regulates human lung organogenesis remains little known. We have investigated oxygen availability effects on the human lung epithelium using organoids. We find first-trimester lung epithelial progenitors remain undifferentiated...
study_study_title: Hypoxia promotes airway differentiation in the human lung epithelium [scRNAseq_hypoxia_AT2]...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE296244
SRP: SRP582847
study_study_abstract: A novel, cost-effective nucleic acid (NA) isolation method for purifying total NA, DNA, or RNA from both two- and three-dimensional cell cultures has been developed at the Norwegian University of Science and Technology utilizing NAxtra magnetic nanoparticles. This method achieves comparable yields t...
study_study_title: Rapid DNA and RNA isolation from few or single cells using low-cost NAxtra magnetic nanoparticles...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE295527
SRP: SRP581094
study_study_abstract: The rapid development of updated and new commercially available single-cell transcriptomics platforms is providing a range of experimental options. Cost, sensitivity, throughput, flexibility, and ease of use influence that selection. We performed a comprehensive comparison of single-cell transcrip...
study_study_title: Evaluating the practical aspects and performance of commercial single-cell RNA sequencing technologies...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE295359
SRP: SRP580608
study_study_abstract: Alloreactive T cells mediate graft-versus-leukemia (GvL) reactions and acute graft-versus-host disease (aGvHD) in AML patients following allogeneic hematopoietic stem cell transplantation. To investigate biomarkers that identify alloreactive T cells associated with either beneficial GvL or detriment...
study_study_title: Mega-scale single-cell profiling reveals novel biomarkers associated with acute GvHD after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE292745
SRP: SRP572670
study_study_abstract: Cerebral hemodynamics are crucial for brain homeostasis and serve as a key proxy for brain activity. Although this process involves coordinated interaction between vessels, neurons and glial cells, its dysregulation in neuroinflammation is not well understood. We used in vivo mesoscopic functional u...
study_study_title: Induction of hemodynamic traveling waves by glial-driven vasomotion in a rat model of neuroinflammation: implications for functional neuroimaging...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE291674
SRP: SRP569656
study_study_abstract: Loss-of-function variants of the ABCA7 gene are associated with the increased risk of Alzheimer's disease (AD). How neuronal ABCA7 contributes to AD pathogenesis is unknown. Using neuron-specific Abca7 knockout mice (nAbca7-/-) with or without 5×FAD amyloid model background and postmortem AD brains,...
study_study_title: Neuronal ABCA7 deficiency aggravates mitochondrial dysfunction and neurodegeneration in Alzheimer's disease [5xFAD_snRNAseq]...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE289845
SRP: SRP564833
study_study_abstract: We performed single cell sequencing using the Parse Biosciences WT kit to evaluate changes in dendritic cell populations following induction of experimental autoimmune encephalomyelitis. Mice in this experiment previously received CD8+ T cells from donor mice that had been immunized with PLP178-191 ...
study_study_title: Myelin-reactive CD8+ T cells influence conventional dendritic cell subsets towards a mature and regulatory phenotype in experimental autoimmune encephalomyelitis...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE287852
SRP: SRP559435
study_study_abstract: Transcription factor (TF) screens have enabled efficient production of a few cell types; however, engineering cell types that require complex TF combinations remains challenging. Here, we report an iterative, high-throughput single-cell TF screening method that enables identification of TF combinati...
study_study_title: Iterative transcription factor screening enables rapid generation of microglia-like cells from human iPSC -Single cell transcriptome timecourse analysis of TFiMGLs after SCF-MCI (SPI1, FLI1, CEBPA, CEBPB, IRF8, and Mef2C) induction....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE286901
SRP: SRP557889
study_study_abstract: If GEO accession GSE286901 has been cited in a publication, please notify us at geo@ncbi.nlm.nih.gov to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE286901 is currently private and is scheduled to be released on Mar 10, 2026....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE285843
SRP: SRP556153
study_study_abstract: Single-cell RNA sequencing technologies provide insights into gene expression at the cellular level, enabling detailed analysis of cellular heterogeneity. In this study, we systematically compared two scRNA-seq platforms—10X Genomics and Parse Biosciences—using human peripheral blood mononuclear cel...
study_study_title: Systematic Comparison of 10X Genomics and Parse Single Cell RNA Technologies across PBMC and CD8+ TEMRA Cells...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE313958
SRP: SRP656069
study_study_abstract: A longstanding barrier in genome engineering with CRISPR-Cas9 has been the inability to characterize editing outcomes at single-cell resolution. We present "Superb-seq", a new scRNA-seq method that measures on-target and off-target genome edits and associated transcriptomes. In contrast to Perturb-s...
study_study_title: Joint single-cell profiling of Cas9 edits and transcriptomes reveals on- and off-target effects on gene expression (RNA-seq)...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE283982
SRP: SRP550602
study_study_abstract: Despite centuries of research, metastatic cancer remains incurable due to resistance against all conventional cancer therapeutics. Alternative strategies leveraging non-proliferative vulnerabilities in cancer are required to overcome cancer recurrence. Ferroptosis is an iron dependent cell death pat...
study_study_title: Mismanagement of Cellular Iron Leads to Ferroptosis Susceptibility in Cancer Cells Surviving Chemotherapy...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE283186
SRP: SRP548416
study_study_abstract: The human nephron is a highly patterned tubular structure. Approximately 1 million nephrons form in each kidney during embryonic and fetal development and develop specialized cells that regulate bodily fluid homeostasis, blood pressure, and urine secretion throughout life. This raises the question o...
study_study_title: Axial Nephron Fate Switching Demonstrates a Plastic System Tunable on Demand...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE283038
SRP: SRP548062
study_study_abstract: CD4? T cells are believed to be essential for effective CD8? T cell responses against hepatotropic viruses like hepatitis B virus (HBV). However, the specific locations and the cellular and molecular mechanisms through which CD4? T cells help CD8? T cells remain unclear. In this study, we generated ...
study_study_title: CD4+ T cells license Kupffer cells to reverse the CD8+ T cell dysfunction induced by hepatocellular priming...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE282851
SRP: SRP547691
study_study_abstract: Epigenetic dysregulation is widespread in cancer. However, the specific epigenetic regulators and the processes they control to drive cancer phenotypes are poorly understood. We employed a novel, scalable and high-throughput in vivo method to perform iterative functional screens of >250 epigenetic r...
study_study_title: Functional mapping of epigenomic regulators uncovers coordinated tumor suppression by the HBO1 and MLL1 complexes [scRNA-seq]...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE282418
SRP: SRP546485
study_study_abstract: If GEO accession GSE282418 has been cited in a publication, please notify us at geo@ncbi.nlm.nih.gov to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE282418 is currently private and is scheduled to be released on Nov 18, 2027....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE281932
SRP: SRP545300
study_study_abstract: Whilst M. bovis Bacillus Calmette-Guérin (BCG) therapy remains the gold-standard for treatment of high-risk non-muscle invasive bladder cancer (BC), 30-40% of patients fail therapy, resulting in disease recurrence and progression. Loss of glutathione-S-transferase theta 2 (GSTT2) expression has been...
study_study_title: Glutathione-S-transferase theta 2 (GSTT2) modulates the tumor microenvironment and the response to BCG immunotherapy in a murine orthotopic model of bladder cancer...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE281535
SRP: SRP544328
study_study_abstract: Midbrain dopaminergic neuron (mDA) differentiation protocols for Parkinson's disease (PD) modeling and cell replacement therapy lack comprehensive transcriptomic evaluations against in vivo references. To address this, we constructed an integrated human fetal whole brain atlas and a midbrain subatla...
study_study_title: BrainSTEM: A multi-resolution fetal brain atlas to assess the fidelity of human midbrain cultures...
--------------------------------------------------------------------------------
Save Results¶
Save the complete results to a file for further analysis:
[9]:
if not df.empty:
# Save full results
output_file = "parse_bioscience_datasets.tsv"
df.to_csv(output_file, sep="\t", index=False)
print(f"Full results saved to: {output_file}")
# Also save the study-level summary
if "studies_summary" in locals():
summary_file = "parse_bioscience_studies_summary.tsv"
studies_summary.to_csv(summary_file, sep="\t", index=False)
print(f"Study summary saved to: {summary_file}")
print(f"\nTotal datasets found: {len(df)}")
print(
f"Total unique studies: {len(unique_studies) if 'unique_studies' in locals() else 'N/A'}"
)
Full results saved to: parse_bioscience_datasets.tsv
Study summary saved to: parse_bioscience_studies_summary.tsv
Total datasets found: 500
Total unique studies: 54
Alternative Search Strategies¶
Since Parse Bioscience datasets might not always explicitly mention “Parse Bioscience” in metadata, here are alternative search strategies:
1. Search for SPLiT-seq (Parse’s technology)¶
Parse Biosciences uses SPLiT-seq (split-pool ligation-based transcriptome sequencing) technology.
[10]:
# Search for SPLiT-seq technology
print("Searching for SPLiT-seq / combinatorial indexing datasets...")
print("This may include Parse Bioscience and similar technologies.\n")
split_seq_instance = GeoSearch(
verbosity=2,
return_max=100,
geo_query="SPLiT-seq OR split-seq OR combinatorial indexing single cell",
)
split_seq_instance.search()
split_seq_df = split_seq_instance.get_df()
if not split_seq_df.empty:
print(f"Found {len(split_seq_df)} entries with SPLiT-seq/combinatorial indexing")
if "study_alias" in split_seq_df.columns:
split_seq_studies = split_seq_df["study_alias"].unique()
print(f"Unique studies: {len(split_seq_studies)}")
print(f"\nGSE IDs: {sorted(split_seq_studies)}")
# Show organisms
if "sample_scientific_name" in split_seq_df.columns:
print(f"\nOrganisms:")
print(split_seq_df["sample_scientific_name"].value_counts())
else:
print("No results found with SPLiT-seq search")
# You can also try other search terms
print("\n" + "=" * 80)
print("Other useful search terms for Parse/single-cell datasets:")
print("- 'Parse Evercode' (Parse's platform name)")
print("- 'combinatorial barcoding'")
print("- Specific organisms: 'Parse Bioscience Homo sapiens'")
print("=" * 80)
Searching for SPLiT-seq / combinatorial indexing datasets...
This may include Parse Bioscience and similar technologies.
Found 100 entries with SPLiT-seq/combinatorial indexing
================================================================================
Other useful search terms for Parse/single-cell datasets:
- 'Parse Evercode' (Parse's platform name)
- 'combinatorial barcoding'
- Specific organisms: 'Parse Bioscience Homo sapiens'
================================================================================
Command Line Usage¶
You can also perform this search from the command line:
## # Basic search for Parse Bioscience datasets
pysradb search --db geo \
--geo-query "Parse Bioscience" \
--max 500 \
--verbosity 3 \
--saveto parse_bioscience_results.tsv
## # Search for SPLiT-seq technology
pysradb search --db geo \
--geo-query "SPLiT-seq OR split-seq" \
--max 200 \
--verbosity 2 \
--saveto split_seq_results.tsv
## # Search with organism filter
pysradb search --db geo \
--geo-query "Parse Bioscience" \
--organism "Homo sapiens" \
--max 200 \
--saveto parse_human_results.tsv
## # Note: Date filtering can be added with --publication-date flag
## # but may miss some results due to how GEO indexes publication dates
## # Example: --publication-date 01-01-2020:31-12-2024