This notebook demonstrates how to search for all Parse Bioscience single-cell sequencing datasets in the Gene Expression Omnibus (GEO) database.
Parse Biosciences provides single-cell RNA sequencing technology using a combinatorial barcoding approach. This example shows how to find all Parse Bioscience datasets published from January 1, 2020 to the present day.
Parse BioScience Search¶
This notebook demonstrates how to parse and analyze search results from BioScience datasets.
[1]:
# Install pysradb if not already installed
try:
import pysradb
print(f"pysradb {pysradb.__version__} is already installed")
except ImportError:
print("Installing pysradb from GitHub...")
import sys
!{sys.executable} -m pip install -q git+https://github.com/saketkc/pysradb
print("pysradb installed successfully!")
pysradb 3.0.0.dev0 is already installed
/home/runner/work/pysradb/pysradb/pysradb/download.py:15: TqdmExperimentalWarning: Using `tqdm.autonotebook.tqdm` in notebook mode. Use `tqdm.tqdm` instead to force console mode (e.g. in jupyter console)
from tqdm.autonotebook import tqdm
Setup¶
First, let’s import the necessary modules and set up our search parameters:
[2]:
from datetime import datetime
import pandas as pd
from pysradb.search import GeoSearch
# Set pandas display options for better readability
pd.set_option("display.max_columns", None)
pd.set_option("display.max_colwidth", 100)
Search for Parse Bioscience Datasets¶
We’ll search GEO for all datasets that mention “Parse Bioscience”.
Note: The GEO search date filtering can be restrictive and may miss some results. We’ll search without date constraints first, then you can filter the results by date manually if needed.
[3]:
# Search for Parse Bioscience datasets
# Note: Date filtering with GeoSearch can be restrictive and may miss results
# We'll first search without date filter, then filter results manually if needed
print("Searching for Parse Bioscience datasets...")
print("This may take a few minutes...\n")
# Create search instance
# We use verbosity=3 to get all available metadata
# Starting without date filter to ensure we capture all datasets
instance = GeoSearch(
verbosity=3,
return_max=500, # Adjust if needed
geo_query="Parse Biosciences OR Evercode",
)
# Execute the search
instance.search()
# Get results as DataFrame
df = instance.get_df()
print(f"\nFound {len(df)} total entries matching the search criteria")
# Optional: Filter by date manually if needed
# Uncomment the following to filter by publication date
# if not df.empty and 'run_1_published' in df.columns:
# df['pub_date'] = pd.to_datetime(df['run_1_published'], errors='coerce')
# df = df[df['pub_date'] >= '2020-01-01']
# print(f"After date filtering (>=2020-01-01): {len(df)} entries")
Searching for Parse Bioscience datasets...
This may take a few minutes...
Found 500 total entries matching the search criteria
[4]:
df
[4]:
| study_accession | experiment_accession | experiment_title | sample_taxon_id | sample_scientific_name | experiment_library_strategy | experiment_library_source | experiment_library_selection | sample_accession | sample_alias | experiment_instrument_model | pool_member_spots | run_1_size | run_1_accession | run_1_total_spots | run_1_total_bases | experiment_alias | experiment_external_id | experiment_external_id_1 | experiment_external_id_1_namespace | experiment_library_construction_protocol | experiment_library_name | experiment_platform | experiment_sample_descriptor_accession | library_layout | pool_external_id | pool_member_accession | pool_member_bases | pool_member_member_name | pool_member_organism | pool_member_sample_name | pool_member_sample_title | pool_member_tax_id | run_10_accession | run_10_alias | run_10_base_A_count | run_10_base_C_count | run_10_base_G_count | run_10_base_N_count | run_10_base_T_count | run_10_cloudfile_1_filetype | run_10_cloudfile_1_location | run_10_cloudfile_1_provider | run_10_cloudfile_2_filetype | run_10_cloudfile_2_location | run_10_cloudfile_2_provider | run_10_cloudfile_3_filetype | run_10_cloudfile_3_location | run_10_cloudfile_3_provider | run_10_cloudfile_4_filetype | run_10_cloudfile_4_location | run_10_cloudfile_4_provider | run_10_cluster_name | run_10_database_1 | run_10_has_taxanalysis | run_10_is_public | run_10_load_done | run_10_published | run_10_size | run_10_srafile_1_alternative_1_access_type | run_10_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_10_srafile_1_alternative_1_org | run_10_srafile_1_alternative_1_url | run_10_srafile_1_alternative_2_access_type | run_10_srafile_1_alternative_2_free_egress | run_10_srafile_1_alternative_2_org | run_10_srafile_1_alternative_2_url | run_10_srafile_1_alternative_3_access_type | run_10_srafile_1_alternative_3_free_egress | run_10_srafile_1_alternative_3_org | run_10_srafile_1_alternative_3_url | run_10_srafile_1_cluster | run_10_srafile_1_date | run_10_srafile_1_filename | run_10_srafile_1_md5 | run_10_srafile_1_semantic_name | run_10_srafile_1_size | run_10_srafile_1_sratoolkit | run_10_srafile_1_supertype | run_10_srafile_1_url | run_10_srafile_1_version | run_10_srafile_2_alternative_1_access_type | run_10_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_10_srafile_2_alternative_1_org | run_10_srafile_2_alternative_1_url | run_10_srafile_2_cluster | run_10_srafile_2_date | run_10_srafile_2_filename | run_10_srafile_2_md5 | run_10_srafile_2_semantic_name | run_10_srafile_2_size | run_10_srafile_2_sratoolkit | run_10_srafile_2_supertype | run_10_srafile_2_url | run_10_srafile_2_version | run_10_srafile_3_alternative_1_access_type | run_10_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_10_srafile_3_alternative_1_org | run_10_srafile_3_alternative_1_url | run_10_srafile_3_alternative_2_access_type | run_10_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_10_srafile_3_alternative_2_org | run_10_srafile_3_alternative_2_url | run_10_srafile_3_alternative_3_access_type | run_10_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_10_srafile_3_alternative_3_org | run_10_srafile_3_alternative_3_url | run_10_srafile_3_cluster | run_10_srafile_3_date | run_10_srafile_3_filename | run_10_srafile_3_md5 | run_10_srafile_3_semantic_name | run_10_srafile_3_size | run_10_srafile_3_sratoolkit | run_10_srafile_3_supertype | run_10_srafile_3_url | run_10_srafile_3_version | run_10_srafile_4_alternative_1_access_type | run_10_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_10_srafile_4_alternative_1_org | run_10_srafile_4_alternative_1_url | run_10_srafile_4_alternative_2_access_type | run_10_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_10_srafile_4_alternative_2_org | run_10_srafile_4_alternative_2_url | run_10_srafile_4_alternative_3_access_type | run_10_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_10_srafile_4_alternative_3_org | run_10_srafile_4_alternative_3_url | run_10_srafile_4_cluster | run_10_srafile_4_date | run_10_srafile_4_filename | run_10_srafile_4_md5 | run_10_srafile_4_semantic_name | run_10_srafile_4_size | run_10_srafile_4_sratoolkit | run_10_srafile_4_supertype | run_10_srafile_4_url | run_10_srafile_4_version | run_10_static_data_available | run_10_total_base_count | run_10_total_base_cs_native | run_10_total_bases | run_10_total_spots | run_11_accession | run_11_alias | run_11_base_A_count | run_11_base_C_count | run_11_base_G_count | run_11_base_N_count | run_11_base_T_count | run_11_cloudfile_1_filetype | run_11_cloudfile_1_location | run_11_cloudfile_1_provider | run_11_cloudfile_2_filetype | run_11_cloudfile_2_location | run_11_cloudfile_2_provider | run_11_cloudfile_3_filetype | run_11_cloudfile_3_location | run_11_cloudfile_3_provider | run_11_cloudfile_4_filetype | run_11_cloudfile_4_location | run_11_cloudfile_4_provider | run_11_cluster_name | run_11_database_1 | run_11_has_taxanalysis | run_11_is_public | run_11_load_done | run_11_published | run_11_size | run_11_srafile_1_alternative_1_access_type | run_11_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_11_srafile_1_alternative_1_org | run_11_srafile_1_alternative_1_url | run_11_srafile_1_alternative_2_access_type | run_11_srafile_1_alternative_2_free_egress | run_11_srafile_1_alternative_2_org | run_11_srafile_1_alternative_2_url | run_11_srafile_1_alternative_3_access_type | run_11_srafile_1_alternative_3_free_egress | run_11_srafile_1_alternative_3_org | run_11_srafile_1_alternative_3_url | run_11_srafile_1_cluster | run_11_srafile_1_date | run_11_srafile_1_filename | run_11_srafile_1_md5 | run_11_srafile_1_semantic_name | run_11_srafile_1_size | run_11_srafile_1_sratoolkit | run_11_srafile_1_supertype | run_11_srafile_1_url | run_11_srafile_1_version | run_11_srafile_2_alternative_1_access_type | run_11_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_11_srafile_2_alternative_1_org | run_11_srafile_2_alternative_1_url | run_11_srafile_2_cluster | run_11_srafile_2_date | run_11_srafile_2_filename | run_11_srafile_2_md5 | run_11_srafile_2_semantic_name | run_11_srafile_2_size | run_11_srafile_2_sratoolkit | run_11_srafile_2_supertype | run_11_srafile_2_url | run_11_srafile_2_version | run_11_srafile_3_alternative_1_access_type | run_11_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_11_srafile_3_alternative_1_org | run_11_srafile_3_alternative_1_url | run_11_srafile_3_alternative_2_access_type | run_11_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_11_srafile_3_alternative_2_org | run_11_srafile_3_alternative_2_url | run_11_srafile_3_alternative_3_access_type | run_11_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_11_srafile_3_alternative_3_org | run_11_srafile_3_alternative_3_url | run_11_srafile_3_cluster | run_11_srafile_3_date | run_11_srafile_3_filename | run_11_srafile_3_md5 | run_11_srafile_3_semantic_name | run_11_srafile_3_size | run_11_srafile_3_sratoolkit | run_11_srafile_3_supertype | run_11_srafile_3_url | run_11_srafile_3_version | run_11_srafile_4_alternative_1_access_type | run_11_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_11_srafile_4_alternative_1_org | run_11_srafile_4_alternative_1_url | run_11_srafile_4_alternative_2_access_type | run_11_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_11_srafile_4_alternative_2_org | run_11_srafile_4_alternative_2_url | run_11_srafile_4_alternative_3_access_type | run_11_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_11_srafile_4_alternative_3_org | run_11_srafile_4_alternative_3_url | run_11_srafile_4_cluster | run_11_srafile_4_date | run_11_srafile_4_filename | run_11_srafile_4_md5 | run_11_srafile_4_semantic_name | run_11_srafile_4_size | run_11_srafile_4_sratoolkit | run_11_srafile_4_supertype | run_11_srafile_4_url | run_11_srafile_4_version | run_11_static_data_available | run_11_total_base_count | run_11_total_base_cs_native | run_11_total_bases | run_11_total_spots | run_12_accession | run_12_alias | run_12_base_A_count | run_12_base_C_count | run_12_base_G_count | run_12_base_N_count | run_12_base_T_count | run_12_cloudfile_1_filetype | run_12_cloudfile_1_location | run_12_cloudfile_1_provider | run_12_cloudfile_2_filetype | run_12_cloudfile_2_location | run_12_cloudfile_2_provider | run_12_cloudfile_3_filetype | run_12_cloudfile_3_location | run_12_cloudfile_3_provider | run_12_cloudfile_4_filetype | run_12_cloudfile_4_location | run_12_cloudfile_4_provider | run_12_cluster_name | run_12_database_1 | run_12_has_taxanalysis | run_12_is_public | run_12_load_done | run_12_published | run_12_size | run_12_srafile_1_alternative_1_access_type | run_12_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_12_srafile_1_alternative_1_org | run_12_srafile_1_alternative_1_url | run_12_srafile_1_alternative_2_access_type | run_12_srafile_1_alternative_2_free_egress | run_12_srafile_1_alternative_2_org | run_12_srafile_1_alternative_2_url | run_12_srafile_1_alternative_3_access_type | run_12_srafile_1_alternative_3_free_egress | run_12_srafile_1_alternative_3_org | run_12_srafile_1_alternative_3_url | run_12_srafile_1_cluster | run_12_srafile_1_date | run_12_srafile_1_filename | run_12_srafile_1_md5 | run_12_srafile_1_semantic_name | run_12_srafile_1_size | run_12_srafile_1_sratoolkit | run_12_srafile_1_supertype | run_12_srafile_1_url | run_12_srafile_1_version | run_12_srafile_2_alternative_1_access_type | run_12_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_12_srafile_2_alternative_1_org | run_12_srafile_2_alternative_1_url | run_12_srafile_2_cluster | run_12_srafile_2_date | run_12_srafile_2_filename | run_12_srafile_2_md5 | run_12_srafile_2_semantic_name | run_12_srafile_2_size | run_12_srafile_2_sratoolkit | run_12_srafile_2_supertype | run_12_srafile_2_url | run_12_srafile_2_version | run_12_srafile_3_alternative_1_access_type | run_12_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_12_srafile_3_alternative_1_org | run_12_srafile_3_alternative_1_url | run_12_srafile_3_alternative_2_access_type | run_12_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_12_srafile_3_alternative_2_org | run_12_srafile_3_alternative_2_url | run_12_srafile_3_alternative_3_access_type | run_12_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_12_srafile_3_alternative_3_org | run_12_srafile_3_alternative_3_url | run_12_srafile_3_cluster | run_12_srafile_3_date | run_12_srafile_3_filename | run_12_srafile_3_md5 | run_12_srafile_3_semantic_name | run_12_srafile_3_size | run_12_srafile_3_sratoolkit | run_12_srafile_3_supertype | run_12_srafile_3_url | run_12_srafile_3_version | run_12_srafile_4_alternative_1_access_type | run_12_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_12_srafile_4_alternative_1_org | run_12_srafile_4_alternative_1_url | run_12_srafile_4_alternative_2_access_type | run_12_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_12_srafile_4_alternative_2_org | run_12_srafile_4_alternative_2_url | run_12_srafile_4_alternative_3_access_type | run_12_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_12_srafile_4_alternative_3_org | run_12_srafile_4_alternative_3_url | run_12_srafile_4_cluster | run_12_srafile_4_date | run_12_srafile_4_filename | run_12_srafile_4_md5 | run_12_srafile_4_semantic_name | run_12_srafile_4_size | run_12_srafile_4_sratoolkit | run_12_srafile_4_supertype | run_12_srafile_4_url | run_12_srafile_4_version | run_12_static_data_available | run_12_total_base_count | run_12_total_base_cs_native | run_12_total_bases | run_12_total_spots | run_13_accession | run_13_alias | run_13_base_A_count | run_13_base_C_count | run_13_base_G_count | run_13_base_N_count | run_13_base_T_count | run_13_cloudfile_1_filetype | run_13_cloudfile_1_location | run_13_cloudfile_1_provider | run_13_cloudfile_2_filetype | run_13_cloudfile_2_location | run_13_cloudfile_2_provider | run_13_cloudfile_3_filetype | run_13_cloudfile_3_location | run_13_cloudfile_3_provider | run_13_cloudfile_4_filetype | run_13_cloudfile_4_location | run_13_cloudfile_4_provider | run_13_cluster_name | run_13_database_1 | run_13_has_taxanalysis | run_13_is_public | run_13_load_done | run_13_published | run_13_size | run_13_srafile_1_alternative_1_access_type | run_13_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_13_srafile_1_alternative_1_org | run_13_srafile_1_alternative_1_url | run_13_srafile_1_alternative_2_access_type | run_13_srafile_1_alternative_2_free_egress | run_13_srafile_1_alternative_2_org | run_13_srafile_1_alternative_2_url | run_13_srafile_1_alternative_3_access_type | run_13_srafile_1_alternative_3_free_egress | run_13_srafile_1_alternative_3_org | run_13_srafile_1_alternative_3_url | run_13_srafile_1_cluster | run_13_srafile_1_date | run_13_srafile_1_filename | run_13_srafile_1_md5 | run_13_srafile_1_semantic_name | run_13_srafile_1_size | run_13_srafile_1_sratoolkit | run_13_srafile_1_supertype | run_13_srafile_1_url | run_13_srafile_1_version | run_13_srafile_2_alternative_1_access_type | run_13_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_13_srafile_2_alternative_1_org | run_13_srafile_2_alternative_1_url | run_13_srafile_2_cluster | run_13_srafile_2_date | run_13_srafile_2_filename | run_13_srafile_2_md5 | run_13_srafile_2_semantic_name | run_13_srafile_2_size | run_13_srafile_2_sratoolkit | run_13_srafile_2_supertype | run_13_srafile_2_url | run_13_srafile_2_version | run_13_srafile_3_alternative_1_access_type | run_13_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_13_srafile_3_alternative_1_org | run_13_srafile_3_alternative_1_url | run_13_srafile_3_alternative_2_access_type | run_13_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_13_srafile_3_alternative_2_org | run_13_srafile_3_alternative_2_url | run_13_srafile_3_alternative_3_access_type | run_13_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_13_srafile_3_alternative_3_org | run_13_srafile_3_alternative_3_url | run_13_srafile_3_cluster | run_13_srafile_3_date | run_13_srafile_3_filename | run_13_srafile_3_md5 | run_13_srafile_3_semantic_name | run_13_srafile_3_size | run_13_srafile_3_sratoolkit | run_13_srafile_3_supertype | run_13_srafile_3_url | run_13_srafile_3_version | run_13_srafile_4_alternative_1_access_type | run_13_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_13_srafile_4_alternative_1_org | run_13_srafile_4_alternative_1_url | run_13_srafile_4_alternative_2_access_type | run_13_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_13_srafile_4_alternative_2_org | run_13_srafile_4_alternative_2_url | run_13_srafile_4_alternative_3_access_type | run_13_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_13_srafile_4_alternative_3_org | run_13_srafile_4_alternative_3_url | run_13_srafile_4_cluster | run_13_srafile_4_date | run_13_srafile_4_filename | run_13_srafile_4_md5 | run_13_srafile_4_semantic_name | run_13_srafile_4_size | run_13_srafile_4_sratoolkit | run_13_srafile_4_supertype | run_13_srafile_4_url | run_13_srafile_4_version | run_13_static_data_available | run_13_total_base_count | run_13_total_base_cs_native | run_13_total_bases | run_13_total_spots | run_14_accession | run_14_alias | run_14_base_A_count | run_14_base_C_count | run_14_base_G_count | run_14_base_N_count | run_14_base_T_count | run_14_cloudfile_1_filetype | run_14_cloudfile_1_location | run_14_cloudfile_1_provider | run_14_cloudfile_2_filetype | run_14_cloudfile_2_location | run_14_cloudfile_2_provider | run_14_cloudfile_3_filetype | run_14_cloudfile_3_location | run_14_cloudfile_3_provider | run_14_cloudfile_4_filetype | run_14_cloudfile_4_location | run_14_cloudfile_4_provider | run_14_cluster_name | run_14_database_1 | run_14_has_taxanalysis | run_14_is_public | run_14_load_done | run_14_published | run_14_size | run_14_srafile_1_alternative_1_access_type | run_14_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_14_srafile_1_alternative_1_org | run_14_srafile_1_alternative_1_url | run_14_srafile_1_alternative_2_access_type | run_14_srafile_1_alternative_2_free_egress | run_14_srafile_1_alternative_2_org | run_14_srafile_1_alternative_2_url | run_14_srafile_1_alternative_3_access_type | run_14_srafile_1_alternative_3_free_egress | run_14_srafile_1_alternative_3_org | run_14_srafile_1_alternative_3_url | run_14_srafile_1_cluster | run_14_srafile_1_date | run_14_srafile_1_filename | run_14_srafile_1_md5 | run_14_srafile_1_semantic_name | run_14_srafile_1_size | run_14_srafile_1_sratoolkit | run_14_srafile_1_supertype | run_14_srafile_1_url | run_14_srafile_1_version | run_14_srafile_2_alternative_1_access_type | run_14_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_14_srafile_2_alternative_1_org | run_14_srafile_2_alternative_1_url | run_14_srafile_2_cluster | run_14_srafile_2_date | run_14_srafile_2_filename | run_14_srafile_2_md5 | run_14_srafile_2_semantic_name | run_14_srafile_2_size | run_14_srafile_2_sratoolkit | run_14_srafile_2_supertype | run_14_srafile_2_url | run_14_srafile_2_version | run_14_srafile_3_alternative_1_access_type | run_14_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_14_srafile_3_alternative_1_org | run_14_srafile_3_alternative_1_url | run_14_srafile_3_alternative_2_access_type | run_14_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_14_srafile_3_alternative_2_org | run_14_srafile_3_alternative_2_url | run_14_srafile_3_alternative_3_access_type | run_14_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_14_srafile_3_alternative_3_org | run_14_srafile_3_alternative_3_url | run_14_srafile_3_cluster | run_14_srafile_3_date | run_14_srafile_3_filename | run_14_srafile_3_md5 | run_14_srafile_3_semantic_name | run_14_srafile_3_size | run_14_srafile_3_sratoolkit | run_14_srafile_3_supertype | run_14_srafile_3_url | run_14_srafile_3_version | run_14_srafile_4_alternative_1_access_type | run_14_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_14_srafile_4_alternative_1_org | run_14_srafile_4_alternative_1_url | run_14_srafile_4_alternative_2_access_type | run_14_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_14_srafile_4_alternative_2_org | run_14_srafile_4_alternative_2_url | run_14_srafile_4_alternative_3_access_type | run_14_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_14_srafile_4_alternative_3_org | run_14_srafile_4_alternative_3_url | run_14_srafile_4_cluster | run_14_srafile_4_date | run_14_srafile_4_filename | run_14_srafile_4_md5 | run_14_srafile_4_semantic_name | run_14_srafile_4_size | run_14_srafile_4_sratoolkit | run_14_srafile_4_supertype | run_14_srafile_4_url | run_14_srafile_4_version | run_14_static_data_available | run_14_total_base_count | run_14_total_base_cs_native | run_14_total_bases | run_14_total_spots | run_15_accession | run_15_alias | run_15_base_A_count | run_15_base_C_count | run_15_base_G_count | run_15_base_N_count | run_15_base_T_count | run_15_cloudfile_1_filetype | run_15_cloudfile_1_location | run_15_cloudfile_1_provider | run_15_cloudfile_2_filetype | run_15_cloudfile_2_location | run_15_cloudfile_2_provider | run_15_cloudfile_3_filetype | run_15_cloudfile_3_location | run_15_cloudfile_3_provider | run_15_cloudfile_4_filetype | run_15_cloudfile_4_location | run_15_cloudfile_4_provider | run_15_cluster_name | run_15_database_1 | run_15_has_taxanalysis | run_15_is_public | run_15_load_done | run_15_published | run_15_size | run_15_srafile_1_alternative_1_access_type | run_15_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_15_srafile_1_alternative_1_org | run_15_srafile_1_alternative_1_url | run_15_srafile_1_alternative_2_access_type | run_15_srafile_1_alternative_2_free_egress | run_15_srafile_1_alternative_2_org | run_15_srafile_1_alternative_2_url | run_15_srafile_1_alternative_3_access_type | run_15_srafile_1_alternative_3_free_egress | run_15_srafile_1_alternative_3_org | run_15_srafile_1_alternative_3_url | run_15_srafile_1_cluster | run_15_srafile_1_date | run_15_srafile_1_filename | run_15_srafile_1_md5 | run_15_srafile_1_semantic_name | run_15_srafile_1_size | run_15_srafile_1_sratoolkit | run_15_srafile_1_supertype | run_15_srafile_1_url | run_15_srafile_1_version | run_15_srafile_2_alternative_1_access_type | run_15_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_15_srafile_2_alternative_1_org | run_15_srafile_2_alternative_1_url | run_15_srafile_2_cluster | run_15_srafile_2_date | run_15_srafile_2_filename | run_15_srafile_2_md5 | run_15_srafile_2_semantic_name | run_15_srafile_2_size | run_15_srafile_2_sratoolkit | run_15_srafile_2_supertype | run_15_srafile_2_url | run_15_srafile_2_version | run_15_srafile_3_alternative_1_access_type | run_15_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_15_srafile_3_alternative_1_org | run_15_srafile_3_alternative_1_url | run_15_srafile_3_alternative_2_access_type | run_15_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_15_srafile_3_alternative_2_org | run_15_srafile_3_alternative_2_url | run_15_srafile_3_alternative_3_access_type | run_15_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_15_srafile_3_alternative_3_org | run_15_srafile_3_alternative_3_url | run_15_srafile_3_cluster | run_15_srafile_3_date | run_15_srafile_3_filename | run_15_srafile_3_md5 | run_15_srafile_3_semantic_name | run_15_srafile_3_size | run_15_srafile_3_sratoolkit | run_15_srafile_3_supertype | run_15_srafile_3_url | run_15_srafile_3_version | run_15_srafile_4_alternative_1_access_type | run_15_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_15_srafile_4_alternative_1_org | run_15_srafile_4_alternative_1_url | run_15_srafile_4_alternative_2_access_type | run_15_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_15_srafile_4_alternative_2_org | run_15_srafile_4_alternative_2_url | run_15_srafile_4_alternative_3_access_type | run_15_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_15_srafile_4_alternative_3_org | run_15_srafile_4_alternative_3_url | run_15_srafile_4_cluster | run_15_srafile_4_date | run_15_srafile_4_filename | run_15_srafile_4_md5 | run_15_srafile_4_semantic_name | run_15_srafile_4_size | run_15_srafile_4_sratoolkit | run_15_srafile_4_supertype | run_15_srafile_4_url | run_15_srafile_4_version | run_15_static_data_available | run_15_total_base_count | run_15_total_base_cs_native | run_15_total_bases | run_15_total_spots | run_16_accession | run_16_alias | run_16_base_A_count | run_16_base_C_count | run_16_base_G_count | run_16_base_N_count | run_16_base_T_count | run_16_cloudfile_1_filetype | run_16_cloudfile_1_location | run_16_cloudfile_1_provider | run_16_cloudfile_2_filetype | run_16_cloudfile_2_location | run_16_cloudfile_2_provider | run_16_cloudfile_3_filetype | run_16_cloudfile_3_location | run_16_cloudfile_3_provider | run_16_cloudfile_4_filetype | run_16_cloudfile_4_location | run_16_cloudfile_4_provider | run_16_cluster_name | run_16_database_1 | run_16_has_taxanalysis | run_16_is_public | run_16_load_done | run_16_published | run_16_size | run_16_srafile_1_alternative_1_access_type | run_16_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_16_srafile_1_alternative_1_org | run_16_srafile_1_alternative_1_url | run_16_srafile_1_alternative_2_access_type | run_16_srafile_1_alternative_2_free_egress | run_16_srafile_1_alternative_2_org | run_16_srafile_1_alternative_2_url | run_16_srafile_1_alternative_3_access_type | run_16_srafile_1_alternative_3_free_egress | run_16_srafile_1_alternative_3_org | run_16_srafile_1_alternative_3_url | run_16_srafile_1_cluster | run_16_srafile_1_date | run_16_srafile_1_filename | run_16_srafile_1_md5 | run_16_srafile_1_semantic_name | run_16_srafile_1_size | run_16_srafile_1_sratoolkit | run_16_srafile_1_supertype | run_16_srafile_1_url | run_16_srafile_1_version | run_16_srafile_2_alternative_1_access_type | run_16_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_16_srafile_2_alternative_1_org | run_16_srafile_2_alternative_1_url | run_16_srafile_2_cluster | run_16_srafile_2_date | run_16_srafile_2_filename | run_16_srafile_2_md5 | run_16_srafile_2_semantic_name | run_16_srafile_2_size | run_16_srafile_2_sratoolkit | run_16_srafile_2_supertype | run_16_srafile_2_url | run_16_srafile_2_version | run_16_srafile_3_alternative_1_access_type | run_16_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_16_srafile_3_alternative_1_org | run_16_srafile_3_alternative_1_url | run_16_srafile_3_alternative_2_access_type | run_16_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_16_srafile_3_alternative_2_org | run_16_srafile_3_alternative_2_url | run_16_srafile_3_alternative_3_access_type | run_16_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_16_srafile_3_alternative_3_org | run_16_srafile_3_alternative_3_url | run_16_srafile_3_cluster | run_16_srafile_3_date | run_16_srafile_3_filename | run_16_srafile_3_md5 | run_16_srafile_3_semantic_name | run_16_srafile_3_size | run_16_srafile_3_sratoolkit | run_16_srafile_3_supertype | run_16_srafile_3_url | run_16_srafile_3_version | run_16_srafile_4_alternative_1_access_type | run_16_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_16_srafile_4_alternative_1_org | run_16_srafile_4_alternative_1_url | run_16_srafile_4_alternative_2_access_type | run_16_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_16_srafile_4_alternative_2_org | run_16_srafile_4_alternative_2_url | run_16_srafile_4_alternative_3_access_type | run_16_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_16_srafile_4_alternative_3_org | run_16_srafile_4_alternative_3_url | run_16_srafile_4_cluster | run_16_srafile_4_date | run_16_srafile_4_filename | run_16_srafile_4_md5 | run_16_srafile_4_semantic_name | run_16_srafile_4_size | run_16_srafile_4_sratoolkit | run_16_srafile_4_supertype | run_16_srafile_4_url | run_16_srafile_4_version | run_16_static_data_available | run_16_total_base_count | run_16_total_base_cs_native | run_16_total_bases | run_16_total_spots | run_1_alias | run_1_base_A_count | run_1_base_C_count | run_1_base_G_count | run_1_base_N_count | run_1_base_T_count | run_1_cloudfile_1_filetype | run_1_cloudfile_1_location | run_1_cloudfile_1_provider | run_1_cloudfile_2_filetype | run_1_cloudfile_2_location | run_1_cloudfile_2_provider | run_1_cloudfile_3_filetype | run_1_cloudfile_3_location | run_1_cloudfile_3_provider | run_1_cloudfile_4_filetype | run_1_cloudfile_4_location | run_1_cloudfile_4_provider | run_1_cluster_name | run_1_database_1 | run_1_has_taxanalysis | run_1_is_public | run_1_load_done | run_1_published | run_1_srafile_1_alternative_1_access_type | run_1_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_1_srafile_1_alternative_1_org | run_1_srafile_1_alternative_1_url | run_1_srafile_1_alternative_2_access_type | run_1_srafile_1_alternative_2_free_egress | run_1_srafile_1_alternative_2_org | run_1_srafile_1_alternative_2_url | run_1_srafile_1_alternative_3_access_type | run_1_srafile_1_alternative_3_free_egress | run_1_srafile_1_alternative_3_org | run_1_srafile_1_alternative_3_url | run_1_srafile_1_cluster | run_1_srafile_1_date | run_1_srafile_1_filename | run_1_srafile_1_md5 | run_1_srafile_1_semantic_name | run_1_srafile_1_size | run_1_srafile_1_sratoolkit | run_1_srafile_1_supertype | run_1_srafile_1_url | run_1_srafile_1_version | run_1_srafile_2_alternative_1_access_type | run_1_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_1_srafile_2_alternative_1_org | run_1_srafile_2_alternative_1_url | run_1_srafile_2_alternative_2_access_type | run_1_srafile_2_alternative_2_free_egress | run_1_srafile_2_alternative_2_org | run_1_srafile_2_alternative_2_url | run_1_srafile_2_alternative_3_access_type | run_1_srafile_2_alternative_3_free_egress | run_1_srafile_2_alternative_3_org | run_1_srafile_2_alternative_3_url | run_1_srafile_2_cluster | run_1_srafile_2_date | run_1_srafile_2_filename | run_1_srafile_2_md5 | run_1_srafile_2_semantic_name | run_1_srafile_2_size | run_1_srafile_2_sratoolkit | run_1_srafile_2_supertype | run_1_srafile_2_url | run_1_srafile_2_version | run_1_srafile_3_alternative_1_access_type | run_1_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_1_srafile_3_alternative_1_org | run_1_srafile_3_alternative_1_url | run_1_srafile_3_alternative_2_access_type | run_1_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_1_srafile_3_alternative_2_org | run_1_srafile_3_alternative_2_url | run_1_srafile_3_alternative_3_access_type | run_1_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_1_srafile_3_alternative_3_org | run_1_srafile_3_alternative_3_url | run_1_srafile_3_cluster | run_1_srafile_3_date | run_1_srafile_3_filename | run_1_srafile_3_md5 | run_1_srafile_3_semantic_name | run_1_srafile_3_size | run_1_srafile_3_sratoolkit | run_1_srafile_3_supertype | run_1_srafile_3_url | run_1_srafile_3_version | run_1_srafile_4_alternative_1_access_type | run_1_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_1_srafile_4_alternative_1_org | run_1_srafile_4_alternative_1_url | run_1_srafile_4_alternative_2_access_type | run_1_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_1_srafile_4_alternative_2_org | run_1_srafile_4_alternative_2_url | run_1_srafile_4_alternative_3_access_type | run_1_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_1_srafile_4_alternative_3_org | run_1_srafile_4_alternative_3_url | run_1_srafile_4_cluster | run_1_srafile_4_date | run_1_srafile_4_filename | run_1_srafile_4_md5 | run_1_srafile_4_semantic_name | run_1_srafile_4_size | run_1_srafile_4_sratoolkit | run_1_srafile_4_supertype | run_1_srafile_4_url | run_1_srafile_4_version | run_1_srafile_5_alternative_1_access_type | run_1_srafile_5_alternative_1_free_egress | run_1_srafile_5_alternative_1_org | run_1_srafile_5_alternative_1_url | run_1_srafile_5_cluster | run_1_srafile_5_date | run_1_srafile_5_filename | run_1_srafile_5_md5 | run_1_srafile_5_semantic_name | run_1_srafile_5_size | run_1_srafile_5_sratoolkit | run_1_srafile_5_supertype | run_1_srafile_5_url | run_1_srafile_5_version | run_1_srafile_6_alternative_1_access_type | run_1_srafile_6_alternative_1_free_egress | run_1_srafile_6_alternative_1_org | run_1_srafile_6_alternative_1_url | run_1_srafile_6_alternative_2_access_type | run_1_srafile_6_alternative_2_free_egress | run_1_srafile_6_alternative_2_org | run_1_srafile_6_alternative_2_url | run_1_srafile_6_alternative_3_access_type | run_1_srafile_6_alternative_3_free_egress | run_1_srafile_6_alternative_3_org | run_1_srafile_6_alternative_3_url | run_1_srafile_6_cluster | run_1_srafile_6_date | run_1_srafile_6_filename | run_1_srafile_6_md5 | run_1_srafile_6_semantic_name | run_1_srafile_6_size | run_1_srafile_6_sratoolkit | run_1_srafile_6_supertype | run_1_srafile_6_url | run_1_srafile_6_version | run_1_static_data_available | run_1_total_base_count | run_1_total_base_cs_native | run_2_accession | run_2_alias | run_2_base_A_count | run_2_base_C_count | run_2_base_G_count | run_2_base_N_count | run_2_base_T_count | run_2_cloudfile_1_filetype | run_2_cloudfile_1_location | run_2_cloudfile_1_provider | run_2_cloudfile_2_filetype | run_2_cloudfile_2_location | run_2_cloudfile_2_provider | run_2_cloudfile_3_filetype | run_2_cloudfile_3_location | run_2_cloudfile_3_provider | run_2_cloudfile_4_filetype | run_2_cloudfile_4_location | run_2_cloudfile_4_provider | run_2_cluster_name | run_2_database_1 | run_2_has_taxanalysis | run_2_is_public | run_2_load_done | run_2_published | run_2_size | run_2_srafile_1_alternative_1_access_type | run_2_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_2_srafile_1_alternative_1_org | run_2_srafile_1_alternative_1_url | run_2_srafile_1_alternative_2_access_type | run_2_srafile_1_alternative_2_free_egress | run_2_srafile_1_alternative_2_org | run_2_srafile_1_alternative_2_url | run_2_srafile_1_alternative_3_access_type | run_2_srafile_1_alternative_3_free_egress | run_2_srafile_1_alternative_3_org | run_2_srafile_1_alternative_3_url | run_2_srafile_1_cluster | run_2_srafile_1_date | run_2_srafile_1_filename | run_2_srafile_1_md5 | run_2_srafile_1_semantic_name | run_2_srafile_1_size | run_2_srafile_1_sratoolkit | run_2_srafile_1_supertype | run_2_srafile_1_url | run_2_srafile_1_version | run_2_srafile_2_alternative_1_access_type | run_2_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_2_srafile_2_alternative_1_org | run_2_srafile_2_alternative_1_url | run_2_srafile_2_cluster | run_2_srafile_2_date | run_2_srafile_2_filename | run_2_srafile_2_md5 | run_2_srafile_2_semantic_name | run_2_srafile_2_size | run_2_srafile_2_sratoolkit | run_2_srafile_2_supertype | run_2_srafile_2_url | run_2_srafile_2_version | run_2_srafile_3_alternative_1_access_type | run_2_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_2_srafile_3_alternative_1_org | run_2_srafile_3_alternative_1_url | run_2_srafile_3_alternative_2_access_type | run_2_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_2_srafile_3_alternative_2_org | run_2_srafile_3_alternative_2_url | run_2_srafile_3_alternative_3_access_type | run_2_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_2_srafile_3_alternative_3_org | run_2_srafile_3_alternative_3_url | run_2_srafile_3_cluster | run_2_srafile_3_date | run_2_srafile_3_filename | run_2_srafile_3_md5 | run_2_srafile_3_semantic_name | run_2_srafile_3_size | run_2_srafile_3_sratoolkit | run_2_srafile_3_supertype | run_2_srafile_3_url | run_2_srafile_3_version | run_2_srafile_4_alternative_1_access_type | run_2_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_2_srafile_4_alternative_1_org | run_2_srafile_4_alternative_1_url | run_2_srafile_4_alternative_2_access_type | run_2_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_2_srafile_4_alternative_2_org | run_2_srafile_4_alternative_2_url | run_2_srafile_4_alternative_3_access_type | run_2_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_2_srafile_4_alternative_3_org | run_2_srafile_4_alternative_3_url | run_2_srafile_4_cluster | run_2_srafile_4_date | run_2_srafile_4_filename | run_2_srafile_4_md5 | run_2_srafile_4_semantic_name | run_2_srafile_4_size | run_2_srafile_4_sratoolkit | run_2_srafile_4_supertype | run_2_srafile_4_url | run_2_srafile_4_version | run_2_srafile_5_alternative_1_access_type | run_2_srafile_5_alternative_1_free_egress | run_2_srafile_5_alternative_1_org | run_2_srafile_5_alternative_1_url | run_2_srafile_5_alternative_2_access_type | run_2_srafile_5_alternative_2_free_egress | run_2_srafile_5_alternative_2_org | run_2_srafile_5_alternative_2_url | run_2_srafile_5_alternative_3_access_type | run_2_srafile_5_alternative_3_free_egress | run_2_srafile_5_alternative_3_org | run_2_srafile_5_alternative_3_url | run_2_srafile_5_cluster | run_2_srafile_5_date | run_2_srafile_5_filename | run_2_srafile_5_md5 | run_2_srafile_5_semantic_name | run_2_srafile_5_size | run_2_srafile_5_sratoolkit | run_2_srafile_5_supertype | run_2_srafile_5_url | run_2_srafile_5_version | run_2_srafile_6_alternative_1_access_type | run_2_srafile_6_alternative_1_free_egress | run_2_srafile_6_alternative_1_org | run_2_srafile_6_alternative_1_url | run_2_srafile_6_alternative_2_access_type | run_2_srafile_6_alternative_2_free_egress | run_2_srafile_6_alternative_2_org | run_2_srafile_6_alternative_2_url | run_2_srafile_6_alternative_3_access_type | run_2_srafile_6_alternative_3_free_egress | run_2_srafile_6_alternative_3_org | run_2_srafile_6_alternative_3_url | run_2_srafile_6_cluster | run_2_srafile_6_date | run_2_srafile_6_filename | run_2_srafile_6_md5 | run_2_srafile_6_semantic_name | run_2_srafile_6_size | run_2_srafile_6_sratoolkit | run_2_srafile_6_supertype | run_2_srafile_6_url | run_2_srafile_6_version | run_2_static_data_available | run_2_total_base_count | run_2_total_base_cs_native | run_2_total_bases | run_2_total_spots | run_3_accession | run_3_alias | run_3_base_A_count | run_3_base_C_count | run_3_base_G_count | run_3_base_N_count | run_3_base_T_count | run_3_cloudfile_1_filetype | run_3_cloudfile_1_location | run_3_cloudfile_1_provider | run_3_cloudfile_2_filetype | run_3_cloudfile_2_location | run_3_cloudfile_2_provider | run_3_cloudfile_3_filetype | run_3_cloudfile_3_location | run_3_cloudfile_3_provider | run_3_cloudfile_4_filetype | run_3_cloudfile_4_location | run_3_cloudfile_4_provider | run_3_cluster_name | run_3_database_1 | run_3_has_taxanalysis | run_3_is_public | run_3_load_done | run_3_published | run_3_size | run_3_srafile_1_alternative_1_access_type | run_3_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_3_srafile_1_alternative_1_org | run_3_srafile_1_alternative_1_url | run_3_srafile_1_alternative_2_access_type | run_3_srafile_1_alternative_2_free_egress | run_3_srafile_1_alternative_2_org | run_3_srafile_1_alternative_2_url | run_3_srafile_1_alternative_3_access_type | run_3_srafile_1_alternative_3_free_egress | run_3_srafile_1_alternative_3_org | run_3_srafile_1_alternative_3_url | run_3_srafile_1_cluster | run_3_srafile_1_date | run_3_srafile_1_filename | run_3_srafile_1_md5 | run_3_srafile_1_semantic_name | run_3_srafile_1_size | run_3_srafile_1_sratoolkit | run_3_srafile_1_supertype | run_3_srafile_1_url | run_3_srafile_1_version | run_3_srafile_2_alternative_1_access_type | run_3_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_3_srafile_2_alternative_1_org | run_3_srafile_2_alternative_1_url | run_3_srafile_2_alternative_2_access_type | run_3_srafile_2_alternative_2_free_egress | run_3_srafile_2_alternative_2_org | run_3_srafile_2_alternative_2_url | run_3_srafile_2_alternative_3_access_type | run_3_srafile_2_alternative_3_free_egress | run_3_srafile_2_alternative_3_org | run_3_srafile_2_alternative_3_url | run_3_srafile_2_cluster | run_3_srafile_2_date | run_3_srafile_2_filename | run_3_srafile_2_md5 | run_3_srafile_2_semantic_name | run_3_srafile_2_size | run_3_srafile_2_sratoolkit | run_3_srafile_2_supertype | run_3_srafile_2_url | run_3_srafile_2_version | run_3_srafile_3_alternative_1_access_type | run_3_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_3_srafile_3_alternative_1_org | run_3_srafile_3_alternative_1_url | run_3_srafile_3_alternative_2_access_type | run_3_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_3_srafile_3_alternative_2_org | run_3_srafile_3_alternative_2_url | run_3_srafile_3_alternative_3_access_type | run_3_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_3_srafile_3_alternative_3_org | run_3_srafile_3_alternative_3_url | run_3_srafile_3_cluster | run_3_srafile_3_date | run_3_srafile_3_filename | run_3_srafile_3_md5 | run_3_srafile_3_semantic_name | run_3_srafile_3_size | run_3_srafile_3_sratoolkit | run_3_srafile_3_supertype | run_3_srafile_3_url | run_3_srafile_3_version | run_3_srafile_4_alternative_1_access_type | run_3_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_3_srafile_4_alternative_1_org | run_3_srafile_4_alternative_1_url | run_3_srafile_4_alternative_2_access_type | run_3_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_3_srafile_4_alternative_2_org | run_3_srafile_4_alternative_2_url | run_3_srafile_4_alternative_3_access_type | run_3_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_3_srafile_4_alternative_3_org | run_3_srafile_4_alternative_3_url | run_3_srafile_4_cluster | run_3_srafile_4_date | run_3_srafile_4_filename | run_3_srafile_4_md5 | run_3_srafile_4_semantic_name | run_3_srafile_4_size | run_3_srafile_4_sratoolkit | run_3_srafile_4_supertype | run_3_srafile_4_url | run_3_srafile_4_version | run_3_srafile_5_alternative_1_access_type | run_3_srafile_5_alternative_1_free_egress | run_3_srafile_5_alternative_1_org | run_3_srafile_5_alternative_1_url | run_3_srafile_5_cluster | run_3_srafile_5_date | run_3_srafile_5_filename | run_3_srafile_5_md5 | run_3_srafile_5_semantic_name | run_3_srafile_5_size | run_3_srafile_5_sratoolkit | run_3_srafile_5_supertype | run_3_srafile_5_url | run_3_srafile_5_version | run_3_srafile_6_alternative_1_access_type | run_3_srafile_6_alternative_1_free_egress | run_3_srafile_6_alternative_1_org | run_3_srafile_6_alternative_1_url | run_3_srafile_6_alternative_2_access_type | run_3_srafile_6_alternative_2_free_egress | run_3_srafile_6_alternative_2_org | run_3_srafile_6_alternative_2_url | run_3_srafile_6_alternative_3_access_type | run_3_srafile_6_alternative_3_free_egress | run_3_srafile_6_alternative_3_org | run_3_srafile_6_alternative_3_url | run_3_srafile_6_cluster | run_3_srafile_6_date | run_3_srafile_6_filename | run_3_srafile_6_md5 | run_3_srafile_6_semantic_name | run_3_srafile_6_size | run_3_srafile_6_sratoolkit | run_3_srafile_6_supertype | run_3_srafile_6_url | run_3_srafile_6_version | run_3_static_data_available | run_3_total_base_count | run_3_total_base_cs_native | run_3_total_bases | run_3_total_spots | run_4_accession | run_4_alias | run_4_base_A_count | run_4_base_C_count | run_4_base_G_count | run_4_base_N_count | run_4_base_T_count | run_4_cloudfile_1_filetype | run_4_cloudfile_1_location | run_4_cloudfile_1_provider | run_4_cloudfile_2_filetype | run_4_cloudfile_2_location | run_4_cloudfile_2_provider | run_4_cloudfile_3_filetype | run_4_cloudfile_3_location | run_4_cloudfile_3_provider | run_4_cloudfile_4_filetype | run_4_cloudfile_4_location | run_4_cloudfile_4_provider | run_4_cluster_name | run_4_database_1 | run_4_has_taxanalysis | run_4_is_public | run_4_load_done | run_4_published | run_4_size | run_4_srafile_1_alternative_1_access_type | run_4_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_4_srafile_1_alternative_1_org | run_4_srafile_1_alternative_1_url | run_4_srafile_1_alternative_2_access_type | run_4_srafile_1_alternative_2_free_egress | run_4_srafile_1_alternative_2_org | run_4_srafile_1_alternative_2_url | run_4_srafile_1_alternative_3_access_type | run_4_srafile_1_alternative_3_free_egress | run_4_srafile_1_alternative_3_org | run_4_srafile_1_alternative_3_url | run_4_srafile_1_cluster | run_4_srafile_1_date | run_4_srafile_1_filename | run_4_srafile_1_md5 | run_4_srafile_1_semantic_name | run_4_srafile_1_size | run_4_srafile_1_sratoolkit | run_4_srafile_1_supertype | run_4_srafile_1_url | run_4_srafile_1_version | run_4_srafile_2_alternative_1_access_type | run_4_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_4_srafile_2_alternative_1_org | run_4_srafile_2_alternative_1_url | run_4_srafile_2_cluster | run_4_srafile_2_date | run_4_srafile_2_filename | run_4_srafile_2_md5 | run_4_srafile_2_semantic_name | run_4_srafile_2_size | run_4_srafile_2_sratoolkit | run_4_srafile_2_supertype | run_4_srafile_2_url | run_4_srafile_2_version | run_4_srafile_3_alternative_1_access_type | run_4_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_4_srafile_3_alternative_1_org | run_4_srafile_3_alternative_1_url | run_4_srafile_3_alternative_2_access_type | run_4_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_4_srafile_3_alternative_2_org | run_4_srafile_3_alternative_2_url | run_4_srafile_3_alternative_3_access_type | run_4_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_4_srafile_3_alternative_3_org | run_4_srafile_3_alternative_3_url | run_4_srafile_3_cluster | run_4_srafile_3_date | run_4_srafile_3_filename | run_4_srafile_3_md5 | run_4_srafile_3_semantic_name | run_4_srafile_3_size | run_4_srafile_3_sratoolkit | run_4_srafile_3_supertype | run_4_srafile_3_url | run_4_srafile_3_version | run_4_srafile_4_alternative_1_access_type | run_4_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_4_srafile_4_alternative_1_org | run_4_srafile_4_alternative_1_url | run_4_srafile_4_alternative_2_access_type | run_4_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_4_srafile_4_alternative_2_org | run_4_srafile_4_alternative_2_url | run_4_srafile_4_alternative_3_access_type | run_4_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_4_srafile_4_alternative_3_org | run_4_srafile_4_alternative_3_url | run_4_srafile_4_cluster | run_4_srafile_4_date | run_4_srafile_4_filename | run_4_srafile_4_md5 | run_4_srafile_4_semantic_name | run_4_srafile_4_size | run_4_srafile_4_sratoolkit | run_4_srafile_4_supertype | run_4_srafile_4_url | run_4_srafile_4_version | run_4_srafile_5_alternative_1_access_type | run_4_srafile_5_alternative_1_free_egress | run_4_srafile_5_alternative_1_org | run_4_srafile_5_alternative_1_url | run_4_srafile_5_cluster | run_4_srafile_5_date | run_4_srafile_5_filename | run_4_srafile_5_md5 | run_4_srafile_5_semantic_name | run_4_srafile_5_size | run_4_srafile_5_sratoolkit | run_4_srafile_5_supertype | run_4_srafile_5_url | run_4_srafile_5_version | run_4_srafile_6_alternative_1_access_type | run_4_srafile_6_alternative_1_free_egress | run_4_srafile_6_alternative_1_org | run_4_srafile_6_alternative_1_url | run_4_srafile_6_alternative_2_access_type | run_4_srafile_6_alternative_2_free_egress | run_4_srafile_6_alternative_2_org | run_4_srafile_6_alternative_2_url | run_4_srafile_6_alternative_3_access_type | run_4_srafile_6_alternative_3_free_egress | run_4_srafile_6_alternative_3_org | run_4_srafile_6_alternative_3_url | run_4_srafile_6_cluster | run_4_srafile_6_date | run_4_srafile_6_filename | run_4_srafile_6_md5 | run_4_srafile_6_semantic_name | run_4_srafile_6_size | run_4_srafile_6_sratoolkit | run_4_srafile_6_supertype | run_4_srafile_6_url | run_4_srafile_6_version | run_4_static_data_available | run_4_total_base_count | run_4_total_base_cs_native | run_4_total_bases | run_4_total_spots | run_5_accession | run_5_alias | run_5_base_A_count | run_5_base_C_count | run_5_base_G_count | run_5_base_N_count | run_5_base_T_count | run_5_cloudfile_1_filetype | run_5_cloudfile_1_location | run_5_cloudfile_1_provider | run_5_cloudfile_2_filetype | run_5_cloudfile_2_location | run_5_cloudfile_2_provider | run_5_cloudfile_3_filetype | run_5_cloudfile_3_location | run_5_cloudfile_3_provider | run_5_cloudfile_4_filetype | run_5_cloudfile_4_location | run_5_cloudfile_4_provider | run_5_cluster_name | run_5_database_1 | run_5_has_taxanalysis | run_5_is_public | run_5_load_done | run_5_published | run_5_size | run_5_srafile_1_alternative_1_access_type | run_5_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_5_srafile_1_alternative_1_org | run_5_srafile_1_alternative_1_url | run_5_srafile_1_alternative_2_access_type | run_5_srafile_1_alternative_2_free_egress | run_5_srafile_1_alternative_2_org | run_5_srafile_1_alternative_2_url | run_5_srafile_1_alternative_3_access_type | run_5_srafile_1_alternative_3_free_egress | run_5_srafile_1_alternative_3_org | run_5_srafile_1_alternative_3_url | run_5_srafile_1_cluster | run_5_srafile_1_date | run_5_srafile_1_filename | run_5_srafile_1_md5 | run_5_srafile_1_semantic_name | run_5_srafile_1_size | run_5_srafile_1_sratoolkit | run_5_srafile_1_supertype | run_5_srafile_1_url | run_5_srafile_1_version | run_5_srafile_2_alternative_1_access_type | run_5_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_5_srafile_2_alternative_1_org | run_5_srafile_2_alternative_1_url | run_5_srafile_2_cluster | run_5_srafile_2_date | run_5_srafile_2_filename | run_5_srafile_2_md5 | run_5_srafile_2_semantic_name | run_5_srafile_2_size | run_5_srafile_2_sratoolkit | run_5_srafile_2_supertype | run_5_srafile_2_url | run_5_srafile_2_version | run_5_srafile_3_alternative_1_access_type | run_5_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_5_srafile_3_alternative_1_org | run_5_srafile_3_alternative_1_url | run_5_srafile_3_alternative_2_access_type | run_5_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_5_srafile_3_alternative_2_org | run_5_srafile_3_alternative_2_url | run_5_srafile_3_alternative_3_access_type | run_5_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_5_srafile_3_alternative_3_org | run_5_srafile_3_alternative_3_url | run_5_srafile_3_cluster | run_5_srafile_3_date | run_5_srafile_3_filename | run_5_srafile_3_md5 | run_5_srafile_3_semantic_name | run_5_srafile_3_size | run_5_srafile_3_sratoolkit | run_5_srafile_3_supertype | run_5_srafile_3_url | run_5_srafile_3_version | run_5_srafile_4_alternative_1_access_type | run_5_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_5_srafile_4_alternative_1_org | run_5_srafile_4_alternative_1_url | run_5_srafile_4_alternative_2_access_type | run_5_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_5_srafile_4_alternative_2_org | run_5_srafile_4_alternative_2_url | run_5_srafile_4_alternative_3_access_type | run_5_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_5_srafile_4_alternative_3_org | run_5_srafile_4_alternative_3_url | run_5_srafile_4_cluster | run_5_srafile_4_date | run_5_srafile_4_filename | run_5_srafile_4_md5 | run_5_srafile_4_semantic_name | run_5_srafile_4_size | run_5_srafile_4_sratoolkit | run_5_srafile_4_supertype | run_5_srafile_4_url | run_5_srafile_4_version | run_5_static_data_available | run_5_total_base_count | run_5_total_base_cs_native | run_5_total_bases | run_5_total_spots | run_6_accession | run_6_alias | run_6_base_A_count | run_6_base_C_count | run_6_base_G_count | run_6_base_N_count | run_6_base_T_count | run_6_cloudfile_1_filetype | run_6_cloudfile_1_location | run_6_cloudfile_1_provider | run_6_cloudfile_2_filetype | run_6_cloudfile_2_location | run_6_cloudfile_2_provider | run_6_cloudfile_3_filetype | run_6_cloudfile_3_location | run_6_cloudfile_3_provider | run_6_cloudfile_4_filetype | run_6_cloudfile_4_location | run_6_cloudfile_4_provider | run_6_cluster_name | run_6_database_1 | run_6_has_taxanalysis | run_6_is_public | run_6_load_done | run_6_published | run_6_size | run_6_srafile_1_alternative_1_access_type | run_6_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_6_srafile_1_alternative_1_org | run_6_srafile_1_alternative_1_url | run_6_srafile_1_alternative_2_access_type | run_6_srafile_1_alternative_2_free_egress | run_6_srafile_1_alternative_2_org | run_6_srafile_1_alternative_2_url | run_6_srafile_1_alternative_3_access_type | run_6_srafile_1_alternative_3_free_egress | run_6_srafile_1_alternative_3_org | run_6_srafile_1_alternative_3_url | run_6_srafile_1_cluster | run_6_srafile_1_date | run_6_srafile_1_filename | run_6_srafile_1_md5 | run_6_srafile_1_semantic_name | run_6_srafile_1_size | run_6_srafile_1_sratoolkit | run_6_srafile_1_supertype | run_6_srafile_1_url | run_6_srafile_1_version | run_6_srafile_2_alternative_1_access_type | run_6_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_6_srafile_2_alternative_1_org | run_6_srafile_2_alternative_1_url | run_6_srafile_2_cluster | run_6_srafile_2_date | run_6_srafile_2_filename | run_6_srafile_2_md5 | run_6_srafile_2_semantic_name | run_6_srafile_2_size | run_6_srafile_2_sratoolkit | run_6_srafile_2_supertype | run_6_srafile_2_url | run_6_srafile_2_version | run_6_srafile_3_alternative_1_access_type | run_6_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_6_srafile_3_alternative_1_org | run_6_srafile_3_alternative_1_url | run_6_srafile_3_alternative_2_access_type | run_6_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_6_srafile_3_alternative_2_org | run_6_srafile_3_alternative_2_url | run_6_srafile_3_alternative_3_access_type | run_6_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_6_srafile_3_alternative_3_org | run_6_srafile_3_alternative_3_url | run_6_srafile_3_cluster | run_6_srafile_3_date | run_6_srafile_3_filename | run_6_srafile_3_md5 | run_6_srafile_3_semantic_name | run_6_srafile_3_size | run_6_srafile_3_sratoolkit | run_6_srafile_3_supertype | run_6_srafile_3_url | run_6_srafile_3_version | run_6_srafile_4_alternative_1_access_type | run_6_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_6_srafile_4_alternative_1_org | run_6_srafile_4_alternative_1_url | run_6_srafile_4_alternative_2_access_type | run_6_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_6_srafile_4_alternative_2_org | run_6_srafile_4_alternative_2_url | run_6_srafile_4_alternative_3_access_type | run_6_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_6_srafile_4_alternative_3_org | run_6_srafile_4_alternative_3_url | run_6_srafile_4_cluster | run_6_srafile_4_date | run_6_srafile_4_filename | run_6_srafile_4_md5 | run_6_srafile_4_semantic_name | run_6_srafile_4_size | run_6_srafile_4_sratoolkit | run_6_srafile_4_supertype | run_6_srafile_4_url | run_6_srafile_4_version | run_6_static_data_available | run_6_total_base_count | run_6_total_base_cs_native | run_6_total_bases | run_6_total_spots | run_7_accession | run_7_alias | run_7_base_A_count | run_7_base_C_count | run_7_base_G_count | run_7_base_N_count | run_7_base_T_count | run_7_cloudfile_1_filetype | run_7_cloudfile_1_location | run_7_cloudfile_1_provider | run_7_cloudfile_2_filetype | run_7_cloudfile_2_location | run_7_cloudfile_2_provider | run_7_cloudfile_3_filetype | run_7_cloudfile_3_location | run_7_cloudfile_3_provider | run_7_cloudfile_4_filetype | run_7_cloudfile_4_location | run_7_cloudfile_4_provider | run_7_cluster_name | run_7_database_1 | run_7_has_taxanalysis | run_7_is_public | run_7_load_done | run_7_published | run_7_size | run_7_srafile_1_alternative_1_access_type | run_7_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_7_srafile_1_alternative_1_org | run_7_srafile_1_alternative_1_url | run_7_srafile_1_alternative_2_access_type | run_7_srafile_1_alternative_2_free_egress | run_7_srafile_1_alternative_2_org | run_7_srafile_1_alternative_2_url | run_7_srafile_1_alternative_3_access_type | run_7_srafile_1_alternative_3_free_egress | run_7_srafile_1_alternative_3_org | run_7_srafile_1_alternative_3_url | run_7_srafile_1_cluster | run_7_srafile_1_date | run_7_srafile_1_filename | run_7_srafile_1_md5 | run_7_srafile_1_semantic_name | run_7_srafile_1_size | run_7_srafile_1_sratoolkit | run_7_srafile_1_supertype | run_7_srafile_1_url | run_7_srafile_1_version | run_7_srafile_2_alternative_1_access_type | run_7_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_7_srafile_2_alternative_1_org | run_7_srafile_2_alternative_1_url | run_7_srafile_2_cluster | run_7_srafile_2_date | run_7_srafile_2_filename | run_7_srafile_2_md5 | run_7_srafile_2_semantic_name | run_7_srafile_2_size | run_7_srafile_2_sratoolkit | run_7_srafile_2_supertype | run_7_srafile_2_url | run_7_srafile_2_version | run_7_srafile_3_alternative_1_access_type | run_7_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_7_srafile_3_alternative_1_org | run_7_srafile_3_alternative_1_url | run_7_srafile_3_alternative_2_access_type | run_7_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_7_srafile_3_alternative_2_org | run_7_srafile_3_alternative_2_url | run_7_srafile_3_alternative_3_access_type | run_7_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_7_srafile_3_alternative_3_org | run_7_srafile_3_alternative_3_url | run_7_srafile_3_cluster | run_7_srafile_3_date | run_7_srafile_3_filename | run_7_srafile_3_md5 | run_7_srafile_3_semantic_name | run_7_srafile_3_size | run_7_srafile_3_sratoolkit | run_7_srafile_3_supertype | run_7_srafile_3_url | run_7_srafile_3_version | run_7_srafile_4_alternative_1_access_type | run_7_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_7_srafile_4_alternative_1_org | run_7_srafile_4_alternative_1_url | run_7_srafile_4_alternative_2_access_type | run_7_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_7_srafile_4_alternative_2_org | run_7_srafile_4_alternative_2_url | run_7_srafile_4_alternative_3_access_type | run_7_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_7_srafile_4_alternative_3_org | run_7_srafile_4_alternative_3_url | run_7_srafile_4_cluster | run_7_srafile_4_date | run_7_srafile_4_filename | run_7_srafile_4_md5 | run_7_srafile_4_semantic_name | run_7_srafile_4_size | run_7_srafile_4_sratoolkit | run_7_srafile_4_supertype | run_7_srafile_4_url | run_7_srafile_4_version | run_7_static_data_available | run_7_total_base_count | run_7_total_base_cs_native | run_7_total_bases | run_7_total_spots | run_8_accession | run_8_alias | run_8_base_A_count | run_8_base_C_count | run_8_base_G_count | run_8_base_N_count | run_8_base_T_count | run_8_cloudfile_1_filetype | run_8_cloudfile_1_location | run_8_cloudfile_1_provider | run_8_cloudfile_2_filetype | run_8_cloudfile_2_location | run_8_cloudfile_2_provider | run_8_cloudfile_3_filetype | run_8_cloudfile_3_location | run_8_cloudfile_3_provider | run_8_cloudfile_4_filetype | run_8_cloudfile_4_location | run_8_cloudfile_4_provider | run_8_cluster_name | run_8_database_1 | run_8_has_taxanalysis | run_8_is_public | run_8_load_done | run_8_published | run_8_size | run_8_srafile_1_alternative_1_access_type | run_8_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_8_srafile_1_alternative_1_org | run_8_srafile_1_alternative_1_url | run_8_srafile_1_alternative_2_access_type | run_8_srafile_1_alternative_2_free_egress | run_8_srafile_1_alternative_2_org | run_8_srafile_1_alternative_2_url | run_8_srafile_1_alternative_3_access_type | run_8_srafile_1_alternative_3_free_egress | run_8_srafile_1_alternative_3_org | run_8_srafile_1_alternative_3_url | run_8_srafile_1_cluster | run_8_srafile_1_date | run_8_srafile_1_filename | run_8_srafile_1_md5 | run_8_srafile_1_semantic_name | run_8_srafile_1_size | run_8_srafile_1_sratoolkit | run_8_srafile_1_supertype | run_8_srafile_1_url | run_8_srafile_1_version | run_8_srafile_2_alternative_1_access_type | run_8_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_8_srafile_2_alternative_1_org | run_8_srafile_2_alternative_1_url | run_8_srafile_2_cluster | run_8_srafile_2_date | run_8_srafile_2_filename | run_8_srafile_2_md5 | run_8_srafile_2_semantic_name | run_8_srafile_2_size | run_8_srafile_2_sratoolkit | run_8_srafile_2_supertype | run_8_srafile_2_url | run_8_srafile_2_version | run_8_srafile_3_alternative_1_access_type | run_8_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_8_srafile_3_alternative_1_org | run_8_srafile_3_alternative_1_url | run_8_srafile_3_alternative_2_access_type | run_8_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_8_srafile_3_alternative_2_org | run_8_srafile_3_alternative_2_url | run_8_srafile_3_alternative_3_access_type | run_8_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_8_srafile_3_alternative_3_org | run_8_srafile_3_alternative_3_url | run_8_srafile_3_cluster | run_8_srafile_3_date | run_8_srafile_3_filename | run_8_srafile_3_md5 | run_8_srafile_3_semantic_name | run_8_srafile_3_size | run_8_srafile_3_sratoolkit | run_8_srafile_3_supertype | run_8_srafile_3_url | run_8_srafile_3_version | run_8_srafile_4_alternative_1_access_type | run_8_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_8_srafile_4_alternative_1_org | run_8_srafile_4_alternative_1_url | run_8_srafile_4_alternative_2_access_type | run_8_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_8_srafile_4_alternative_2_org | run_8_srafile_4_alternative_2_url | run_8_srafile_4_alternative_3_access_type | run_8_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_8_srafile_4_alternative_3_org | run_8_srafile_4_alternative_3_url | run_8_srafile_4_cluster | run_8_srafile_4_date | run_8_srafile_4_filename | run_8_srafile_4_md5 | run_8_srafile_4_semantic_name | run_8_srafile_4_size | run_8_srafile_4_sratoolkit | run_8_srafile_4_supertype | run_8_srafile_4_url | run_8_srafile_4_version | run_8_static_data_available | run_8_total_base_count | run_8_total_base_cs_native | run_8_total_bases | run_8_total_spots | run_9_accession | run_9_alias | run_9_base_A_count | run_9_base_C_count | run_9_base_G_count | run_9_base_N_count | run_9_base_T_count | run_9_cloudfile_1_filetype | run_9_cloudfile_1_location | run_9_cloudfile_1_provider | run_9_cloudfile_2_filetype | run_9_cloudfile_2_location | run_9_cloudfile_2_provider | run_9_cloudfile_3_filetype | run_9_cloudfile_3_location | run_9_cloudfile_3_provider | run_9_cloudfile_4_filetype | run_9_cloudfile_4_location | run_9_cloudfile_4_provider | run_9_cluster_name | run_9_database_1 | run_9_has_taxanalysis | run_9_is_public | run_9_load_done | run_9_published | run_9_size | run_9_srafile_1_alternative_1_access_type | run_9_srafile_1_alternative_1_free_egress | run_9_srafile_1_alternative_1_org | run_9_srafile_1_alternative_1_url | run_9_srafile_1_alternative_2_access_type | run_9_srafile_1_alternative_2_free_egress | run_9_srafile_1_alternative_2_org | run_9_srafile_1_alternative_2_url | run_9_srafile_1_alternative_3_access_type | run_9_srafile_1_alternative_3_free_egress | run_9_srafile_1_alternative_3_org | run_9_srafile_1_alternative_3_url | run_9_srafile_1_cluster | run_9_srafile_1_date | run_9_srafile_1_filename | run_9_srafile_1_md5 | run_9_srafile_1_semantic_name | run_9_srafile_1_size | run_9_srafile_1_sratoolkit | run_9_srafile_1_supertype | run_9_srafile_1_url | run_9_srafile_1_version | run_9_srafile_2_alternative_1_access_type | run_9_srafile_2_alternative_1_free_egress | run_9_srafile_2_alternative_1_org | run_9_srafile_2_alternative_1_url | run_9_srafile_2_cluster | run_9_srafile_2_date | run_9_srafile_2_filename | run_9_srafile_2_md5 | run_9_srafile_2_semantic_name | run_9_srafile_2_size | run_9_srafile_2_sratoolkit | run_9_srafile_2_supertype | run_9_srafile_2_url | run_9_srafile_2_version | run_9_srafile_3_alternative_1_access_type | run_9_srafile_3_alternative_1_free_egress | run_9_srafile_3_alternative_1_org | run_9_srafile_3_alternative_1_url | run_9_srafile_3_alternative_2_access_type | run_9_srafile_3_alternative_2_free_egress | run_9_srafile_3_alternative_2_org | run_9_srafile_3_alternative_2_url | run_9_srafile_3_alternative_3_access_type | run_9_srafile_3_alternative_3_free_egress | run_9_srafile_3_alternative_3_org | run_9_srafile_3_alternative_3_url | run_9_srafile_3_cluster | run_9_srafile_3_date | run_9_srafile_3_filename | run_9_srafile_3_md5 | run_9_srafile_3_semantic_name | run_9_srafile_3_size | run_9_srafile_3_sratoolkit | run_9_srafile_3_supertype | run_9_srafile_3_url | run_9_srafile_3_version | run_9_srafile_4_alternative_1_access_type | run_9_srafile_4_alternative_1_free_egress | run_9_srafile_4_alternative_1_org | run_9_srafile_4_alternative_1_url | run_9_srafile_4_alternative_2_access_type | run_9_srafile_4_alternative_2_free_egress | run_9_srafile_4_alternative_2_org | run_9_srafile_4_alternative_2_url | run_9_srafile_4_alternative_3_access_type | run_9_srafile_4_alternative_3_free_egress | run_9_srafile_4_alternative_3_org | run_9_srafile_4_alternative_3_url | run_9_srafile_4_cluster | run_9_srafile_4_date | run_9_srafile_4_filename | run_9_srafile_4_md5 | run_9_srafile_4_semantic_name | run_9_srafile_4_size | run_9_srafile_4_sratoolkit | run_9_srafile_4_supertype | run_9_srafile_4_url | run_9_srafile_4_version | run_9_static_data_available | run_9_total_base_count | run_9_total_base_cs_native | run_9_total_bases | run_9_total_spots | run_set_bases | run_set_bytes | run_set_runs | run_set_spots | sample_attributes_10_tag | sample_attributes_10_value | sample_attributes_11_tag | sample_attributes_11_value | sample_attributes_12_tag | sample_attributes_12_value | sample_attributes_13_tag | sample_attributes_13_value | sample_attributes_14_tag | sample_attributes_14_value | sample_attributes_15_tag | sample_attributes_15_value | sample_attributes_16_tag | sample_attributes_16_value | sample_attributes_17_tag | sample_attributes_17_value | sample_attributes_18_tag | sample_attributes_18_value | sample_attributes_19_tag | sample_attributes_19_value | sample_attributes_1_tag | sample_attributes_1_value | sample_attributes_20_tag | sample_attributes_20_value | sample_attributes_21_tag | sample_attributes_21_value | sample_attributes_22_tag | sample_attributes_22_value | sample_attributes_23_tag | sample_attributes_23_value | sample_attributes_24_tag | sample_attributes_24_value | sample_attributes_25_tag | sample_attributes_25_value | sample_attributes_26_tag | sample_attributes_26_value | sample_attributes_27_tag | sample_attributes_27_value | sample_attributes_28_tag | sample_attributes_28_value | sample_attributes_29_tag | sample_attributes_29_value | sample_attributes_2_tag | sample_attributes_2_value | sample_attributes_3_tag | sample_attributes_3_value | sample_attributes_4_tag | sample_attributes_4_value | sample_attributes_5_tag | sample_attributes_5_value | sample_attributes_6_tag | sample_attributes_6_value | sample_attributes_7_tag | sample_attributes_7_value | sample_attributes_8_tag | sample_attributes_8_value | sample_attributes_9_tag | sample_attributes_9_value | sample_external_id_1 | sample_external_id_1_namespace | sample_link_1_type | sample_link_1_value_1 | sample_link_1_value_2 | sample_link_1_value_3 | sample_title | study_alias | study_attributes_1_tag | study_attributes_1_value | study_center_name | study_center_project_name | study_external_id_1 | study_external_id_1_namespace | study_link_1_type | study_link_1_value_1 | study_link_1_value_2 | study_study_abstract | study_study_title | study_study_type_existing_study_type | submission_accession | submission_alias | submission_center_name | submission_lab_name |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 0 | SRP610788 | SRX34653905 | GSM9927106: Sublibrary_9 from multiplexed Anableps retina samples; Anableps anableps; RNA-Seq | 195821 | Anableps anableps | RNA-Seq | TRANSCRIPTOMIC SINGLE CELL | cDNA | SRS30216475 | GSM9927106 | Illumina NovaSeq X Plus | 383759994 | 33263831424 | SRR39995784 | 383759994 | 115127998200 | GSM9927106_r1 | GSM9927106 | GSM9927106_r1 | GEO | Nuclei were fixed and frozen using the Evercode Nuclei Fixation Kit v3 (#NF100, #NF200) from Par... | GSM9927106 | ILLUMINA | SRS30216475 | PAIRED | SAMN62159366 | SRS30216475 | 115127998200 | NaN | Anableps anableps | GSM9927106 | Sublibrary_9 from multiplexed Anableps retina samples | 195821 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | GSM9927106_r1 | 30204619974 | 26634252238 | 27431388158 | 6703236 | 30851034594 | fastq | s3.us-east-1 | s3 | run | s3.us-east-1 | s3 | run.zq | gs.us-east1 | gs | run.zq | s3.us-east-1 | s3 | public | <Database><Table name="SEQUENCE"><Statistics source="meta"><Rows count="383759994" /><Elements c... | 1 | true | true | 2026-08-05 00:01:23 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-16/SRR39995784/Aa_retina_snRNA_9_CKDL260007178-1A_23H5N2LT4_L1_1.fq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-08-04 12:50:25 | Aa_retina_snRNA_9_CKDL260007178-1A_23H5N2LT4_L1_1.fq.gz | 527c025585789feffcce20de57ad9a12 | fastq | 24209107345 | 0 | Original | NaN | 1 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-16/SRR39995784/Aa_retina_snRNA_9_CKDL260007178-1A_23H5N2LT4_L1_2.fq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-08-04 12:51:11 | Aa_retina_snRNA_9_CKDL260007178-1A_23H5N2LT4_L1_2.fq.gz | 9eae79c62e935c2641a09efc724c7329 | fastq | 25373468964 | 0 | Original | NaN | 1 | anonymous | worldwide | AWS | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR39995784/SRR39995784 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-08-04 13:19:38 | SRR39995784 | cb132e2cdbbc9db2e5bdd1ed8f7dd8e9 | SRA Normalized | 33263833637 | 1 | Primary ETL | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR39995784/SRR39995784 | 1 | anonymous | worldwide | NCBI | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos13/sra-pub-zq-1307/SRR039/39995/SRR39995784/SRR3... | aws identity | s3.us-east-1 | AWS | s3://sra-pub-zq-6/SRR39995784/SRR39995784.lite.1 | gcp identity | gs.us-east1 | GCP | gs://sra-pub-zq-109/SRR39995784/SRR39995784.lite.1 | public | 2026-08-04 14:33:02 | SRR39995784.lite | 11975d0c1471cfc1001441c65f76547e | SRA Lite | 28720265273 | 1 | Primary ETL | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos13/sra-pub-zq-1307/SRR039/39995/SRR39995784/SRR3... | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 1 | 115127998200 | false | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 115127998200 | 33263831424 | 1 | 383759994 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | source_name | Whole retina | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | tissue | Whole retina | cell type | multiple | developmental stage | adult | geo_loc_name | missing | collection_date | missing | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | SAMN62159366 | BioSample | XREF_LINK | DB: bioproject | ID: 1309719 | LABEL: PRJNA1309719 | Sublibrary_9 from multiplexed Anableps retina samples | GSE306228 | NaN | NaN | GEO | GSE306228 | PRJNA1309719 | BioProject | NaN | NaN | NaN | The emergence of evolutionary novelties remains a central challenge in biology, particularly for... | Evolutionary remodeling of the ventral retina enables aerial vision in the four-eyed fish Anable... | Transcriptome Analysis | SRA2502685 | SUB16382925 | Schneider Lab, Biological Sciences, Louisiana State University | NaN |
| 1 | SRP610788 | SRX34653904 | GSM9927105: Sublibrary_8 from multiplexed Anableps retina samples; Anableps anableps; RNA-Seq | 195821 | Anableps anableps | RNA-Seq | TRANSCRIPTOMIC SINGLE CELL | cDNA | SRS30216474 | GSM9927105 | Illumina NovaSeq X Plus | 339726225 | 29441591478 | SRR39995785 | 339726225 | 101917867500 | GSM9927105_r1 | GSM9927105 | GSM9927105_r1 | GEO | Nuclei were fixed and frozen using the Evercode Nuclei Fixation Kit v3 (#NF100, #NF200) from Par... | GSM9927105 | ILLUMINA | SRS30216474 | PAIRED | SAMN62159367 | SRS30216474 | 101917867500 | NaN | Anableps anableps | GSM9927105 | Sublibrary_8 from multiplexed Anableps retina samples | 195821 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | GSM9927105_r1 | 26617592381 | 23663273469 | 24411992128 | 5899290 | 27219110232 | fastq | s3.us-east-1 | s3 | run | s3.us-east-1 | s3 | run.zq | gs.us-east1 | gs | run.zq | s3.us-east-1 | s3 | public | <Database><Table name="SEQUENCE"><Statistics source="meta"><Rows count="339726225" /><Elements c... | 1 | true | true | 2026-08-05 00:01:24 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-14/SRR39995785/Aa_retina_snRNA_8_CKDL260007177-1A_23H5N2LT4_L1_1.fq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-08-04 13:24:47 | Aa_retina_snRNA_8_CKDL260007177-1A_23H5N2LT4_L1_1.fq.gz | e477d32b8ced754d5ab2987f89a3dcc6 | fastq | 21689376908 | 0 | Original | NaN | 1 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-14/SRR39995785/Aa_retina_snRNA_8_CKDL260007177-1A_23H5N2LT4_L1_2.fq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-08-04 13:25:40 | Aa_retina_snRNA_8_CKDL260007177-1A_23H5N2LT4_L1_2.fq.gz | 45835cb7c5cac809d7859e1cba181980 | fastq | 22303914768 | 0 | Original | NaN | 1 | anonymous | worldwide | AWS | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR39995785/SRR39995785 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-08-04 14:13:14 | SRR39995785 | d0c3ef3a69678c56a65ebfec89826d21 | SRA Normalized | 29441593697 | 1 | Primary ETL | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR39995785/SRR39995785 | 1 | anonymous | worldwide | NCBI | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos13/sra-pub-zq-1307/SRR039/39995/SRR39995785/SRR3... | aws identity | s3.us-east-1 | AWS | s3://sra-pub-zq-6/SRR39995785/SRR39995785.lite.1 | gcp identity | gs.us-east1 | GCP | gs://sra-pub-zq-109/SRR39995785/SRR39995785.lite.1 | public | 2026-08-04 14:30:56 | SRR39995785.lite | 93a072749951f13a896e80f9dfef8ad9 | SRA Lite | 25522160553 | 1 | Primary ETL | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos13/sra-pub-zq-1307/SRR039/39995/SRR39995785/SRR3... | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 1 | 101917867500 | false | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 101917867500 | 29441591478 | 1 | 339726225 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | source_name | Whole retina | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | tissue | Whole retina | cell type | multiple | developmental stage | adult | geo_loc_name | missing | collection_date | missing | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | SAMN62159367 | BioSample | XREF_LINK | DB: bioproject | ID: 1309719 | LABEL: PRJNA1309719 | Sublibrary_8 from multiplexed Anableps retina samples | GSE306228 | NaN | NaN | GEO | GSE306228 | PRJNA1309719 | BioProject | NaN | NaN | NaN | The emergence of evolutionary novelties remains a central challenge in biology, particularly for... | Evolutionary remodeling of the ventral retina enables aerial vision in the four-eyed fish Anable... | Transcriptome Analysis | SRA2502685 | SUB16382925 | Schneider Lab, Biological Sciences, Louisiana State University | NaN |
| 2 | SRP610788 | SRX34653903 | GSM9927104: Sublibrary_7 from multiplexed Anableps retina samples; Anableps anableps; RNA-Seq | 195821 | Anableps anableps | RNA-Seq | TRANSCRIPTOMIC SINGLE CELL | cDNA | SRS30216473 | GSM9927104 | Illumina NovaSeq X Plus | 409417206 | 35404832543 | SRR39995786 | 409417206 | 122825161800 | GSM9927104_r1 | GSM9927104 | GSM9927104_r1 | GEO | Nuclei were fixed and frozen using the Evercode Nuclei Fixation Kit v3 (#NF100, #NF200) from Par... | GSM9927104 | ILLUMINA | SRS30216473 | PAIRED | SAMN62159368 | SRS30216473 | 122825161800 | NaN | Anableps anableps | GSM9927104 | Sublibrary_7 from multiplexed Anableps retina samples | 195821 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | GSM9927104_r1 | 32139792542 | 28420776679 | 29339812713 | 7180025 | 32917599841 | fastq | s3.us-east-1 | s3 | run | s3.us-east-1 | s3 | run.zq | gs.us-east1 | gs | run.zq | s3.us-east-1 | s3 | public | <Database><Table name="SEQUENCE"><Statistics source="meta"><Rows count="409417206" /><Elements c... | 1 | true | true | 2026-08-05 00:01:24 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-16/SRR39995786/Aa_retina_snRNA_7_CKDL260007176-1A_23H5N2LT4_L1_1.fq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-08-04 13:24:15 | Aa_retina_snRNA_7_CKDL260007176-1A_23H5N2LT4_L1_1.fq.gz | 2fa4a7c9b6b09cee032c3f953dcad12c | fastq | 25767415036 | 0 | Original | NaN | 1 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-16/SRR39995786/Aa_retina_snRNA_7_CKDL260007176-1A_23H5N2LT4_L1_2.fq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-08-04 13:23:09 | Aa_retina_snRNA_7_CKDL260007176-1A_23H5N2LT4_L1_2.fq.gz | 43cf3996c84d1e31f3c15f85c22065a1 | fastq | 26905326572 | 0 | Original | NaN | 1 | anonymous | worldwide | AWS | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR39995786/SRR39995786 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-08-04 14:03:18 | SRR39995786 | 3313ce8c1d6bdb10250096df61312b3f | SRA Normalized | 35404834763 | 1 | Primary ETL | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR39995786/SRR39995786 | 1 | anonymous | worldwide | NCBI | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos13/sra-pub-zq-1307/SRR039/39995/SRR39995786/SRR3... | aws identity | s3.us-east-1 | AWS | s3://sra-pub-zq-6/SRR39995786/SRR39995786.lite.1 | gcp identity | gs.us-east1 | GCP | gs://sra-pub-zq-109/SRR39995786/SRR39995786.lite.1 | public | 2026-08-04 14:36:56 | SRR39995786.lite | 1c5598d49ab8bfe18bae4addb57b6557 | SRA Lite | 30653420679 | 1 | Primary ETL | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos13/sra-pub-zq-1307/SRR039/39995/SRR39995786/SRR3... | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 1 | 122825161800 | false | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 122825161800 | 35404832543 | 1 | 409417206 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | source_name | Whole retina | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | tissue | Whole retina | cell type | multiple | developmental stage | adult | geo_loc_name | missing | collection_date | missing | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | SAMN62159368 | BioSample | XREF_LINK | DB: bioproject | ID: 1309719 | LABEL: PRJNA1309719 | Sublibrary_7 from multiplexed Anableps retina samples | GSE306228 | NaN | NaN | GEO | GSE306228 | PRJNA1309719 | BioProject | NaN | NaN | NaN | The emergence of evolutionary novelties remains a central challenge in biology, particularly for... | Evolutionary remodeling of the ventral retina enables aerial vision in the four-eyed fish Anable... | Transcriptome Analysis | SRA2502685 | SUB16382925 | Schneider Lab, Biological Sciences, Louisiana State University | NaN |
| 3 | SRP610788 | SRX34653902 | GSM9927103: Sublibrary_6 from multiplexed Anableps retina samples; Anableps anableps; RNA-Seq | 195821 | Anableps anableps | RNA-Seq | TRANSCRIPTOMIC SINGLE CELL | cDNA | SRS30216472 | GSM9927103 | Illumina NovaSeq X Plus | 372411706 | 32256121779 | SRR39995787 | 372411706 | 111723511800 | GSM9927103_r1 | GSM9927103 | GSM9927103_r1 | GEO | Nuclei were fixed and frozen using the Evercode Nuclei Fixation Kit v3 (#NF100, #NF200) from Par... | GSM9927103 | ILLUMINA | SRS30216472 | PAIRED | SAMN62159369 | SRS30216472 | 111723511800 | NaN | Anableps anableps | GSM9927103 | Sublibrary_6 from multiplexed Anableps retina samples | 195821 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | GSM9927103_r1 | 29281038617 | 25866620144 | 26531270161 | 6516151 | 30038066727 | fastq | s3.us-east-1 | s3 | run | s3.us-east-1 | s3 | run.zq | gs.us-east1 | gs | run.zq | s3.us-east-1 | s3 | public | <Database><Table name="SEQUENCE"><Statistics source="meta"><Rows count="372411706" /><Elements c... | 1 | true | true | 2026-08-05 00:01:24 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-16/SRR39995787/Aa_retina_snRNA_6_CKDL260007175-1A_23H5N2LT4_L1_1.fq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-08-04 13:19:00 | Aa_retina_snRNA_6_CKDL260007175-1A_23H5N2LT4_L1_1.fq.gz | 7245cc2b78d2541d960bec0c5f8d5694 | fastq | 23506188661 | 0 | Original | NaN | 1 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-16/SRR39995787/Aa_retina_snRNA_6_CKDL260007175-1A_23H5N2LT4_L1_2.fq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-08-04 13:19:58 | Aa_retina_snRNA_6_CKDL260007175-1A_23H5N2LT4_L1_2.fq.gz | 20281f1fa2a0935caa26bf4dbfb57ee3 | fastq | 24641589739 | 0 | Original | NaN | 1 | anonymous | worldwide | AWS | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR39995787/SRR39995787 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-08-04 13:58:37 | SRR39995787 | e80d9d6ef1104eb6d96cc7a14f3be4f2 | SRA Normalized | 32256124001 | 1 | Primary ETL | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR39995787/SRR39995787 | 1 | anonymous | worldwide | NCBI | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos13/sra-pub-zq-1307/SRR039/39995/SRR39995787/SRR3... | aws identity | s3.us-east-1 | AWS | s3://sra-pub-zq-6/SRR39995787/SRR39995787.lite.1 | gcp identity | gs.us-east1 | GCP | gs://sra-pub-zq-109/SRR39995787/SRR39995787.lite.1 | public | 2026-08-04 14:38:35 | SRR39995787.lite | aa3e0ec3e4fb0ba395e101d8f851cef6 | SRA Lite | 27863722409 | 1 | Primary ETL | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos13/sra-pub-zq-1307/SRR039/39995/SRR39995787/SRR3... | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 1 | 111723511800 | false | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 111723511800 | 32256121779 | 1 | 372411706 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | source_name | Whole retina | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | tissue | Whole retina | cell type | multiple | developmental stage | adult | geo_loc_name | missing | collection_date | missing | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | SAMN62159369 | BioSample | XREF_LINK | DB: bioproject | ID: 1309719 | LABEL: PRJNA1309719 | Sublibrary_6 from multiplexed Anableps retina samples | GSE306228 | NaN | NaN | GEO | GSE306228 | PRJNA1309719 | BioProject | NaN | NaN | NaN | The emergence of evolutionary novelties remains a central challenge in biology, particularly for... | Evolutionary remodeling of the ventral retina enables aerial vision in the four-eyed fish Anable... | Transcriptome Analysis | SRA2502685 | SUB16382925 | Schneider Lab, Biological Sciences, Louisiana State University | NaN |
| 4 | SRP610788 | SRX34653901 | GSM9927102: Sublibrary_5 from multiplexed Anableps retina samples; Anableps anableps; RNA-Seq | 195821 | Anableps anableps | RNA-Seq | TRANSCRIPTOMIC SINGLE CELL | cDNA | SRS30216471 | GSM9927102 | Illumina NovaSeq X Plus | 367058442 | 31926228759 | SRR39995788 | 367058442 | 110117532600 | GSM9927102_r1 | GSM9927102 | GSM9927102_r1 | GEO | Nuclei were fixed and frozen using the Evercode Nuclei Fixation Kit v3 (#NF100, #NF200) from Par... | GSM9927102 | ILLUMINA | SRS30216471 | PAIRED | SAMN62159370 | SRS30216471 | 110117532600 | NaN | Anableps anableps | GSM9927102 | Sublibrary_5 from multiplexed Anableps retina samples | 195821 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | GSM9927102_r1 | 28838637944 | 25526743054 | 26279497884 | 6411879 | 29466241839 | fastq | s3.us-east-1 | s3 | run | s3.us-east-1 | s3 | run.zq | gs.us-east1 | gs | run.zq | s3.us-east-1 | s3 | public | <Database><Table name="SEQUENCE"><Statistics source="meta"><Rows count="367058442" /><Elements c... | 1 | true | true | 2026-08-05 00:01:23 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-16/SRR39995788/Aa_retina_snRNA_5_CKDL260007174-1A_23H5N2LT4_L1_1.fq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-08-04 12:49:12 | Aa_retina_snRNA_5_CKDL260007174-1A_23H5N2LT4_L1_1.fq.gz | c03b4cba0241ecaad17c4dc3b203d2cc | fastq | 23312560886 | 0 | Original | NaN | 1 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-16/SRR39995788/Aa_retina_snRNA_5_CKDL260007174-1A_23H5N2LT4_L1_2.fq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-08-04 12:50:17 | Aa_retina_snRNA_5_CKDL260007174-1A_23H5N2LT4_L1_2.fq.gz | d3900a0c0df3f75ca96d1ff583253553 | fastq | 24320049672 | 0 | Original | NaN | 1 | anonymous | worldwide | AWS | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR39995788/SRR39995788 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2026-08-04 13:17:54 | SRR39995788 | b07d040ebb72292143f8097298896c2f | SRA Normalized | 31926230978 | 1 | Primary ETL | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR39995788/SRR39995788 | 1 | anonymous | worldwide | NCBI | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos13/sra-pub-zq-1307/SRR039/39995/SRR39995788/SRR3... | aws identity | s3.us-east-1 | AWS | s3://sra-pub-zq-6/SRR39995788/SRR39995788.lite.1 | gcp identity | gs.us-east1 | GCP | gs://sra-pub-zq-109/SRR39995788/SRR39995788.lite.1 | public | 2026-08-04 14:35:37 | SRR39995788.lite | c970b4ac4fa9bdab84779c44be3567ba | SRA Lite | 27502555270 | 1 | Primary ETL | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos13/sra-pub-zq-1307/SRR039/39995/SRR39995788/SRR3... | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 1 | 110117532600 | false | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 110117532600 | 31926228759 | 1 | 367058442 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | source_name | Whole retina | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | tissue | Whole retina | cell type | multiple | developmental stage | adult | geo_loc_name | missing | collection_date | missing | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | SAMN62159370 | BioSample | XREF_LINK | DB: bioproject | ID: 1309719 | LABEL: PRJNA1309719 | Sublibrary_5 from multiplexed Anableps retina samples | GSE306228 | NaN | NaN | GEO | GSE306228 | PRJNA1309719 | BioProject | NaN | NaN | NaN | The emergence of evolutionary novelties remains a central challenge in biology, particularly for... | Evolutionary remodeling of the ventral retina enables aerial vision in the four-eyed fish Anable... | Transcriptome Analysis | SRA2502685 | SUB16382925 | Schneider Lab, Biological Sciences, Louisiana State University | NaN |
| ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... |
| 495 | SRP656069 | SRX27068998 | GSM8679741: RNA-seq, Jurkat, CTLA4 RNP, Mock; Homo sapiens; RNA-Seq | 9606 | Homo sapiens | RNA-Seq | TRANSCRIPTOMIC | cDNA | SRS23529620 | GSM8679741 | Illumina MiniSeq | 5069428 | 135621710 | SRR36470071 | 993100 | 299916200 | GSM8679741_r1 | GSM8679741 | GSM8679741_r1 | GEO | For RNA-seq, T7 RNA was extracted from IST reactions by TRIzol LS and column purification. For S... | GSM8679741 | ILLUMINA | SRS23529620 | SINGLE | SAMN45816733 | SRS23529620 | 1530967256 | NaN | Homo sapiens | GSM8679741 | RNA-seq, Jurkat, CTLA4 RNP, Mock | 9606 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | GSM8679741_r3 | 63915063 | 51511998 | 132711662 | 12954 | 51764523 | fastq | s3.us-east-1 | s3 | run | s3.us-east-1 | s3 | run.zq | gs.us-east1 | gs | run.zq | s3.us-east-1 | s3 | public | <Database><Table name="SEQUENCE"><Statistics source="meta"><Rows count="993100" /><Elements coun... | 1 | true | true | 2025-12-16 11:15:58 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-11/SRR36470071/Jurkat_RNP_Mock_Rep1_R1.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2025-12-16 10:53:26 | Jurkat_RNP_Mock_Rep1_R1.fastq.gz | 73bebbb84b4c5e12f5b908face8d8bbc | fastq | 60505660 | 0 | Original | NaN | 1 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-11/SRR36470071/Jurkat_RNP_Mock_Rep1_R2.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2025-12-16 10:53:25 | Jurkat_RNP_Mock_Rep1_R2.fastq.gz | fb014ef7af14d2e803d95683a810240d | fastq | 68035220 | 0 | Original | NaN | 1 | anonymous | worldwide | AWS | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR36470071/SRR36470071 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2025-12-16 10:53:35 | SRR36470071 | acccc3fdfa433b857ed6b1ddf0e40ef3 | SRA Normalized | 135623632 | 1 | Primary ETL | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR36470071/SRR36470071 | 1 | anonymous | worldwide | NCBI | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos7/sra-pub-zq-41/SRR036/36470/SRR36470071/SRR3647... | aws identity | s3.us-east-1 | AWS | s3://sra-pub-zq-9/SRR36470071/SRR36470071.lite.1 | gcp identity | gs.us-east1 | GCP | gs://sra-pub-zq-103/SRR36470071/SRR36470071.lite.1 | public | 2025-12-16 12:03:20 | SRR36470071.lite | 063cb6292fbe4d87221dce7e53a2fcb0 | SRA Lite | 77113964 | 1 | Primary ETL | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos7/sra-pub-zq-41/SRR036/36470/SRR36470071/SRR3647... | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 1 | 299916200 | false | SRR36470072 | GSM8679741_r4 | 104136496 | 82386249 | 194735854 | 19617 | 84289212 | fastq | s3.us-east-1 | s3 | run | s3.us-east-1 | s3 | run.zq | gs.us-east1 | gs | run.zq | s3.us-east-1 | s3 | public | <Database><Table name="SEQUENCE"><Statistics source="meta"><Rows count="1541614" /><Elements cou... | 1 | true | true | 2025-12-16 11:15:58 | 210066324 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-11/SRR36470072/Jurkat_RNP_Mock_Rep2_R1.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2025-12-16 10:53:37 | Jurkat_RNP_Mock_Rep2_R1.fastq.gz | fc60fdbda536e2ef9774146de4d03243 | fastq | 94587003 | 0 | Original | NaN | 1 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-11/SRR36470072/Jurkat_RNP_Mock_Rep2_R2.fastq.gz.1 | public | 2025-12-16 10:53:36 | Jurkat_RNP_Mock_Rep2_R2.fastq.gz | f0154075aa43f5d4a339e74779aacd5c | fastq | 106462964 | 0 | Original | NaN | 1 | anonymous | worldwide | AWS | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR36470072/SRR36470072 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2025-12-16 10:53:47 | SRR36470072 | d5a376c15a55c2bad944a217a0cc32b7 | SRA Normalized | 210068244 | 1 | Primary ETL | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR36470072/SRR36470072 | 1 | anonymous | worldwide | NCBI | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos7/sra-pub-zq-41/SRR036/36470/SRR36470072/SRR3647... | aws identity | s3.us-east-1 | AWS | s3://sra-pub-zq-9/SRR36470072/SRR36470072.lite.1 | gcp identity | gs.us-east1 | GCP | gs://sra-pub-zq-103/SRR36470072/SRR36470072.lite.1 | public | 2025-12-16 12:03:49 | SRR36470072.lite | a8951f5cea8db5ba906d45bf642dcc71 | SRA Lite | 119564972 | 1 | Primary ETL | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos7/sra-pub-zq-41/SRR036/36470/SRR36470072/SRR3647... | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 1 | 465567428 | false | 465567428 | 1541614 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 765483628 | 345688034 | 2 | 2534714 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | source_name | Jurkat E6-1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | cell line | Jurkat E6-1 | treatment | CTLA4 RNP, Mock | geo_loc_name | missing | collection_date | missing | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | SAMN45816733 | BioSample | XREF_LINK | DB: bioproject | ID: 1390207 | LABEL: PRJNA1390207 | RNA-seq, Jurkat, CTLA4 RNP, Mock | GSE313958 | parent_bioproject | PRJNA1390229 | GEO | GSE313958 | PRJNA1390207 | BioProject | NaN | NaN | NaN | A longstanding barrier in genome engineering with CRISPR-Cas9 has been the inability to characte... | Joint single-cell profiling of Cas9 edits and transcriptomes reveals on- and off-target effects ... | Transcriptome Analysis | SRA2299560 | SUB15856034 | Salk Institute for Biological Studies | NaN |
| 496 | SRP550602 | SRX27031789 | GSM8675297: Parse sequencing, sublibrary14 (contains all samples); Homo sapiens; RNA-Seq | 9606 | Homo sapiens | RNA-Seq | TRANSCRIPTOMIC SINGLE CELL | cDNA | SRS23495520 | GSM8675297 | Illumina NovaSeq 6000 | 402856146 | 22774458184 | SRR31669096 | 402856146 | 29440332957 | GSM8675297_r1 | GSM8675297 | GSM8675297_r1 | GEO | Cells were collected on timepoint day using tubes pre-coated with bovine serum albumin (BSA). Ce... | GSM8675297 | ILLUMINA | SRS23495520 | SINGLE | SAMN45504277 | SRS23495520 | 29440332957 | NaN | Homo sapiens | GSM8675297 | Parse sequencing, sublibrary14 (contains all samples) | 9606 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | GSM8675297_r1 | 8512291111 | 6589996619 | 7157769385 | 284818 | 7179991024 | fastq | s3.us-east-1 | s3 | run | gs.us-east1 | gs | run | s3.us-east-1 | s3 | NaN | NaN | NaN | public | <Database><Table name="SEQUENCE"><Statistics source="meta"><Rows count="402856146" /><Elements c... | 1 | true | true | 2025-12-11 00:02:57 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-9/SRR31669096/lib14_barcode_head.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2025-03-29 06:11:45 | lib14_barcode_head.fastq.gz | aa218b4d9b87b94c8fc9b9c22b34d5c7 | fastq | 24277971671 | 0 | Original | NaN | 1 | anonymous | worldwide | AWS | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR31669096/SRR31669096 | anonymous | worldwide | NCBI | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos13/sra-pub-run-1330/SRR031/31669/SRR31669096/SRR... | gcp identity | gs.us-east1 | GCP | gs://sra-pub-run-112/SRR31669096/SRR31669096.1 | public | 2025-03-29 06:16:03 | SRR31669096 | 351a739016a10038d0187265bf44b9da | SRA Normalized | 22774460910 | 1 | Primary ETL | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos13/sra-pub-run-1330/SRR031/31669/SRR31669096/SRR... | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 1 | 29440332957 | false | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 29440332957 | 22774458184 | 1 | 402856146 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | source_name | MDA-MB-231 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | cell line | MDA-MB-231 | treatment | untreated, 1, 5, and 10 DPT | geo_loc_name | missing | collection_date | missing | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | SAMN45504277 | BioSample | XREF_LINK | DB: bioproject | ID: 1196449 | LABEL: PRJNA1196449 | Parse sequencing, sublibrary14 (contains all samples) | GSE283982 | NaN | NaN | GEO | GSE283982 | PRJNA1196449 | BioProject | NaN | NaN | NaN | Despite centuries of research, metastatic cancer remains incurable due to resistance against all... | Mismanagement of Cellular Iron Leads to Ferroptosis Susceptibility in Cancer Cells Surviving Che... | Transcriptome Analysis | SRA2031604 | SUB14921604 | Johns Hopkins School of Medicine | NaN |
| 497 | SRP550602 | SRX27031788 | GSM8675296: Parse sequencing, sublibrary13 (contains all samples); Homo sapiens; RNA-Seq | 9606 | Homo sapiens | RNA-Seq | TRANSCRIPTOMIC SINGLE CELL | cDNA | SRS23495521 | GSM8675296 | Illumina NovaSeq 6000 | 497060684 | 28361212693 | SRR31669097 | 497060684 | 36319936906 | GSM8675296_r1 | GSM8675296 | GSM8675296_r1 | GEO | Cells were collected on timepoint day using tubes pre-coated with bovine serum albumin (BSA). Ce... | GSM8675296 | ILLUMINA | SRS23495521 | SINGLE | SAMN45504278 | SRS23495521 | 36319936906 | NaN | Homo sapiens | GSM8675296 | Parse sequencing, sublibrary13 (contains all samples) | 9606 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | GSM8675296_r1 | 10495341086 | 8135525696 | 8849707306 | 349904 | 8839012914 | fastq | s3.us-east-1 | s3 | run | gs.us-east1 | gs | run | s3.us-east-1 | s3 | NaN | NaN | NaN | public | <Database><Table name="SEQUENCE"><Statistics source="meta"><Rows count="497060684" /><Elements c... | 1 | true | true | 2025-12-11 00:02:57 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-13/SRR31669097/lib13_barcode_head.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2025-03-31 10:57:53 | lib13_barcode_head.fastq.gz | b0d9ac5ab25618ec7516f8c1e02f58d5 | fastq | 29921660393 | 0 | Original | NaN | 1 | anonymous | worldwide | AWS | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR31669097/SRR31669097 | anonymous | worldwide | NCBI | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos13/sra-pub-run-1330/SRR031/31669/SRR31669097/SRR... | gcp identity | gs.us-east1 | GCP | gs://sra-pub-run-112/SRR31669097/SRR31669097.1 | public | 2025-03-31 11:03:20 | SRR31669097 | dbc56375e9075a583116092a10c8fe42 | SRA Normalized | 28361215417 | 1 | Primary ETL | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos13/sra-pub-run-1330/SRR031/31669/SRR31669097/SRR... | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 1 | 36319936906 | false | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 36319936906 | 28361212693 | 1 | 497060684 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | source_name | MDA-MB-231 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | cell line | MDA-MB-231 | treatment | untreated, 1, 5, and 10 DPT | geo_loc_name | missing | collection_date | missing | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | SAMN45504278 | BioSample | XREF_LINK | DB: bioproject | ID: 1196449 | LABEL: PRJNA1196449 | Parse sequencing, sublibrary13 (contains all samples) | GSE283982 | NaN | NaN | GEO | GSE283982 | PRJNA1196449 | BioProject | NaN | NaN | NaN | Despite centuries of research, metastatic cancer remains incurable due to resistance against all... | Mismanagement of Cellular Iron Leads to Ferroptosis Susceptibility in Cancer Cells Surviving Che... | Transcriptome Analysis | SRA2031604 | SUB14921604 | Johns Hopkins School of Medicine | NaN |
| 498 | SRP550602 | SRX27031787 | GSM8675295: Parse sequencing, sublibrary12 (contains all samples); Homo sapiens; RNA-Seq | 9606 | Homo sapiens | RNA-Seq | TRANSCRIPTOMIC SINGLE CELL | cDNA | SRS23495519 | GSM8675295 | Illumina NovaSeq 6000 | 336926390 | 18922275205 | SRR31669098 | 336926390 | 23469401146 | GSM8675295_r1 | GSM8675295 | GSM8675295_r1 | GEO | Cells were collected on timepoint day using tubes pre-coated with bovine serum albumin (BSA). Ce... | GSM8675295 | ILLUMINA | SRS23495519 | SINGLE | SAMN45504279 | SRS23495519 | 23469401146 | NaN | Homo sapiens | GSM8675295 | Parse sequencing, sublibrary12 (contains all samples) | 9606 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | GSM8675295_r1 | 6775591752 | 5253497667 | 5741403126 | 218736 | 5698689865 | fastq | s3.us-east-1 | s3 | run | gs.us-east1 | gs | run | s3.us-east-1 | s3 | NaN | NaN | NaN | public | <Database><Table name="SEQUENCE"><Statistics source="meta"><Rows count="336926390" /><Elements c... | 1 | true | true | 2025-12-11 00:02:57 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-10/SRR31669098/lib12_barcode_head.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2025-04-02 02:41:24 | lib12_barcode_head.fastq.gz | 1f0d5465d11ef1ceed460a7936442de6 | fastq | 19809364922 | 0 | Original | NaN | 1 | anonymous | worldwide | AWS | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR31669098/SRR31669098 | anonymous | worldwide | NCBI | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos13/sra-pub-run-1330/SRR031/31669/SRR31669098/SRR... | gcp identity | gs.us-east1 | GCP | gs://sra-pub-run-112/SRR31669098/SRR31669098.1 | public | 2025-04-02 02:43:22 | SRR31669098 | 6f34b6dc2758a444b6d948006eba46b8 | SRA Normalized | 18922277926 | 1 | Primary ETL | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos13/sra-pub-run-1330/SRR031/31669/SRR31669098/SRR... | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 1 | 23469401146 | false | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 23469401146 | 18922275205 | 1 | 336926390 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | source_name | MDA-MB-231 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | cell line | MDA-MB-231 | treatment | untreated, 1, 5, and 10 DPT | geo_loc_name | missing | collection_date | missing | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | SAMN45504279 | BioSample | XREF_LINK | DB: bioproject | ID: 1196449 | LABEL: PRJNA1196449 | Parse sequencing, sublibrary12 (contains all samples) | GSE283982 | NaN | NaN | GEO | GSE283982 | PRJNA1196449 | BioProject | NaN | NaN | NaN | Despite centuries of research, metastatic cancer remains incurable due to resistance against all... | Mismanagement of Cellular Iron Leads to Ferroptosis Susceptibility in Cancer Cells Surviving Che... | Transcriptome Analysis | SRA2031604 | SUB14921604 | Johns Hopkins School of Medicine | NaN |
| 499 | SRP550602 | SRX27031786 | GSM8675294: Parse sequencing, sublibrary11 (contains all samples); Homo sapiens; RNA-Seq | 9606 | Homo sapiens | RNA-Seq | TRANSCRIPTOMIC SINGLE CELL | cDNA | SRS23495518 | GSM8675294 | Illumina NovaSeq 6000 | 505514105 | 28194433444 | SRR31669099 | 505514105 | 35734129181 | GSM8675294_r1 | GSM8675294 | GSM8675294_r1 | GEO | Cells were collected on timepoint day using tubes pre-coated with bovine serum albumin (BSA). Ce... | GSM8675294 | ILLUMINA | SRS23495518 | SINGLE | SAMN45504280 | SRS23495518 | 35734129181 | NaN | Homo sapiens | GSM8675294 | Parse sequencing, sublibrary11 (contains all samples) | 9606 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | GSM8675294_r1 | 10333613109 | 7997336879 | 8700247020 | 344603 | 8702587570 | fastq | s3.us-east-1 | s3 | run | gs.us-east1 | gs | run | s3.us-east-1 | s3 | NaN | NaN | NaN | public | <Database><Table name="SEQUENCE"><Statistics source="meta"><Rows count="505514105" /><Elements c... | 1 | true | true | 2025-12-11 00:02:57 | Use Cloud Data Delivery | - | AWS | s3://sra-pub-src-16/SRR31669099/lib11_barcode_head.fastq.gz.1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | public | 2025-03-16 02:03:19 | lib11_barcode_head.fastq.gz | 6bc6f6ac5406ad0fcc6fc53ef0084be7 | fastq | 29922419271 | 0 | Original | NaN | 1 | anonymous | worldwide | AWS | https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR31669099/SRR31669099 | anonymous | worldwide | NCBI | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos13/sra-pub-run-1330/SRR031/31669/SRR31669099/SRR... | gcp identity | gs.us-east1 | GCP | gs://sra-pub-run-112/SRR31669099/SRR31669099.1 | public | 2025-03-16 02:09:35 | SRR31669099 | 7ed483556b367daf3b37f6c1a6ca86ba | SRA Normalized | 28194436165 | 1 | Primary ETL | https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos13/sra-pub-run-1330/SRR031/31669/SRR31669099/SRR... | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 1 | 35734129181 | false | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | 35734129181 | 28194433444 | 1 | 505514105 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | source_name | MDA-MB-231 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | cell line | MDA-MB-231 | treatment | untreated, 1, 5, and 10 DPT | geo_loc_name | missing | collection_date | missing | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | SAMN45504280 | BioSample | XREF_LINK | DB: bioproject | ID: 1196449 | LABEL: PRJNA1196449 | Parse sequencing, sublibrary11 (contains all samples) | GSE283982 | NaN | NaN | GEO | GSE283982 | PRJNA1196449 | BioProject | NaN | NaN | NaN | Despite centuries of research, metastatic cancer remains incurable due to resistance against all... | Mismanagement of Cellular Iron Leads to Ferroptosis Susceptibility in Cancer Cells Surviving Che... | Transcriptome Analysis | SRA2031604 | SUB14921604 | Johns Hopkins School of Medicine | NaN |
500 rows × 2059 columns
Filter and Explore Results¶
Let’s examine the unique studies and get an overview of the datasets:
[5]:
if not df.empty:
# Get unique GSE IDs (study accessions)
if "study_alias" in df.columns:
unique_studies = df["study_alias"].unique()
print(f"Number of unique studies (GSE IDs): {len(unique_studies)}")
print(f"\nUnique GSE IDs:\n{sorted(unique_studies)}")
# Display summary information
print(f"\n{'=' * 80}")
print("DATASET SUMMARY")
print(f"{'=' * 80}")
print(f"Total runs: {len(df)}")
if "sample_scientific_name" in df.columns:
print(f"\nOrganisms represented:")
print(df["sample_scientific_name"].value_counts())
if "experiment_library_strategy" in df.columns:
print(f"\nLibrary strategies:")
print(df["experiment_library_strategy"].value_counts())
else:
print("No results found. This could mean:")
print("1. No Parse Bioscience datasets match the date range")
print("2. The search query needs adjustment")
print("3. Try searching with a broader query or different date range")
Number of unique studies (GSE IDs): 56
Unique GSE IDs:
['GSE283982', 'GSE284207', 'GSE285843', 'GSE286901', 'GSE287852', 'GSE289845', 'GSE291674', 'GSE292745', 'GSE295359', 'GSE295527', 'GSE296244', 'GSE296547', 'GSE297023', 'GSE297299', 'GSE297427', 'GSE299005', 'GSE299409', 'GSE304456', 'GSE304995', 'GSE306046', 'GSE306096', 'GSE306228', 'GSE306684', 'GSE308009', 'GSE309220', 'GSE310800', 'GSE310825', 'GSE311574', 'GSE311802', 'GSE313958', 'GSE316120', 'GSE317479', 'GSE318002', 'GSE319345', 'GSE319472', 'GSE320334', 'GSE320427', 'GSE320507', 'GSE322713', 'GSE323336', 'GSE327199', 'GSE327212', 'GSE327907', 'GSE328442', 'GSE328823', 'GSE329418', 'GSE330122', 'GSE330123', 'GSE330222', 'GSE330837', 'GSE333415', 'GSE334463', 'GSE334840', 'GSE335423', 'GSE337539', 'GSE337989']
================================================================================
DATASET SUMMARY
================================================================================
Total runs: 500
Organisms represented:
sample_scientific_name
Homo sapiens 280
Mus musculus 175
Anableps anableps 8
Polypterus senegalus 8
Homo sapiens/Mus musculus xenograft 8
Rattus norvegicus 6
Peromyscus maniculatus bairdii 5
Peromyscus maniculatus nubiterrae 5
Drosophila melanogaster 2
Ovis aries 1
Bos taurus 1
Gallus gallus 1
Name: count, dtype: int64
Library strategies:
experiment_library_strategy
RNA-Seq 428
OTHER 58
ATAC-seq 14
Name: count, dtype: int64
Display Key Metadata¶
Let’s create a clean summary table with the most important information:
[6]:
if not df.empty:
# Select key columns for display
key_columns = [
"study_accession",
"study_alias",
"experiment_accession",
"sample_accession",
"sample_scientific_name",
"experiment_library_strategy",
"experiment_title",
"run_1_accession",
]
# Filter to only include columns that exist
available_columns = [col for col in key_columns if col in df.columns]
summary_df = df[available_columns].copy()
print("\nParse Bioscience Dataset Summary:")
print(f"{'=' * 80}\n")
display(summary_df.head(20)) # Show first 20 entries
if len(summary_df) > 20:
print(f"\n... and {len(summary_df) - 20} more entries")
Parse Bioscience Dataset Summary:
================================================================================
| study_accession | study_alias | experiment_accession | sample_accession | sample_scientific_name | experiment_library_strategy | experiment_title | run_1_accession | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 0 | SRP610788 | GSE306228 | SRX34653905 | SRS30216475 | Anableps anableps | RNA-Seq | GSM9927106: Sublibrary_9 from multiplexed Anableps retina samples; Anableps anableps; RNA-Seq | SRR39995784 |
| 1 | SRP610788 | GSE306228 | SRX34653904 | SRS30216474 | Anableps anableps | RNA-Seq | GSM9927105: Sublibrary_8 from multiplexed Anableps retina samples; Anableps anableps; RNA-Seq | SRR39995785 |
| 2 | SRP610788 | GSE306228 | SRX34653903 | SRS30216473 | Anableps anableps | RNA-Seq | GSM9927104: Sublibrary_7 from multiplexed Anableps retina samples; Anableps anableps; RNA-Seq | SRR39995786 |
| 3 | SRP610788 | GSE306228 | SRX34653902 | SRS30216472 | Anableps anableps | RNA-Seq | GSM9927103: Sublibrary_6 from multiplexed Anableps retina samples; Anableps anableps; RNA-Seq | SRR39995787 |
| 4 | SRP610788 | GSE306228 | SRX34653901 | SRS30216471 | Anableps anableps | RNA-Seq | GSM9927102: Sublibrary_5 from multiplexed Anableps retina samples; Anableps anableps; RNA-Seq | SRR39995788 |
| 5 | SRP610788 | GSE306228 | SRX34653900 | SRS30216470 | Anableps anableps | RNA-Seq | GSM9927101: Sublibrary_4 from multiplexed Anableps retina samples; Anableps anableps; RNA-Seq | SRR39995789 |
| 6 | SRP610788 | GSE306228 | SRX34653899 | SRS30216469 | Anableps anableps | RNA-Seq | GSM9927100: Sublibrary_3 from multiplexed Anableps retina samples; Anableps anableps; RNA-Seq | SRR39995790 |
| 7 | SRP610788 | GSE306228 | SRX34653898 | SRS30216468 | Anableps anableps | RNA-Seq | GSM9927099: Sublibrary_10 from multiplexed Anableps retina samples; Anableps anableps; RNA-Seq | SRR39995791 |
| 8 | SRP716323 | GSE337989 | SRX34210174 | SRS29818932 | Mus musculus | RNA-Seq | GSM9864251: Parse WT kit 5 samples; Mus musculus; RNA-Seq | SRR39517671 |
| 9 | SRP715301 | GSE337539 | SRX34171217 | SRS29783316 | Mus musculus | RNA-Seq | GSM9857608: Mayo 0549; Mus musculus; RNA-Seq | SRR39463256 |
| 10 | SRP715301 | GSE337539 | SRX34171216 | SRS29783315 | Mus musculus | RNA-Seq | GSM9857607: Mayo 0548; Mus musculus; RNA-Seq | SRR39463257 |
| 11 | SRP715301 | GSE337539 | SRX34171215 | SRS29783314 | Mus musculus | RNA-Seq | GSM9857606: Mayo 0547; Mus musculus; RNA-Seq | SRR39463258 |
| 12 | SRP715301 | GSE337539 | SRX34171214 | SRS29783313 | Mus musculus | RNA-Seq | GSM9857605: Mayo 0546; Mus musculus; RNA-Seq | SRR39463259 |
| 13 | SRP715301 | GSE337539 | SRX34171213 | SRS29783312 | Mus musculus | RNA-Seq | GSM9857604: Mayo 0545; Mus musculus; RNA-Seq | SRR39463260 |
| 14 | SRP715301 | GSE337539 | SRX34171212 | SRS29783311 | Mus musculus | RNA-Seq | GSM9857603: Mayo 0544; Mus musculus; RNA-Seq | SRR39463261 |
| 15 | SRP715301 | GSE337539 | SRX34171211 | SRS29783310 | Mus musculus | RNA-Seq | GSM9857602: Mayo 0543; Mus musculus; RNA-Seq | SRR39463262 |
| 16 | SRP715301 | GSE337539 | SRX34171210 | SRS29783309 | Mus musculus | RNA-Seq | GSM9857601: Mayo 0410; Mus musculus; RNA-Seq | SRR39463263 |
| 17 | SRP709670 | GSE335423 | SRX33895322 | SRS29552460 | Mus musculus | RNA-Seq | GSM9813471: Sublibrary 8; Mus musculus; RNA-Seq | SRR39151156 |
| 18 | SRP709670 | GSE335423 | SRX33895321 | SRS29552459 | Mus musculus | RNA-Seq | GSM9813470: Sublibrary 7; Mus musculus; RNA-Seq | SRR39151157 |
| 19 | SRP709670 | GSE335423 | SRX33895320 | SRS29552458 | Mus musculus | RNA-Seq | GSM9813469: Sublibrary 6; Mus musculus; RNA-Seq | SRR39151158 |
... and 480 more entries
Organize by Study (GSE)¶
Group the data by study to see how many samples/runs belong to each GSE:
[7]:
if not df.empty and "study_alias" in df.columns:
# Group by study and count entries
studies_summary = (
df.groupby("study_alias")
.agg(
{
"experiment_accession": "count",
"sample_scientific_name": lambda x: (
", ".join(x.unique()) if hasattr(x, "unique") else str(x.iloc[0])
),
"study_accession": "first",
}
)
.rename(
columns={
"experiment_accession": "num_experiments",
"sample_scientific_name": "organisms",
"study_accession": "SRP_accession",
}
)
.reset_index()
)
# Sort by number of experiments (descending)
studies_summary = studies_summary.sort_values("num_experiments", ascending=False)
print("\nStudy-level Summary:")
print(f"{'=' * 80}\n")
display(studies_summary)
Study-level Summary:
================================================================================
| study_alias | num_experiments | organisms | SRP_accession | |
|---|---|---|---|---|
| 49 | GSE330837 | 53 | Mus musculus | SRP700086 |
| 9 | GSE295527 | 52 | Homo sapiens | SRP581094 |
| 20 | GSE306096 | 27 | Homo sapiens | SRP610619 |
| 45 | GSE329418 | 25 | Homo sapiens | SRP695753 |
| 44 | GSE328823 | 16 | Homo sapiens | SRP694020 |
| 28 | GSE311802 | 16 | Mus musculus | SRP649734 |
| 12 | GSE297023 | 16 | Mus musculus | SRP584959 |
| 13 | GSE297299 | 16 | Homo sapiens | SRP585605 |
| 42 | GSE327907 | 16 | Homo sapiens | SRP691551 |
| 8 | GSE295359 | 15 | Homo sapiens | SRP580608 |
| 2 | GSE285843 | 14 | Homo sapiens | SRP556153 |
| 34 | GSE319472 | 12 | Homo sapiens | SRP676989 |
| 50 | GSE333415 | 12 | Mus musculus, Homo sapiens | SRP704119 |
| 38 | GSE322713 | 10 | Peromyscus maniculatus bairdii, Peromyscus maniculatus nubiterrae | SRP680596 |
| 40 | GSE327199 | 10 | Mus musculus | SRP689829 |
| 37 | GSE320507 | 9 | Homo sapiens | SRP679492 |
| 19 | GSE306046 | 8 | Homo sapiens | SRP610621 |
| 21 | GSE306228 | 8 | Anableps anableps | SRP610788 |
| 17 | GSE304456 | 8 | Homo sapiens | SRP606431 |
| 18 | GSE304995 | 8 | Mus musculus | SRP607663 |
| 43 | GSE328442 | 8 | Mus musculus | SRP693098 |
| 48 | GSE330222 | 8 | Homo sapiens | SRP698335 |
| 14 | GSE297427 | 8 | Homo sapiens/Mus musculus xenograft | SRP586001 |
| 16 | GSE299409 | 8 | Mus musculus | SRP591195 |
| 54 | GSE337539 | 8 | Mus musculus | SRP715301 |
| 53 | GSE335423 | 8 | Mus musculus | SRP709670 |
| 52 | GSE334840 | 8 | Homo sapiens | SRP708066 |
| 26 | GSE310825 | 8 | Mus musculus | SRP647341 |
| 39 | GSE323336 | 8 | Homo sapiens | SRP681042 |
| 24 | GSE309220 | 8 | Mus musculus | SRP627292 |
| 30 | GSE316120 | 8 | Polypterus senegalus | SRP661148 |
| 10 | GSE296244 | 7 | Homo sapiens | SRP582847 |
| 29 | GSE313958 | 6 | Homo sapiens | SRP656069 |
| 35 | GSE320334 | 6 | Bos taurus, Rattus norvegicus | SRP678991 |
| 0 | GSE283982 | 4 | Homo sapiens | SRP550602 |
| 1 | GSE284207 | 4 | Homo sapiens | SRP551283 |
| 47 | GSE330123 | 4 | Homo sapiens | SRP698070 |
| 33 | GSE319345 | 4 | Mus musculus | SRP676726 |
| 23 | GSE308009 | 3 | Mus musculus | SRP620345 |
| 15 | GSE299005 | 2 | Mus musculus | SRP589942 |
| 51 | GSE334463 | 2 | Drosophila melanogaster | SRP707097 |
| 41 | GSE327212 | 2 | Mus musculus | SRP689858 |
| 11 | GSE296547 | 2 | Homo sapiens | SRP583610 |
| 46 | GSE330122 | 2 | Homo sapiens | SRP698073 |
| 22 | GSE306684 | 2 | Mus musculus | SRP613829 |
| 7 | GSE292745 | 1 | Rattus norvegicus | SRP572670 |
| 6 | GSE291674 | 1 | Mus musculus | SRP569656 |
| 3 | GSE286901 | 1 | Homo sapiens | SRP557889 |
| 4 | GSE287852 | 1 | Homo sapiens | SRP559435 |
| 5 | GSE289845 | 1 | Mus musculus | SRP564833 |
| 36 | GSE320427 | 1 | Ovis aries | SRP679235 |
| 31 | GSE317479 | 1 | Mus musculus | SRP665997 |
| 25 | GSE310800 | 1 | Mus musculus | SRP647351 |
| 32 | GSE318002 | 1 | Gallus gallus | SRP670329 |
| 27 | GSE311574 | 1 | Homo sapiens | SRP649201 |
| 55 | GSE337989 | 1 | Mus musculus | SRP716323 |
Get Study Titles and Descriptions¶
Extract study titles to understand what each dataset is about:
[8]:
if not df.empty:
title_cols = [
col
for col in df.columns
if "study_title" in col.lower() or "study_abstract" in col.lower()
]
if title_cols and "study_alias" in df.columns:
# Get unique study information
study_info_cols = ["study_alias", "study_accession"] + title_cols
study_info_cols = [col for col in study_info_cols if col in df.columns]
study_info = df[study_info_cols].drop_duplicates(subset=["study_alias"])
print("\nStudy Titles and Descriptions:")
print(f"{'=' * 80}\n")
for idx, row in study_info.iterrows():
print(f"GSE: {row['study_alias']}")
print(f"SRP: {row['study_accession']}")
for col in title_cols:
if col in row and pd.notna(row[col]):
print(f"{col}: {row[col][:300]}...") # Truncate long descriptions
print(f"{'-' * 80}\n")
Study Titles and Descriptions:
================================================================================
GSE: GSE306228
SRP: SRP610788
study_study_abstract: The emergence of evolutionary novelties remains a central challenge in biology, particularly for complex organs such as the vertebrate eye. While visual systems have repeatedly undergone degeneration or loss, examples of innovation are rare and poorly understood. Mechanistic insight into such gains ...
study_study_title: Evolutionary remodeling of the ventral retina enables aerial vision in the four-eyed fish Anableps anableps...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE337989
SRP: SRP716323
study_study_abstract: If GEO accession GSE337989 has been cited in a publication, please notify us at [email protected] to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE337989 is currently private and is scheduled to be released on Jul 05, 2027....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE337539
SRP: SRP715301
study_study_abstract: If GEO accession GSE337539 has been cited in a publication, please notify us at [email protected] to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE337539 is currently private and is scheduled to be released on Jul 08, 2026....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE335423
SRP: SRP709670
study_study_abstract: If GEO accession GSE335423 has been cited in a publication, please notify us at [email protected] to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE335423 is currently private and is scheduled to be released on Dec 01, 2026....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE334840
SRP: SRP708066
study_study_abstract: If GEO accession GSE334840 has been cited in a publication, please notify us at [email protected] to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE334840 is currently private and is scheduled to be released on Jun 16, 2028....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE334463
SRP: SRP707097
study_study_abstract: If GEO accession GSE334463 has been cited in a publication, please notify us at [email protected] to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE334463 is currently private and is scheduled to be released on Jun 22, 2026....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE333415
SRP: SRP704119
study_study_abstract: If GEO accession GSE333415 has been cited in a publication, please notify us at [email protected] to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE333415 is currently private and is scheduled to be released on May 26, 2027....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE330837
SRP: SRP700086
study_study_abstract: If GEO accession GSE330837 has been cited in a publication, please notify us at [email protected] to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE330837 is currently private and is scheduled to be released on May 12, 2028....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE330222
SRP: SRP698335
study_study_abstract: If GEO accession GSE330222 has been cited in a publication, please notify us at [email protected] to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE330222 is currently private and is scheduled to be released on May 10, 2027....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE330122
SRP: SRP698073
study_study_abstract: If GEO accession GSE330122 has been cited in a publication, please notify us at [email protected] to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE330122 is currently private and is scheduled to be released on Jun 01, 2026....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE330123
SRP: SRP698070
study_study_abstract: If GEO accession GSE330123 has been cited in a publication, please notify us at [email protected] to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE330123 is currently private and is scheduled to be released on Jun 01, 2026....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE329418
SRP: SRP695753
study_study_abstract: If GEO accession GSE329418 has been cited in a publication, please notify us at [email protected] to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE329418 is currently private and is scheduled to be released on Apr 27, 2027....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE328823
SRP: SRP694020
study_study_abstract: If GEO accession GSE328823 has been cited in a publication, please notify us at [email protected] to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE328823 is currently private and is scheduled to be released on May 01, 2027....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE328442
SRP: SRP693098
study_study_abstract: If GEO accession GSE328442 has been cited in a publication, please notify us at [email protected] to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE328442 is currently private and is scheduled to be released on Jul 18, 2026....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE327907
SRP: SRP691551
study_study_abstract: If GEO accession GSE327907 has been cited in a publication, please notify us at [email protected] to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE327907 is currently private and is scheduled to be released on Apr 13, 2030....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE327212
SRP: SRP689858
study_study_abstract: If GEO accession GSE327212 has been cited in a publication, please notify us at [email protected] to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE327212 is currently private and is scheduled to be released on Apr 07, 2027....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE327199
SRP: SRP689829
study_study_abstract: If GEO accession GSE327199 has been cited in a publication, please notify us at [email protected] to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE327199 is currently private and is scheduled to be released on Apr 07, 2027....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE323336
SRP: SRP681042
study_study_abstract: If GEO accession GSE323336 has been cited in a publication, please notify us at [email protected] to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE323336 is currently private and is scheduled to be released on Mar 04, 2030....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE322713
SRP: SRP680596
study_study_abstract: If GEO accession GSE322713 has been cited in a publication, please notify us at [email protected] to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE322713 is currently private and is scheduled to be released on Mar 07, 2026....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE320507
SRP: SRP679492
study_study_abstract: If GEO accession GSE320507 has been cited in a publication, please notify us at [email protected] to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE320507 is currently private and is scheduled to be released on Mar 31, 2026....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE320427
SRP: SRP679235
study_study_abstract: The mammalian body plan is established during symmetry breaking and gastrulation. In ungulates and primates, these events occur within a flat embryonic disc and coincide with the developmental window most susceptible to pregnancy loss. Using the EvercodeTM Cell Fixation kit v2 (ECF2101, Parse Biosci...
study_study_title: A Single-Cell Transcriptomic Atlas of Symmetry Breaking in Sheep...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE320334
SRP: SRP678991
study_study_abstract: If GEO accession GSE320334 has been cited in a publication, please notify us at [email protected] to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE320334 is currently private and is scheduled to be released on Apr 01, 2026....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE319472
SRP: SRP676989
study_study_abstract: The goal of this analysis was to examine the impact of PA-X activity during infection in a model of the human airway epithelium, using primary airway cells from two different donors. We profiled the effects of infection and PA-X activity in various airway epithelial cell types. Donor H1: Male, 21, C...
study_study_title: scRNAseq analysis of human brochial epithelial cell air liquid interface cultures infected with the A/Perth/16/2009 H3N2 with and without PA-X...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE319345
SRP: SRP676726
study_study_abstract: To identify biomarkers of subpopulations of intrahepatic biliary epithelial cells, we performed single cell RNA-seq on adult biliary epithelial cells (BECs) and hybrid hepatocytes (HybHeps) from uninjured or cholestatic injured Sox9EGFP+ mice. After 7 days, the livers were dissociated to single cell...
study_study_title: Single cell RNA-seq of intrahepatic biliary epithelial cells following bile duct ligation....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE318002
SRP: SRP670329
study_study_abstract: Background: The trigeminal ganglion (TG) is a structure of the peripheral nervous system, composed of neuronal and non-neuronal cell types, that integrates sensory input from the face and jaw. The developing TG is derived from two embryonic cell populations: neural crest and cranial placode. Both po...
study_study_title: Cellular diversity of the developing chick trigeminal ganglion at single-cell resolution...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE317479
SRP: SRP665997
study_study_abstract: To investigate transcriptional changes in the heart induced by diet, we performed single-cell RNA sequencing on pooled mouse hearts from normal fat diet (NFD, 10% kcal fat) and high fat diet (HFD, 60% kcal fat) groups using the Parse Biosciences Evercode WT Mini v3 kit. Overall design: Whole hearts ...
study_study_title: Single-cell RNA sequencing of mouse hearts under normal fat diet and high fat diet conditions...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE316120
SRP: SRP661148
study_study_abstract: Comparative studies of vertebrate appendages offer a powerful framework for uncovering shared components of an ancestral regeneration toolkit. Here, we employed a multi-omics comparative approach leveraging the regenerative capacity of the axolotl, zebrafish, and Polypterus senegalus, a fish capable...
study_study_title: Comparative multi-omic analysis reveals conserved and derived mechanisms of fin and limb regeneration...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE284207
SRP: SRP551283
study_study_abstract: A longstanding barrier in genome engineering with CRISPR-Cas9 has been the inability to measure Cas9 edit outcomes at single-cell resolution. Here we present Superb-seq, a new technology for joint measurement of on-target and off-target Cas9 edits and transcriptomes by single-cell RNA sequencing. In...
study_study_title: Joint single-cell profiling of Cas9 edits and transcriptomes reveals on- and off-target effects on gene expression (Superb-seq)...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE311802
SRP: SRP649734
study_study_abstract: Loss-of-function mutations in genes encoding lysine methyltransferases (KMTs) and demethylases (KDMs) specific for trimethylated of lysine 4 of histone 3 (H3K4me3) are associated with neurodevelopmental conditions, including autism spectrum disorder and intellectual disability. To study the role of ...
study_study_title: Autism-like phenotypes and increased NMDAR2D expression in mice with KDM5B histone lysine demethylase deficiency...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE311574
SRP: SRP649201
study_study_abstract: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) cells exist on a spectrum of epithelial (E) and quasimesenchymal (QM) transcriptional states with differences in sensitivity to FOLFIRINOX (FFX). GSK-3b is a key regulator PDAC cell epithelial-to-mesenchymal transition (EMT). Here, we performed in vitro analys...
study_study_title: Therapeutic Targeting of Epithelial Mesenchymal Cellular Plasticity in Pancreatic Cancer...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE310800
SRP: SRP647351
study_study_abstract: The vertebrate forelimb initiates as a localized swelling in the somatic lateral plate mesoderm (somatic LPM) in response to Tbx5-dependent transcription. The molecular pathways driving limb morphogenesis have been extensively studied but the steps directly preceding limb bud formation remain poorly...
study_study_title: Developmental and transcriptional programs that define the initiation of the forelimb...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE310825
SRP: SRP647341
study_study_abstract: The vertebrate forelimb initiates as a localized swelling in the somatic lateral plate mesoderm (somatic LPM) in response to Tbx5-dependent transcription. The molecular pathways driving limb morphogenesis have been extensively studied but the steps directly preceding limb bud formation remain poorly...
study_study_title: Developmental and transcriptional programs that define the initiation of the forelimb II...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE309220
SRP: SRP627292
study_study_abstract: If GEO accession GSE309220 has been cited in a publication, please notify us at [email protected] to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE309220 is currently private and is scheduled to be released on Dec 31, 2026....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE308009
SRP: SRP620345
study_study_abstract: Aging or injury to the joints can lead to cartilage degeneration osteoarthritis (OA), for which there are limited effective treatments. We found that expression of the gerozyme 15-Prostaglandin Dehydrogenase (15-PGDH) was increased in the articular cartilage of aged or injured mice. Both systemic an...
study_study_title: Inhibition of the Gerozyme 15-Prostaglandin Dehydrogenase Promotes Articular Cartilage Regeneration in Osteoarthritis due to Injury or Aging [scRNA-Seq]...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE306684
SRP: SRP613829
study_study_abstract: If GEO accession GSE306684 has been cited in a publication, please notify us at [email protected] to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE306684 is currently private and is scheduled to be released on Aug 31, 2026....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE306046
SRP: SRP610621
study_study_abstract: Single-cell transcriptomics (SCTr) offers a powerful platform for decoding the complexities of cellular stress responses to chemical exposures, capturing rare and transient subpopulations that can be obscured in bulk measurements. This study employs SCTr to profile the responses of HepaRG liver cell...
study_study_title: Decoding cellular stress states for toxicology using single-cell transcriptomics [scRNA-Seq]...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE306096
SRP: SRP610619
study_study_abstract: Liver fibrosis is a severe disease with few treatment options due to the poor quality of the available animal and in vitro models. To address this, human hepatic organoids were grown in microwells (i.e., microHOs) to provide a robust, live cell imaging platform for serially evaluating the anti-fibro...
study_study_title: AI-assisted Drug Re-purposing for Human Liver Fibrosis...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE304995
SRP: SRP607663
study_study_abstract: If GEO accession GSE304995 has been cited in a publication, please notify us at [email protected] to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE304995 is currently private and is scheduled to be released on Aug 07, 2026....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE304456
SRP: SRP606431
study_study_abstract: If GEO accession GSE304456 has been cited in a publication, please notify us at [email protected] to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE304456 is currently private and is scheduled to be released on Mar 31, 2026....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE299409
SRP: SRP591195
study_study_abstract: We used single-cell RNA sequencing with the Evercode™ WT kit (Parse Biosciences) to profile kidney immune cells in a mouse model of ischemia-reperfusion injury (IRI), with or without treatment with the SYK inhibitor Entospletinib. The dataset captures immune dynamics at early and late stages of inju...
study_study_title: Effect of the SYK Inhibitor Entospletinib on Renal Inflammation and the Transition from Acute Kidney Injury to Chronic Kidney Disease Induced by Ischemia-Reperfusion Injury...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE299005
SRP: SRP589942
study_study_abstract: Neuropsychiatric complications including depression and cognitive decline develop in the years after traumatic brain injury (TBI), negatively affecting quality of life. Microglial and type 1 interferon (IFN-I) responses are associated with the transition from acute to chronic neuroinflammation after...
study_study_title: Impaired cortical neuronal homeostasis and cognition after diffuse traumatic brain injury are dependent on microglia and type I interferon responses...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE297427
SRP: SRP586001
study_study_abstract: Osteosarcoma (OSA) has a dismal prognosis despite surgical resection and multiagent chemotherapy. While adoptive natural killer (NK) cell therapies have been successful in hematological malignancies, the application in solid tumors is challenging due to a tumor microenvironment (TME) that impairs NK...
study_study_title: CXCL10-induced chemotaxis of ex vivo-expanded natural killer cells combined with NKTR-255 enhances anti-tumor efficacy in osteosarcoma...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE297299
SRP: SRP585605
study_study_abstract: Chemotherapy resistance remains a critical barrier in cancer treatment, partly driven by polyploid cells that survive therapy and contribute to tumor recurrence. Here, we investigated epigenomic and transcriptional changes associated with cisplatin-surviving polyploid cells compared to parental canc...
study_study_title: Polyploid cisplatin-resistant cancer cells have altered nuclear organization and epigenomic status...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE297023
SRP: SRP584959
study_study_abstract: Most cancers are diagnosed in people over the age of sixty, but little is known about how age impacts tumorigenesis. While aging is accompanied by mutation accumulation — widely understood to contribute to cancer risk — it is also associated with numerous other cellular and molecular changes likely ...
study_study_title: Aging represses oncogenic KRAS-driven lung tumorigenesis and alters tumor suppression...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE296547
SRP: SRP583610
study_study_abstract: Human early embryos develop under physiological hypoxia, but how hypoxia regulates human lung organogenesis remains little known. We have investigated oxygen availability effects on the human lung epithelium using organoids. We find first-trimester lung epithelial progenitors remain undifferentiated...
study_study_title: Hypoxia promotes airway differentiation in the human lung epithelium [scRNAseq_hypoxia_AT2]...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE296244
SRP: SRP582847
study_study_abstract: A novel, cost-effective nucleic acid (NA) isolation method for purifying total NA, DNA, or RNA from both two- and three-dimensional cell cultures has been developed at the Norwegian University of Science and Technology utilizing NAxtra magnetic nanoparticles. This method achieves comparable yields t...
study_study_title: Rapid DNA and RNA isolation from few or single cells using low-cost NAxtra magnetic nanoparticles...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE295527
SRP: SRP581094
study_study_abstract: The rapid development of updated and new commercially available single-cell transcriptomics platforms is providing a range of experimental options. Cost, sensitivity, throughput, flexibility, and ease of use influence that selection. We performed a comprehensive comparison of single-cell transcrip...
study_study_title: Evaluating the practical aspects and performance of commercial single-cell RNA sequencing technologies...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE295359
SRP: SRP580608
study_study_abstract: Alloreactive T cells mediate graft-versus-leukemia (GvL) reactions and acute graft-versus-host disease (aGvHD) in AML patients following allogeneic hematopoietic stem cell transplantation. To investigate biomarkers that identify alloreactive T cells associated with either beneficial GvL or detriment...
study_study_title: Mega-scale single-cell profiling reveals novel biomarkers associated with acute GvHD after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE292745
SRP: SRP572670
study_study_abstract: Cerebral hemodynamics are crucial for brain homeostasis and serve as a key proxy for brain activity. Although this process involves coordinated interaction between vessels, neurons and glial cells, its dysregulation in neuroinflammation is not well understood. We used in vivo mesoscopic functional u...
study_study_title: Induction of hemodynamic traveling waves by glial-driven vasomotion in a rat model of neuroinflammation: implications for functional neuroimaging...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE291674
SRP: SRP569656
study_study_abstract: Loss-of-function variants of the ABCA7 gene are associated with the increased risk of Alzheimer's disease (AD). How neuronal ABCA7 contributes to AD pathogenesis is unknown. Using neuron-specific Abca7 knockout mice (nAbca7-/-) with or without 5×FAD amyloid model background and postmortem AD brains,...
study_study_title: Neuronal ABCA7 deficiency aggravates mitochondrial dysfunction and neurodegeneration in Alzheimer's disease [5xFAD_snRNAseq]...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE289845
SRP: SRP564833
study_study_abstract: We performed single cell sequencing using the Parse Biosciences WT kit to evaluate changes in dendritic cell populations following induction of experimental autoimmune encephalomyelitis. Mice in this experiment previously received CD8+ T cells from donor mice that had been immunized with PLP178-191 ...
study_study_title: Myelin-reactive CD8+ T cells influence conventional dendritic cell subsets towards a mature and regulatory phenotype in experimental autoimmune encephalomyelitis...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE287852
SRP: SRP559435
study_study_abstract: Transcription factor (TF) screens have enabled efficient production of a few cell types; however, engineering cell types that require complex TF combinations remains challenging. Here, we report an iterative, high-throughput single-cell TF screening method that enables identification of TF combinati...
study_study_title: Iterative transcription factor screening enables rapid generation of microglia-like cells from human iPSC -Single cell transcriptome timecourse analysis of TFiMGLs after SCF-MCI (SPI1, FLI1, CEBPA, CEBPB, IRF8, and Mef2C) induction....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE286901
SRP: SRP557889
study_study_abstract: If GEO accession GSE286901 has been cited in a publication, please notify us at [email protected] to initiate the public release of associated data....
study_study_title: GEO accession GSE286901 is currently private and is scheduled to be released on Mar 10, 2026....
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE285843
SRP: SRP556153
study_study_abstract: Single-cell RNA sequencing technologies provide insights into gene expression at the cellular level, enabling detailed analysis of cellular heterogeneity. In this study, we systematically compared two scRNA-seq platforms—10X Genomics and Parse Biosciences—using human peripheral blood mononuclear cel...
study_study_title: Systematic Comparison of 10X Genomics and Parse Single Cell RNA Technologies across PBMC and CD8+ TEMRA Cells...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE313958
SRP: SRP656069
study_study_abstract: A longstanding barrier in genome engineering with CRISPR-Cas9 has been the inability to characterize editing outcomes at single-cell resolution. We present "Superb-seq", a new scRNA-seq method that measures on-target and off-target genome edits and associated transcriptomes. In contrast to Perturb-s...
study_study_title: Joint single-cell profiling of Cas9 edits and transcriptomes reveals on- and off-target effects on gene expression (RNA-seq)...
--------------------------------------------------------------------------------
GSE: GSE283982
SRP: SRP550602
study_study_abstract: Despite centuries of research, metastatic cancer remains incurable due to resistance against all conventional cancer therapeutics. Alternative strategies leveraging non-proliferative vulnerabilities in cancer are required to overcome cancer recurrence. Ferroptosis is an iron dependent cell death pat...
study_study_title: Mismanagement of Cellular Iron Leads to Ferroptosis Susceptibility in Cancer Cells Surviving Chemotherapy...
--------------------------------------------------------------------------------
Save Results¶
Save the complete results to a file for further analysis:
[9]:
if not df.empty:
# Save full results
output_file = "parse_bioscience_datasets.tsv"
df.to_csv(output_file, sep="\t", index=False)
print(f"Full results saved to: {output_file}")
# Also save the study-level summary
if "studies_summary" in locals():
summary_file = "parse_bioscience_studies_summary.tsv"
studies_summary.to_csv(summary_file, sep="\t", index=False)
print(f"Study summary saved to: {summary_file}")
print(f"\nTotal datasets found: {len(df)}")
print(
f"Total unique studies: {len(unique_studies) if 'unique_studies' in locals() else 'N/A'}"
)
Full results saved to: parse_bioscience_datasets.tsv
Study summary saved to: parse_bioscience_studies_summary.tsv
Total datasets found: 500
Total unique studies: 56
Alternative Search Strategies¶
Since Parse Bioscience datasets might not always explicitly mention “Parse Bioscience” in metadata, here are alternative search strategies:
1. Search for SPLiT-seq (Parse’s technology)¶
Parse Biosciences uses SPLiT-seq (split-pool ligation-based transcriptome sequencing) technology.
[10]:
# Search for SPLiT-seq technology
print("Searching for SPLiT-seq / combinatorial indexing datasets...")
print("This may include Parse Bioscience and similar technologies.\n")
split_seq_instance = GeoSearch(
verbosity=2,
return_max=100,
geo_query="SPLiT-seq OR split-seq OR combinatorial indexing single cell",
)
split_seq_instance.search()
split_seq_df = split_seq_instance.get_df()
if not split_seq_df.empty:
print(f"Found {len(split_seq_df)} entries with SPLiT-seq/combinatorial indexing")
if "study_alias" in split_seq_df.columns:
split_seq_studies = split_seq_df["study_alias"].unique()
print(f"Unique studies: {len(split_seq_studies)}")
print(f"\nGSE IDs: {sorted(split_seq_studies)}")
# Show organisms
if "sample_scientific_name" in split_seq_df.columns:
print(f"\nOrganisms:")
print(split_seq_df["sample_scientific_name"].value_counts())
else:
print("No results found with SPLiT-seq search")
# You can also try other search terms
print("\n" + "=" * 80)
print("Other useful search terms for Parse/single-cell datasets:")
print("- 'Parse Evercode' (Parse's platform name)")
print("- 'combinatorial barcoding'")
print("- Specific organisms: 'Parse Bioscience Homo sapiens'")
print("=" * 80)
Searching for SPLiT-seq / combinatorial indexing datasets...
This may include Parse Bioscience and similar technologies.
Found 100 entries with SPLiT-seq/combinatorial indexing
================================================================================
Other useful search terms for Parse/single-cell datasets:
- 'Parse Evercode' (Parse's platform name)
- 'combinatorial barcoding'
- Specific organisms: 'Parse Bioscience Homo sapiens'
================================================================================
Command Line Usage¶
You can also perform this search from the command line:
## # Basic search for Parse Bioscience datasets
pysradb search --db geo \
--geo-query "Parse Bioscience" \
--max 500 \
--verbosity 3 \
--saveto parse_bioscience_results.tsv
## # Search for SPLiT-seq technology
pysradb search --db geo \
--geo-query "SPLiT-seq OR split-seq" \
--max 200 \
--verbosity 2 \
--saveto split_seq_results.tsv
## # Search with organism filter
pysradb search --db geo \
--geo-query "Parse Bioscience" \
--organism "Homo sapiens" \
--max 200 \
--saveto parse_human_results.tsv
## # Note: Date filtering can be added with --publication-date flag
## # but may miss some results due to how GEO indexes publication dates
## # Example: --publication-date 01-01-2020:31-12-2024